New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 584527 = | 96 (0.980) | 6 (0.070) | 4/150 | NT | 6.5% | coding (340/501 nt) | rplJ | 50S ribosomal protein L10 |
? | USA300TCH1516_ALE | 584580 = | 82 (0.890) | coding (393/501 nt) | rplJ | 50S ribosomal protein L10 |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
AGATCATGAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGGAGAACAAA > USA300TCH1516_ALE/584490‑584668 | aGATCATGAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTca > 1:1243133/1‑91 (MQ=255) cATGAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACg > 1:3830233/1‑91 (MQ=255) aTGAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGa < 1:448903/91‑1 (MQ=255) aTGAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGa > 1:1435245/1‑91 (MQ=255) aTGAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTACGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGa < 1:554571/91‑1 (MQ=255) tGAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCGATGTTATTACAGCTGAAGAAGTTAAAAATGTTGGTTCATTACCTTCACACGAt > 1:3853935/1‑91 (MQ=255) tGAAGCAGTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGAt < 1:3889195/91‑1 (MQ=255) gAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATg < 1:3482081/91‑1 (MQ=255) gAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATg < 1:2028644/91‑1 (MQ=255) gAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATg < 1:3007533/91‑1 (MQ=255) gAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATg < 1:3994962/91‑1 (MQ=255) aaGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATgg > 1:2326220/1‑91 (MQ=255) aaGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATgg > 1:573666/1‑91 (MQ=255) aTTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCtt > 1:4058604/1‑91 (MQ=255) aTTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCtt > 1:4058702/1‑91 (MQ=255) gAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCCTTACCTTCACACGATGGTCTTGTAt > 1:3849880/1‑91 (MQ=255) gAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTAt > 1:2888842/1‑91 (MQ=255) gAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTAt < 1:155165/91‑1 (MQ=255) gAAATTAAATCACGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTAt > 1:3176790/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAATCAGGCGTTATGGAAGGGAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATc < 1:3869065/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATc < 1:2263905/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATc > 1:3245567/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATc > 1:700553/1‑91 (MQ=255) aaTTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCt > 1:3724172/1‑91 (MQ=255) aaTTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCt > 1:3724323/1‑91 (MQ=255) aaTTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCt > 1:3724331/1‑91 (MQ=255) aTTAAGTCAGGCGTTATGGAAGGCATTGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACGGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTa < 1:3860969/91‑1 (MQ=255) aTTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTa > 1:2887236/1‑91 (MQ=255) aaaTCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGc > 1:3202500/1‑91 (MQ=255) aaaTCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGc > 1:1623580/1‑91 (MQ=255) aaaTCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGc < 1:3827607/91‑1 (MQ=255) aTCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCtt > 1:3423859/1‑91 (MQ=255) ggCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTAt > 1:1351029/1‑91 (MQ=255) ggCGTTATGGAAGGCAACGTTATAACCGCAGAAGCAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACCCGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTAt > 1:1874478/1‑91 (MQ=255) gCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATc > 1:925283/1‑91 (MQ=255) gTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAg < 1:642208/91‑1 (MQ=255) ttATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGt < 1:3639656/91‑1 (MQ=255) ttATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGt < 1:3639279/91‑1 (MQ=255) agggAAGGCAAGGTGAGTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGGATCTATGCTTTTATCAGTAt < 1:187975/89‑1 (MQ=255) aTGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTAt > 1:3127552/1‑91 (MQ=255) tGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTAtt > 1:3213668/1‑91 (MQ=255) ggAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTa < 1:1284598/91‑1 (MQ=255) aaggtaatgaaccaacagttttaacttcttctgctgtaataacattgccttcACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACa > 1:3773891‑M2/53‑91 (MQ=255) AGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACaa > 1:2639154‑M1/1‑91 (MQ=255) GGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAg > 1:1785174‑M1/1‑91 (MQ=255) GGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAg > 1:3605720‑M1/1‑91 (MQ=255) GGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAg < 1:2126023‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGc > 1:1084709‑M1/1‑91 (MQ=255) taatgaaccaacagttttaacttcttctgctgtaataacattgccttcACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCt > 1:3956583‑M2/49‑91 (MQ=255) aatgaaccaacagttttaacttcttctgctgtaataacattgccttcACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTc > 1:4114636‑M2/48‑91 (MQ=255) aaTGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTc > 1:100917/1‑91 (MQ=255) aaTGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTc > 1:2177891/1‑91 (MQ=255) aaTGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTc > 1:2177913/1‑91 (MQ=255) aaTGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTc > 1:100968/1‑91 (MQ=255) atgaaccaacagttttaacttcttctgctgtaataacattgccttcACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTcc > 1:1416297‑M2/47‑91 (MQ=255) aTGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTcc > 1:626931/1‑91 (MQ=255) gTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTg < 1:374046/91‑1 (MQ=255) ttattaCAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGt > 1:130230/1‑91 (MQ=255) ttattaCAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGt > 1:130291/1‑91 (MQ=255) tattaCAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTa < 1:4055237/91‑1 (MQ=255) tattaCAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTa > 1:3706202/1‑91 (MQ=255) attaCAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGATCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTAc < 1:3602325/91‑1 (MQ=255) ttaCAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACg < 1:619702/91‑1 (MQ=255) aCAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCa < 1:3955334/91‑1 (MQ=255) agcagAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAAc < 1:691550/91‑1 (MQ=255) agcagAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAAc < 1:691712/91‑1 (MQ=255) agcagAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAAc < 1:2425876/91‑1 (MQ=255) gaagaaGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCg < 1:3439904/91‑1 (MQ=255) gaagTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCtt < 1:1471346/91‑1 (MQ=255) aagTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTa < 1:2721558/91‑1 (MQ=255) aagTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTa > 1:3521923/1‑91 (MQ=255) aagTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTa > 1:1808650/1‑91 (MQ=255) agTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTAt > 1:2623461/1‑91 (MQ=255) gTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATg < 1:2598114/91‑1 (MQ=255) gTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATg < 1:2979995/91‑1 (MQ=255) aaaCTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGt < 1:1535759/91‑1 (MQ=255) aaaCTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGt > 1:2392039/1‑91 (MQ=255) aaaCTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGt < 1:2743053/91‑1 (MQ=255) aaaCTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGt > 1:119762/1‑91 (MQ=255) aaCTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGtt < 1:373268/91‑1 (MQ=255) cTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTaa > 1:2719372/1‑91 (MQ=255) gTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAg > 1:1491518/1‑91 (MQ=255) gTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAg > 1:1456465/1‑91 (MQ=255) gTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAg > 1:1454327/1‑91 (MQ=255) ggTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTa > 1:1980050/1‑91 (MQ=255) ttCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTAtt > 1:4018031/1‑91 (MQ=255) ttCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTAtt > 1:791695/1‑91 (MQ=255) ttCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTAtt > 1:790960/1‑91 (MQ=255) cATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTgg > 1:3663670/1‑91 (MQ=255) aTTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGga < 1:580782/91‑1 (MQ=255) aTTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGga < 1:2640290/91‑1 (MQ=255) aTTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGga < 1:773438/91‑1 (MQ=255) tACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGgaga < 1:1668086/91‑1 (MQ=255) tACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGgaga > 1:1983653/1‑91 (MQ=255) aCCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGGAGaa < 1:1261291/91‑1 (MQ=255) cttcACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGGAGAACa > 1:611733‑M2/5‑91 (MQ=255) cttcACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGGAGAACa > 1:2648862‑M2/5‑91 (MQ=255) cttcACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGGAGAACa > 1:1946255‑M2/5‑91 (MQ=255) tcACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGGAGAACaaa > 1:1225573‑M2/3‑91 (MQ=255) tcACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGGAGAACaaa > 1:1226332‑M2/3‑91 (MQ=255) | AGATCATGAAGCATTAGAAATTAAATCAGGCGTTATGGAAGGCAATGTTATTACAGCAGAAGAAGTTAAAACTGTTGGTTCATTACCTTCACACGATGGTCTTGTATCTATGCTTTTATCAGTATTACAAGCTCCTGTACGCAACTTCGCTTATGCGGTTAAAGCTATTGGAGAACAAA > USA300TCH1516_ALE/584490‑584668 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |