New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 598649 | 65 (0.660) | 8 (0.100) | 5/124 | NT | 12.1% | intergenic (+198/+84) | tuf/yxeP_2 | Elongation factor Tu/putative hydrolase YxeP |
? | USA300TCH1516_ALE | = 598668 | 66 (0.870) | intergenic (+217/+65) | tuf/yxeP_2 | Elongation factor Tu/putative hydrolase YxeP |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
AACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCT > USA300TCH1516_ALE/598578‑598755 | aaCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCt < 1:4035598/91‑1 (MQ=255) aaCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCt < 1:3815602/91‑1 (MQ=255) aaCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCt < 1:380284/91‑1 (MQ=255) aCTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTa < 1:499660‑M2/91‑2 (MQ=255) cTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTac < 1:1718130‑M2/91‑3 (MQ=255) cTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTac < 1:30807‑M2/91‑3 (MQ=255) cTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTac > 1:3077952‑M2/1‑89 (MQ=255) ttATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTact < 1:2349200‑M2/91‑4 (MQ=255) ttATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTact < 1:2420670‑M2/91‑4 (MQ=255) ataACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTacttt < 1:3738328‑M2/91‑6 (MQ=255) ataACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTacttt > 1:3898036‑M2/1‑86 (MQ=255) taACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttg < 1:1768428‑M2/91‑7 (MQ=255) cTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaag > 1:3363501‑M2/1‑82 (MQ=255) cTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaag < 1:129499‑M2/91‑10 (MQ=255) tGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagg < 1:398673‑M2/91‑11 (MQ=255) gATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaaggg > 1:327171‑M2/1‑80 (MQ=255) gATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCCTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaaggg > 1:1339435‑M2/1‑80 (MQ=255) taataCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggag > 1:78242‑M2/1‑78 (MQ=255) aataCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggagc < 1:32564‑M2/91‑15 (MQ=255) aataCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggagc > 1:654698‑M2/1‑77 (MQ=255) aataCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggagc > 1:653952‑M2/1‑77 (MQ=255) taCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggagcat < 1:2539083‑M2/91‑17 (MQ=255) aCTGTTTAAATAAAATTGTTGAGCCTTGGACACTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggggcatt < 1:1218568‑M2/91‑18 (MQ=255) tttAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCAt > 1:3579147/1‑91 (MQ=255) tttAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCAt > 1:2886978/1‑91 (MQ=255) ttAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCAtt < 1:3143707/91‑1 (MQ=255) ttAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCAtt < 1:3143487/91‑1 (MQ=255) aataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt < 1:1694464/91‑1 (MQ=255) aataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGt < 1:1694739/91‑1 (MQ=255) ataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGtt < 1:689445/91‑1 (MQ=255) ataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGtt < 1:689883/91‑1 (MQ=255) ataaaATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGtt < 1:757537/91‑1 (MQ=255) taacATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGttt < 1:188449/91‑1 (MQ=255) aaaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTAt < 1:2871042/91‑1 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg > 1:2091245/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg > 1:510601/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg > 1:2917533/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCATTCGAAGTTTTCCTTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATg > 1:3308645/1‑91 (MQ=38) aTTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGt < 1:12622/91‑1 (MQ=255) tgttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtct < 1:1618753/91‑1 (MQ=255) tgttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtct < 1:2364260/91‑1 (MQ=255) tgttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtct < 1:2366283/91‑1 (MQ=255) tgttgAGTCTTGGACATTGTAAAATACTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtct < 1:3861434/91‑1 (MQ=255) gttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGtctc > 1:3070350/1‑91 (MQ=255) ttgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCa < 1:3688890/91‑1 (MQ=255) tgAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAg < 1:3357054/91‑1 (MQ=255) tCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTc < 1:1962907/91‑1 (MQ=255) tCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTc < 1:1962892/91‑1 (MQ=255) tCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTc < 1:4037508/91‑1 (MQ=255) cTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCa < 1:3883200/91‑1 (MQ=255) aCATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCt < 1:109318/91‑1 (MQ=255) aCATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCt > 1:517631/1‑91 (MQ=255) cATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCtt > 1:2867393/1‑91 (MQ=255) cATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCtt > 1:840675/1‑91 (MQ=255) ttGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTc < 1:2891527/91‑1 (MQ=255) ttGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTc < 1:2100251/91‑1 (MQ=255) gTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaa > 1:1963286/1‑91 (MQ=255) tAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaat < 1:1807182/91‑1 (MQ=255) aaaaTGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaatt < 1:2830518/91‑1 (MQ=255) aaaaTGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaatt < 1:2506818/91‑1 (MQ=255) aaTGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCaattaa > 1:685663/1‑91 (MQ=255) cTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTa > 1:2972181/1‑91 (MQ=255) cccTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggagcattttacaatgtccaagactcaacaattttatttaaacagtattatc < 1:2684282‑M2/91‑62 (MQ=255) cccTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTaaa < 1:491024/91‑1 (MQ=255) cccTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTaaa < 1:2198877/91‑1 (MQ=255) cccTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTaaa < 1:2198759/91‑1 (MQ=255) ttCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGc < 1:1601895/91‑1 (MQ=255) tCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCt < 1:4057449/91‑1 (MQ=255) tCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCt < 1:1866742/91‑1 (MQ=255) tCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCt < 1:3830638/91‑1 (MQ=255) cAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCtt > 1:3041993/1‑91 (MQ=255) aaaGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTa < 1:130129/91‑1 (MQ=255) aaGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggagcattttacaatgtccaagactcaacaattttatttaaacagtattatcagttata < 1:3154235‑M2/91‑69 (MQ=255) aaGTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggagcattttacaatgtccaagactcaacaattttatttaaacagtattatcagttata < 1:3154189‑M2/91‑69 (MQ=255) aaGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTaa < 1:1525575/91‑1 (MQ=255) aaGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTaa < 1:1525657/91‑1 (MQ=255) aGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAt > 1:4147018/1‑91 (MQ=255) aGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGCTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAt > 1:246077/1‑91 (MQ=255) gTTTTCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggagcattttacaatgtccaagactcaacaattttatttaaacagtattatcagttataag < 1:219096‑M2/91‑71 (MQ=255) gTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAtt < 1:2110137/91‑1 (MQ=255) gTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAtt < 1:743349/91‑1 (MQ=255) gTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAtt < 1:2402926/91‑1 (MQ=255) ttttCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAAttt > 1:3472257/1‑91 (MQ=255) tttCATTTTTTCAATGTCTactttgaagggagcattttacaatgtccaagactcaacaattttatttaaacagtattatcagttataagtt < 1:2023975‑M2/91‑73 (MQ=255) ttCATTTTTTCATTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt > 1:3184009/1‑91 (MQ=255) ttCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt > 1:3920635/1‑91 (MQ=255) ttCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt > 1:683092/1‑91 (MQ=255) ttCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGt > 1:1330351/1‑91 (MQ=255) ttttttCAATGTCTACTTTGAAGGGAACATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTa > 1:19376/1‑91 (MQ=255) tttttCAATGTCTactttgaagggagcattttacaatgtccaagactcaacaattttatttaaacagtattatcagttataagttttatta < 1:1584126‑M2/91‑79 (MQ=255) ttttCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTaaa < 1:1406400/91‑1 (MQ=255) ttttCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTaaa < 1:369647/91‑1 (MQ=255) tCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATAc > 1:1270702/1‑91 (MQ=255) tCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATAc > 1:1256581/1‑91 (MQ=255) tCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATATAAATGCTTAATTTGTTTTAAATAc > 1:3854894/1‑91 (MQ=255) cAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACt < 1:929965/91‑1 (MQ=255) aTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTg > 1:2182130/1‑91 (MQ=255) tGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGc < 1:1264970/91‑1 (MQ=255) tGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGc < 1:1264011/91‑1 (MQ=255) gTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGct > 1:1848813/1‑91 (MQ=255) | AACTTATAACTGATAATACTGTTTAAATAAAATTGTTGAGTCTTGGACATTGTAAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTCATTAGTTTATGTCTCAGATTCATATCTTTCAATTAATTTAAATGCTTAATTTGTTTTAAATACTTGCT > USA300TCH1516_ALE/598578‑598755 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |