| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 712543 | 108 (1.100) | 13 (0.140) | 7/148 | NT | 11.2% | intergenic (+22/‑77) | tagG/tarB | Teichoic acid translocation permease protein TagG/Teichoic acid glycerol‑phosphate primase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 712566 | 107 (1.180) | intergenic (+45/‑54) | tagG/tarB | Teichoic acid translocation permease protein TagG/Teichoic acid glycerol‑phosphate primase | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
TACTTACACATGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCATTTGGTAG > USA300TCH1516_ALE/712477‑712656 | tACTTACACATGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTg > 1:2278885‑M2/1‑90 (MQ=255)tACTTACACATGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTg > 1:742504‑M2/1‑90 (MQ=255)tACTTACACATGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTg > 1:2527167‑M2/1‑90 (MQ=255) aCTTACACATGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTgg > 1:1833943‑M2/1‑89 (MQ=255) ttACACATGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATATATGGAAGTgggg > 1:3197184‑M2/1‑87 (MQ=255) tACACATGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTggggt < 1:1830671‑M2/91‑6 (MQ=255) tACACATGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTggggt > 1:3418563‑M2/1‑86 (MQ=255) acacATGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTggggtt < 1:2979153‑M2/91‑7 (MQ=255) cacaTGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTc > 1:3841803/1‑91 (MQ=255) cacaTGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTc > 1:489222/1‑91 (MQ=255) acaTGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCa < 1:1890861/91‑1 (MQ=255) caTGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCAt > 1:3787518/1‑91 (MQ=255) tGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCAttt < 1:1175877/91‑1 (MQ=255) tGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCAttt > 1:3604443/1‑91 (MQ=255) tGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCAttt > 1:1635061/1‑91 (MQ=255) tGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGGTCAttt > 1:1635060/1‑91 (MQ=255) gAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCAtttt < 1:4067402/91‑1 (MQ=255) gAAATATAGAGATCAATTTACAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCAtttt < 1:355883/91‑1 (MQ=255) aaaTATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCAttttt > 1:425092/1‑91 (MQ=255) atatAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGt < 1:1974177/91‑1 (MQ=255) tataGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGtt < 1:780147/91‑1 (MQ=255) ataGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGttt < 1:780178/91‑1 (MQ=255) ataGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGttt < 1:1293738/91‑1 (MQ=255) taGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTta < 1:2881752/91‑1 (MQ=255) taGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTta < 1:2374366/91‑1 (MQ=255) agagATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTtat > 1:1190141/1‑91 (MQ=255) agaTCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATaa < 1:857828/91‑1 (MQ=255) gaTCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAAt < 1:1998290/91‑1 (MQ=255) aTTTGCAGACTTCTTGTAATATATTGATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAg < 1:3870491/91‑1 (MQ=255) tttGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGt < 1:2579523/91‑1 (MQ=255) tttGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACACCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGt > 1:3304521/1‑91 (MQ=255) gCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTaaa < 1:2833563/91‑1 (MQ=255) cAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAAt > 1:237042/1‑91 (MQ=255) aGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATa < 1:1478344/91‑1 (MQ=255) cttcttGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACa > 1:1185326/1‑91 (MQ=255) ttcttGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACat < 1:1335227/91‑1 (MQ=255) ttcttGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACat < 1:1799292/91‑1 (MQ=255) ttcttGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACat < 1:1798917/91‑1 (MQ=255) cttGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACatat < 1:2611047/91‑1 (MQ=255) ttGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATAtt < 1:3762216/91‑1 (MQ=255) ttGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATAtt > 1:3102274/1‑91 (MQ=255) ttGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATAtt > 1:1357709/1‑91 (MQ=255) tGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTggggtttcgtcatataaatatattacaagaagtctgcaaat < 1:2565023‑M2/91‑42 (MQ=255) gTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTaa > 1:2441532/1‑91 (MQ=255) tAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAg > 1:3333585/1‑91 (MQ=255) aaTATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGt < 1:2612498/91‑1 (MQ=255) aaTATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGt < 1:3577652/91‑1 (MQ=255) atatatTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGtt < 1:591998/91‑1 (MQ=255) tatatTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTg > 1:2739510/1‑91 (MQ=255) tatatTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTg < 1:64643/91‑1 (MQ=255) tatTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGgt > 1:1276040/1‑91 (MQ=255) tttATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGgtgt > 1:2476324/1‑91 (MQ=255) tttATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGgtgt > 1:1295932/1‑91 (MQ=255) tataTGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGtat < 1:2429713/91‑1 (MQ=255) atatGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGtatt > 1:2509135/1‑91 (MQ=255) tatGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGtatta < 1:733625/91‑1 (MQ=255) atGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGtattat > 1:3064397/1‑91 (MQ=255) atGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGtattat > 1:3063020/1‑91 (MQ=255) atGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGtattat > 1:22547/1‑91 (MQ=255) gACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGa < 1:1532244/91‑1 (MQ=255) aCGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGaa < 1:24022/91‑1 (MQ=255) aCGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGaa < 1:1889474/91‑1 (MQ=255) aCGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGaa > 1:3781794/1‑91 (MQ=255) cGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAAc < 1:2251422/91‑1 (MQ=255) aaCCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGtt > 1:1469082/1‑91 (MQ=255) aCCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGttt < 1:1018572/91‑1 (MQ=255) cccGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTta < 1:1719731/91‑1 (MQ=255) ccGCTAACCATTAATAAATGGAAGTggggtttcgtcatataaatatattacaagaagtctgcaaattgatctctatatttcatgtgtaagt < 1:2161643‑M2/91‑67 (MQ=255) ccGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTtaa > 1:1158195/1‑91 (MQ=255) cGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTtaat > 1:2893285/1‑91 (MQ=255) cGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTtaat > 1:3199124/1‑91 (MQ=255) gCTAACCATTAATAAATGGAAGTggggtttcgtcatataaatatattacaagaagtctgcaaattgatctctatatttcatgtgtaagtac < 1:501261‑M2/91‑69 (MQ=255) cTAACCATTAATAAATGGAAGTggggtttcgtcatataaatatattacaagaagtctgcaaattgatctctatatttcatgtgtaagtacg < 1:922701‑M2/91‑70 (MQ=255) tAACCATTAATAAATGGAAGTggggtttcgtcatataaatatattacaagaagtctgcaaattgatctctatatttcatgtgtaagtacgc < 1:1311006‑M2/91‑71 (MQ=255) tAACCATTAATAAATGGAAGTggggtttcgtcatataaatatattacaagaagtctgcaaattgatctctatatttcatgtgtaagtacgc < 1:811481‑M2/91‑71 (MQ=255) tAACCATTAATAAATGGAAGTggggtttcgtcatataaatatattacaagaagtctgcaaattgatctctatatttcatgtctaagtacgc < 1:3969433‑M2/91‑71 (MQ=255) tAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATaaa > 1:1373504/1‑91 (MQ=255) aaCCATTAATAAATGGAAGTggggtttcgtcatataaatatattacaagaagtctgcaaattgatctctatatttcatgtgtaagtacgca < 1:2822254‑M2/91‑72 (MQ=255) aaCCATTAATAAATGGAAGTggggtttcgtcatataaatatattacaagaagtctgcaaattgatctctatatttcatgtgtaagtacgca < 1:1555376‑M2/91‑72 (MQ=255) ccATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGaa < 1:2314253/91‑1 (MQ=255) cATTAATAACTGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAAgaaagaaa > 1:2087536/1‑91 (MQ=255) cATTAATAACTGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGaaa > 1:2086943/1‑91 (MQ=255) ttAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAAtt > 1:1247708/1‑91 (MQ=255) ataaATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTa > 1:154197/1‑91 (MQ=255) taaATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTAt < 1:3828009/91‑1 (MQ=255) aaaTGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATc > 1:3036865/1‑91 (MQ=255) aaaTGGAAGTGGGGTTCATTTTTGGTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAAGTTTATc > 1:3039935/1‑91 (MQ=255) tGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCAtt > 1:2221198/1‑91 (MQ=255) tGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCAtt < 1:268346/91‑1 (MQ=255) ggAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCAttt > 1:1474058/1‑91 (MQ=255) ggAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCAttt < 1:1013165/91‑1 (MQ=255) ggAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCAttt > 1:1330097/1‑91 (MQ=255) gAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCATTTg > 1:1709981/1‑91 (MQ=255) gAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCATTTg < 1:2835109/91‑1 (MQ=255) aGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCATTTGGt > 1:526356/1‑91 (MQ=255) aGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCATTTGGt > 1:1744336/1‑91 (MQ=255) aGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCATTTGGt > 1:1744518/1‑91 (MQ=255) gTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATTATTTGGTa > 1:3146346/1‑91 (MQ=255) tGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCATTTGGTAg < 1:1338641/91‑1 (MQ=255) tGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCATTTGGTAg < 1:97189/91‑1 (MQ=255) | TACTTACACATGAAATATAGAGATCAATTTGCAGACTTCTTGTAATATATTTATATGACGAAACCCCGCTAACCATTAATAAATGGAAGTGGGGTTCATTTTTGTTTATAATTTAAGTAAATAACATATTAAGTTGGTGTATTATGAACGTTTTAATAAAGAAATTTTATCATTTGGTAG > USA300TCH1516_ALE/712477‑712656 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |