New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 681141 | 93 (0.950) | 5 (0.060) | 4/136 | NT | 5.1% | coding (351/354 nt) | USA300TCH1516_00615 | hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 681169 | 107 (1.280) | coding (323/354 nt) | USA300TCH1516_00615 | hypothetical protein |
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
AATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCAT > USA300TCH1516_ALE/681079‑681259 | aaTTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCAt < 1:1037344/91‑1 (MQ=255) tATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATttaa < 1:1560641‑M2/91‑5 (MQ=255) aTTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCACTTAGATTAACCTATATTAATTGACGCGTTCGTGCGTCACACAGTCATttgat < 1:2786234‑M2/91‑6 (MQ=255) tCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACTGTCATttaatat < 1:854499‑M2/91‑8 (MQ=255) tCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATttaatat < 1:734246‑M2/91‑8 (MQ=255) tCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATttaatat < 1:3720344‑M2/91‑8 (MQ=255) cGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATttaatata < 1:3159589‑M2/91‑9 (MQ=255) gtcctgtcctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATttaatatag < 1:3893931‑M2/91‑10 (MQ=255) cctgtcctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATttaatataggt < 1:1369266‑M2/91‑12 (MQ=255) gtcctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTca < 1:3287345/91‑1 (MQ=255) gtcctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTca < 1:1752934/91‑1 (MQ=255) cctTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTcaca < 1:156374/91‑1 (MQ=255) tCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAAtt < 1:4006878/91‑1 (MQ=255) ccGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAAttt < 1:2429097/91‑1 (MQ=255) ccGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAAttt < 1:4058094/91‑1 (MQ=255) cgcTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTtgt > 1:2411465/1‑91 (MQ=255) tCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTtgtgtg < 1:1917570/91‑1 (MQ=255) tCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTtgtgtg < 1:977566/91‑1 (MQ=255) cATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGc > 1:1848321/1‑91 (MQ=255) cATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGc > 1:71196/1‑91 (MQ=255) cATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGc > 1:2036696/1‑91 (MQ=255) cATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTAACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGc < 1:3484972/91‑1 (MQ=255) aTTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCt < 1:3088169/91‑1 (MQ=255) aTTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCt < 1:3088091/91‑1 (MQ=255) aTTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCt < 1:3088125/91‑1 (MQ=255) ttGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCtt < 1:2894675/91‑1 (MQ=255) ttGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCtt > 1:662441/1‑91 (MQ=255) tGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTa > 1:2151563/1‑91 (MQ=255) gTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTAc < 1:3490795/91‑1 (MQ=255) gTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTAc > 1:3168911/1‑91 (MQ=255) aaaCCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGTTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACAt < 1:187833/91‑1 (MQ=255) aaaCCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACAt < 1:2421979/91‑1 (MQ=255) aaaCCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACAt < 1:1315336/91‑1 (MQ=255) aaCCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATg < 1:1475343/91‑1 (MQ=255) aCCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATgg < 1:460735/91‑1 (MQ=255) aCCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATgg > 1:1466786/1‑91 (MQ=255) aTTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTAc > 1:3676428/1‑91 (MQ=255) aTTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTAc > 1:3341622/1‑91 (MQ=255) ttCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCCTTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACt > 1:1270220/1‑91 (MQ=255) cTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAg < 1:2696520/91‑1 (MQ=255) cTTAGATTAACCTATATTAATCGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAg > 1:3242048/1‑91 (MQ=255) ttAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGc > 1:531476/1‑91 (MQ=255) ttAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGc < 1:1224978/91‑1 (MQ=255) ttAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGc < 1:558110/91‑1 (MQ=255) aGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCAt > 1:4048606/1‑91 (MQ=255) tAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTcc < 1:2962300/91‑1 (MQ=255) tAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTcc < 1:2961888/91‑1 (MQ=255) aaCCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATttaatataggttaatctaagcgaatggtttacaatgagcgcggaaggacag < 1:3919292‑M2/91‑52 (MQ=255) aaCCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACCATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCt > 1:758614/1‑91 (MQ=255) aaCCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCt > 1:2000213/1‑91 (MQ=255) aCCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATttaatataggttaatctaagcgaatggtttacaatgagcgcggaaggacagg < 1:602789‑M2/91‑53 (MQ=255) cTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATttaatataggttaatctaagcgaatggtttacaatgagcgcggacggacatgac < 1:3726793‑M2/91‑55 (MQ=255) cTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCAc < 1:1406279/91‑1 (MQ=255) cTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCAc < 1:2230813/91‑1 (MQ=255) tataTTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACt < 1:289926/91‑1 (MQ=255) tataTTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACt > 1:2985203/1‑91 (MQ=255) atTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGa < 1:3171278/91‑1 (MQ=255) atTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGa < 1:3453310/91‑1 (MQ=255) aaTTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGAttt < 1:707956/91‑1 (MQ=255) aaTTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGAttt < 1:507288/91‑1 (MQ=255) aTTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCAAAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTta < 1:1243933/91‑1 (MQ=255) ttGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTtat > 1:341635/1‑91 (MQ=255) gACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAg > 1:1387940/1‑91 (MQ=255) aCGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGt < 1:751207/91‑1 (MQ=255) gggTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCa > 1:2203127/1‑91 (MQ=255) gggTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCa < 1:2794942/91‑1 (MQ=255) ggTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCaa > 1:373507/1‑91 (MQ=255) gTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCaaa < 1:3665928/91‑1 (MQ=255) gTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCaaa < 1:2198929/91‑1 (MQ=255) gTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCaaa > 1:2428162/1‑91 (MQ=255) ttCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAat < 1:3523452/91‑1 (MQ=255) ttCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAat < 1:2723268/91‑1 (MQ=255) tCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAata < 1:3703508/91‑1 (MQ=255) cGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAatat > 1:716868/1‑91 (MQ=255) cGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAatat > 1:716306/1‑91 (MQ=255) cGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAatat < 1:1356212/91‑1 (MQ=255) cGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAatat > 1:513870/1‑91 (MQ=255) ccTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCAtt < 1:467029/91‑1 (MQ=255) cTCACACAGTCATTTAAGATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTc < 1:3558993/91‑1 (MQ=255) tCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCg > 1:1135430/1‑91 (MQ=255) tCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCg > 1:2379859/1‑91 (MQ=255) tCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCg > 1:2650380/1‑91 (MQ=255) acaGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGc < 1:88074/91‑1 (MQ=255) acaGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGc > 1:3015478/1‑91 (MQ=255) acaGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGc > 1:3015459/1‑91 (MQ=255) caGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGcc < 1:40796/91‑1 (MQ=255) caGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGcc < 1:3386029/91‑1 (MQ=255) caGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTCGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGcc < 1:432538/91‑1 (MQ=255) aGTCATTTAATATAGGTTCGCAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCg < 1:264632/91‑1 (MQ=255) gTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGt < 1:3969492/91‑1 (MQ=255) gTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGt < 1:3972438/91‑1 (MQ=255) tCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTg < 1:2208867/91‑1 (MQ=255) aTTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCa < 1:1922557/91‑1 (MQ=255) aTTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCa > 1:1730770/1‑91 (MQ=255) aTTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCa < 1:3849332/91‑1 (MQ=255) aTTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCa < 1:199841/91‑1 (MQ=255) aTTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCa < 1:3060339/91‑1 (MQ=255) aTTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCa < 1:3060286/91‑1 (MQ=255) tttAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCAt < 1:2141454/91‑1 (MQ=255) tttAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCAt > 1:912063/1‑91 (MQ=255) | AATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCAT > USA300TCH1516_ALE/681079‑681259 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |