| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | 24406 = | 96 (0.990) | 5 (0.060) | 3/240 | NT | 5.7% | intergenic (+398/‑88) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0029/USA300HOU_pUSA300HOUMR0030 | macrolide 2'‑phosphotransferase/Sin recombinase |
| ? | CP000731 | 24471 = | 77 (0.860) | intergenic (+463/‑23) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0029/USA300HOU_pUSA300HOUMR0030 | macrolide 2'‑phosphotransferase/Sin recombinase | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AGTATTAAACAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACA > CP000731/24266‑24546 | aGTATTAAACAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGt < 2:276658/141‑1 (MQ=255) gTATTAAACAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTa < 2:171057/141‑1 (MQ=255) gTATTAAACAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTa < 1:500229/141‑1 (MQ=255) tATTAAACAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAATAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTac > 1:176176/1‑141 (MQ=255) tATTAAACAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTac > 2:320366/1‑141 (MQ=255) ttAAACAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTacac > 1:316873/1‑141 (MQ=255) ttAAACAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTacac > 1:353298/1‑141 (MQ=255) aaaCAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACAccc > 1:337785/1‑141 (MQ=255) aaCAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATGGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCt > 1:676785/1‑141 (MQ=255) aaCAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCt > 1:30310/1‑141 (MQ=255) ccgactgtttctctgtaaagattttctccacaccaaacgtctttaaattatccaattgtctttctaaattttgatctattgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTa > 2:253410‑M1/133‑141 (MQ=255) ccgactgtttctctgtaaagattttctccacaccaaacgtctttaaattatccaattgtctttctaaattttgatctatcgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTa > 1:269020‑M1/133‑141 (MQ=255) aGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAAc > 1:412157/1‑141 (MQ=255) gatgatTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAAcc < 1:628392/141‑1 (MQ=255) gatgatTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAAcc < 2:132963/141‑1 (MQ=255) gatTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATa > 1:223660/1‑141 (MQ=255) ttAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACa > 1:315906/1‑141 (MQ=255) tAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACaa < 1:559313/141‑1 (MQ=255) tAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACaa > 1:348594/1‑141 (MQ=255) aaaTTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAACTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACaaaa < 1:770565/141‑1 (MQ=255) aTTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAg < 2:161925/141‑1 (MQ=255) tttAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAAt > 1:737872/1‑141 (MQ=255) ttAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAAtt < 1:140486/141‑1 (MQ=255) ttAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAAtt > 1:329608/1‑141 (MQ=255) tAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAAttg < 2:208725/141‑1 (MQ=255) tAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAAttg > 2:218952/1‑141 (MQ=255) aGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAAttgt < 1:218206/141‑1 (MQ=255) aGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAAttgt > 1:38279/1‑141 (MQ=255) aGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAAttgt < 1:199856/141‑1 (MQ=255) aaTTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGaa < 1:114362/141‑1 (MQ=255) tttAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAAt < 1:561947/141‑1 (MQ=255) ttAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAAtt > 1:635417/1‑141 (MQ=255) aaaTATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATtat < 2:244062/141‑1 (MQ=255) aaTATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATtata > 1:290887/1‑141 (MQ=255) aaTATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATtata > 2:4216/1‑141 (MQ=255) atatTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATaa < 2:35511/141‑1 (MQ=255) tttATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACaa < 2:21782/141‑1 (MQ=255) ttATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAGATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAAt > 1:388075/1‑141 (MQ=255) tcttGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAAt < 2:111035/138‑1 (MQ=255) tATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTCTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAAtt < 2:315892/141‑1 (MQ=255) aTAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTaaaa < 1:216403/141‑1 (MQ=255) agagATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACg > 2:29719/1‑141 (MQ=255) agagATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACg < 1:138192/141‑1 (MQ=255) gagaTGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGt < 1:603393/141‑1 (MQ=255) gagaTGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGt < 2:41239/141‑1 (MQ=255) agaTGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTa > 2:195154/1‑141 (MQ=255) gaTGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTAt < 2:209249/141‑1 (MQ=255) tCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAggg < 1:205253/141‑1 (MQ=255) aaTGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGgtgt < 2:167551/141‑1 (MQ=255) gtctttctaaattttgatctatcgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGtat > 2:43506‑M1/76‑141 (MQ=255) gtctttctaaattttgatctatcgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGtat > 1:129217‑M1/76‑141 (MQ=255) aaCGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTatat > 1:158826/1‑141 (MQ=255) tttctaaattttgatctatcgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt > 2:235800‑M1/73‑141 (MQ=255) tttctaaattttgatctatcgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt > 2:10832‑M1/73‑141 (MQ=255) aCGGTTCTGTTACAAAGCAAAAATCTCTATTTATTTTTCGTAAGTTTTAATTAAAGCTATGTACCCTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt < 2:165139/141‑1 (MQ=255) aCGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt > 1:165016/1‑141 (MQ=255) aCGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTACATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt > 1:363693/1‑141 (MQ=255) cGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtattt > 1:631569/1‑141 (MQ=255) ttCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatttatt > 1:482119/1‑141 (MQ=255) gTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATgg < 1:710800/141‑1 (MQ=255) cAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTg > 2:37641/1‑141 (MQ=255) cAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTg < 1:327310/141‑1 (MQ=255) aaaaaaTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGat > 1:704937/1‑141 (MQ=255) aaaaTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatga < 2:12071/141‑1 (MQ=255) aaTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaat > 1:728019/1‑141 (MQ=255) aaTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaaa > 1:606145/1‑140 (MQ=255) aTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaatg > 1:411963/1‑141 (MQ=255) aTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaatg > 1:383380/1‑141 (MQ=255) aTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaatg > 1:161521/1‑141 (MQ=255) aTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaatg > 2:210770/1‑141 (MQ=255) atatTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATta > 1:486745/1‑141 (MQ=255) atatTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATta < 2:116949/141‑1 (MQ=255) tatttattTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATtat < 2:244553/141‑1 (MQ=255) tttatttTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAg < 1:136222/141‑1 (MQ=255) tatttTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGGTTATAGGt < 1:193740/141‑1 (MQ=255) tatttTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGt < 1:473800/141‑1 (MQ=255) atttTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTATACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGtt > 1:264814/1‑141 (MQ=255) ttttAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTAt > 1:125247/1‑141 (MQ=255) aGTAAGTTTTAATTATAGATATGTAGACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGAATGATTAGGGTGTATACAACTCATGATGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCga > 2:155147/1‑141 (MQ=255) aaGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACAACCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGagag < 2:102450/141‑1 (MQ=255) aGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGt > 1:106046/1‑141 (MQ=255) aGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGt < 1:37944/141‑1 (MQ=255) tttAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACTAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTatc < 1:424236/141‑1 (MQ=255) ataGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATa > 1:391026/1‑141 (MQ=255) aGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGa < 1:268395/141‑1 (MQ=255) aGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGa < 1:110195/141‑1 (MQ=255) aGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGa < 1:783274/141‑1 (MQ=255) atatGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATc < 1:631011/141‑1 (MQ=255) gTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTAATGCGAGAGTATCATCGACAGATGaaaa > 1:288672/1‑141 (MQ=255) cTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAg > 1:175935/1‑141 (MQ=255) cTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAg > 2:296160/1‑141 (MQ=255) tttGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGa < 1:761013/141‑1 (MQ=255) tttGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGa < 1:381817/141‑1 (MQ=255) tttGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGa < 1:121459/141‑1 (MQ=255) tttGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGa < 2:103992/141‑1 (MQ=255) tGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGaaa < 1:688796/141‑1 (MQ=255) gAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAg < 2:233478/141‑1 (MQ=255) aGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGa > 1:715567/1‑141 (MQ=255) aGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTACGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGa > 1:420885/1‑141 (MQ=255) TACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACa < 2:233598‑M1/141‑1 (MQ=255) | AGTATTAAACAGATGATTAAAATTTTTAGTTAATTTAAATATTTATGATAGAGATGACCTTCAAATGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACA > CP000731/24266‑24546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |