New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 433374 = | 104 (1.060) | 6 (0.070) | 4/132 | NT | 7.6% | intergenic (‑783/+194) | tcyP/USA300HOU_RS02040 | L‑cystine uptake protein TcyP/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 433453 = | 61 (0.750) | intergenic (‑862/+115) | tcyP/USA300HOU_RS02040 | L‑cystine uptake protein TcyP/hypothetical protein |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ATAATTAAAAAACCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTAT > USA300TCH1516_ALE/433366‑433543 | ataatTAAAAAACCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGa > 1:1426886/1‑91 (MQ=255) aatTAAAAAACCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAAt > 1:388142/1‑91 (MQ=255) aaaaaCCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGt < 1:3698432/91‑1 (MQ=255) AAAACCTGACACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTa > 1:2333842‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAACCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTa < 1:535002‑M1/91‑1 (MQ=255) AACCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTAtt < 1:1711715‑M1/91‑1 (MQ=255) AACCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTAtt < 1:1711258‑M1/91‑1 (MQ=255) AACCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTAtt < 1:3993746‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTa > 1:236337‑M1/1‑91 (MQ=255) ACCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTa > 1:1368503‑M1/1‑91 (MQ=255) CTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTaaa < 1:207137‑M1/91‑1 (MQ=255) TGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAAt < 1:23215‑M1/91‑1 (MQ=255) gaaacaagctgatatactccattcaatatctactttgaagagagcatatcaaactaatttgtttcaggttttATGAATTGAGTATTAAAtt > 1:1711742‑M2/73‑91 (MQ=255) AAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAAttt < 1:1384069‑M1/91‑1 (MQ=255) ACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGa > 1:2970963‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGaaa > 1:2866614‑M1/1‑91 (MQ=255) agctgatatactccattcaatatctactttgaagagagcatatcaaactaatttgtttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAg > 1:23577‑M2/67‑91 (MQ=255) aTTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGt > 1:3781206/1‑91 (MQ=255) aTTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGt > 1:2759668/1‑91 (MQ=255) ttAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTa > 1:1454221/1‑91 (MQ=255) ttAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTa > 1:3118375/1‑91 (MQ=255) gATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACa > 1:852234/1‑91 (MQ=255) gATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACa > 1:209653/1‑91 (MQ=255) gATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACa > 1:2153516/1‑91 (MQ=255) ctccattcaatatctactttgaagagagcatatcaaactaatttgtttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAg > 1:3808530‑M2/57‑91 (MQ=255) ctccattcaatatctactttgaagagagcatatcaaactaatttgtttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAg > 1:3919907‑M2/57‑91 (MQ=255) ctccattcaatatctactttgaagagagcatatcaaactaatttgtttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAg > 1:573515‑M2/57‑91 (MQ=255) ctctctTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCta > 1:3627741/1‑91 (MQ=255) ctctctTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCta > 1:3628111/1‑91 (MQ=255) ctctctTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCta > 1:2232054/1‑91 (MQ=255) ctctctTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCta > 1:3158412/1‑91 (MQ=255) ctctTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCtata < 1:753320/91‑1 (MQ=255) tctTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAg > 1:3654225/1‑91 (MQ=255) tCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGtt < 1:898867/91‑1 (MQ=255) tCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGtt < 1:2321188/91‑1 (MQ=255) cAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGttt < 1:2890106/91‑1 (MQ=255) aaaGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTta > 1:3267121/1‑91 (MQ=255) aaGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTtat > 1:498930/1‑91 (MQ=255) aGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTtata > 1:1040290/1‑91 (MQ=255) gTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATaa < 1:1024327/91‑1 (MQ=255) aGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATtaaa < 1:2274291/91‑1 (MQ=255) aGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATaaaa < 1:2639411/91‑1 (MQ=255) gATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATaaaaa < 1:3578361/91‑1 (MQ=255) gATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATaaaaa > 1:3105857/1‑91 (MQ=255) gATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATaaaaa > 1:4022979/1‑91 (MQ=255) atatTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAt > 1:2122474/1‑91 (MQ=255) atatTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAt > 1:1601691/1‑91 (MQ=255) atTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCa > 1:2675180/1‑91 (MQ=255) ttGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAg < 1:2280714/91‑1 (MQ=255) ttGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAg < 1:2280659/91‑1 (MQ=255) ttGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAg < 1:2280575/91‑1 (MQ=255) ttGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAg < 1:2887886/91‑1 (MQ=255) aaTGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGttt > 1:797947/1‑91 (MQ=255) aGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTaaa > 1:218976/1‑91 (MQ=255) gTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAAt > 1:562938/1‑91 (MQ=255) gTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAAt > 1:562802/1‑91 (MQ=255) gTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAAt < 1:2435654/91‑1 (MQ=255) gTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAAt < 1:2435617/91‑1 (MQ=255) gTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAAt > 1:2361047/1‑91 (MQ=255) gTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAAt > 1:1798468/1‑91 (MQ=255) gTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAGCAGTTTTTAAAt < 1:3817249/91‑1 (MQ=255) tataTCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATc > 1:1720028/1‑91 (MQ=255) tataTCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATc < 1:2259813/91‑1 (MQ=255) tataTCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATc < 1:1907328/91‑1 (MQ=255) atatCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCa > 1:893478/1‑91 (MQ=255) atatCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCa < 1:1773035/91‑1 (MQ=255) atatCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCa < 1:3199077/91‑1 (MQ=255) atatCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCa < 1:1773284/91‑1 (MQ=255) atatCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCa < 1:1773286/91‑1 (MQ=255) tatCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCaa > 1:2844881/1‑91 (MQ=255) tatCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCaa > 1:967447/1‑91 (MQ=255) tatCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCaa > 1:2643415/1‑91 (MQ=255) atCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCaaa < 1:1304159/91‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAg < 1:774916/91‑1 (MQ=255) gCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGATTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCta < 1:2817019/91‑1 (MQ=255) gCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCta > 1:3934700/1‑91 (MQ=255) gCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCta < 1:1510811/91‑1 (MQ=255) cTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCtat < 1:1807538/91‑1 (MQ=255) cTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCtat > 1:2520744/1‑91 (MQ=255) ttgtttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCtata < 1:4055590‑M2/77‑1 (MQ=255) ttgtttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCtata < 1:91329‑M2/77‑1 (MQ=255) tgtttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCtatat < 1:3747489‑M2/78‑1 (MQ=255) tgtttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCtatat < 1:3747518‑M2/78‑1 (MQ=255) tgtgtcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCtatat < 1:3210868‑M2/78‑1 (MQ=255) gtttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCtatata < 1:2871297‑M2/79‑1 (MQ=255) tttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTatatat > 1:642507‑M2/12‑91 (MQ=255) tttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTatatat > 1:1038565‑M2/12‑91 (MQ=255) tttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTatatat > 1:1599878‑M2/12‑91 (MQ=255) tttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTatatat > 1:1092230‑M2/12‑91 (MQ=255) ttcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATg > 1:2803049‑M2/11‑91 (MQ=255) tcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGa > 1:3647449‑M2/10‑91 (MQ=255) tcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGa > 1:3430711‑M2/10‑91 (MQ=255) tcaggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGa < 1:1295940‑M2/82‑1 (MQ=255) aggttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAAt < 1:6227‑M2/84‑1 (MQ=255) gttttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTg < 1:2410989‑M2/86‑1 (MQ=255) ttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGt > 1:4014629‑M2/3‑91 (MQ=255) ttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGt < 1:324660‑M2/89‑1 (MQ=255) ttATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGt > 1:1838422‑M2/3‑91 (MQ=255) tATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTa > 1:713240‑M2/2‑91 (MQ=255) aTGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTAt < 1:146374/91‑1 (MQ=255) | ATAATTAAAAAACCTGAAACAAATTAGTTTGATATGCTCTCTTCAAAGTAGATATTGAATGGAGTATATCAGCTTGTTTCAGGTTTTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTAT > USA300TCH1516_ALE/433366‑433543 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |