New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 393245 = | 87 (0.880) | 8 (0.090) | 6/142 | NT | 10.0% | coding (235/567 nt) | USA300HOU_RS01800 | NAD(P)H‑dependent FAD/FMN reductase |
? | USA300TCH1516_ALE | 393281 = | 66 (0.760) | coding (271/567 nt) | USA300HOU_RS01800 | NAD(P)H‑dependent FAD/FMN reductase |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TATAAATTAACGACGTCGTTAATGCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGTGACAAGGTAATAGGACTTGTAGCGACAGCAGGTTCTAGTAAACATTATTTAATTCCTG > USA300TCH1516_ALE/393191‑393371 | tataAATTAACGACGTCGTTAATGCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAAtg < 1:310461/91‑1 (MQ=255) ataAATTAACGACGTCGTTAATGCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAAtgt > 1:3772827/1‑91 (MQ=255) ataAATTAACGACGTCGTTAATGCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAAtgt > 1:2026002/1‑91 (MQ=255) ataAATTAACGACGTCGTTAATGCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAAtgt > 1:2640595/1‑91 (MQ=255) cgacgTCGTTAATGCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCt > 1:1945906/1‑91 (MQ=255) cgacgTCGTTAATGCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCt > 1:800153/1‑91 (MQ=255) 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aTGCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCa > 1:3592085/1‑91 (MQ=255) tGCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCaa < 1:396304/91‑1 (MQ=255) gCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAAt < 1:1082574/91‑1 (MQ=255) gCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAAt < 1:315089/91‑1 (MQ=255) gCAGGCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAAt < 1:3783659/91‑1 (MQ=255) ggCTGATGTGATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCg > 1:137003/1‑91 (MQ=255) tgtgATTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGt > 1:3797206/1‑91 (MQ=255) aTTTTTATTGGTTTTCCAATTTTTCAAGCTTCCATCCCTGGTGCTTTGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGTGACa < 1:2325239/91‑1 (MQ=255) 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tttGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGTGACAAGGTAATAGGACTTGTAGCGACAGCAGGTTCTAGTAAACattat < 1:1196512/91‑1 (MQ=255) tttGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGTGACAAGGTAATAGGACTTGTAGCGACAGCAGGTTCTAGTAAACattat < 1:1515160/91‑1 (MQ=255) tttGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGTGACAAGGTAATAGGACTTGTAGCGACAGCAGGTTCTAGTAAACattat < 1:2422755/91‑1 (MQ=255) tttGAAAAATGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGTGACAAGGTAATAGGACTTGTAGCGACAGCAGGTTCTAGTAAACattat < 1:1009591/91‑1 (MQ=255) ttgaaaaatGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGTGACAAGGTAATAGGACTTGTAGCGACAGCAGGTTCTAGTAAACattatt > 1:3993886‑M2/10‑91 (MQ=255) ttgaaaaatGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGTGACAAGGTAATAGGACTTGTAGCGACAGCAGGTTCTAGTAAACattatt < 1:1118710‑M2/82‑1 (MQ=255) gaaaaatGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGTGACAAGGTAATAGGACTTGTAGCGACAGCAGGTTCTAGTAAACATTATTTa < 1:1809246‑M2/84‑1 (MQ=255) aaatGTGTTTGATCTACTTCCAGTCAATGCGTTTCGTGACAAGGTAATAGGACTTGTAGCGACAGCAGGTTCTAGTAAACATTATTTAAtt > 1:2106878‑M2/5‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |