New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000731 | 24406 = | 96 (0.990) | 5 (0.060) | 3/240 | NT | 5.7% | intergenic (+398/‑88) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0029/USA300HOU_pUSA300HOUMR0030 | macrolide 2'‑phosphotransferase/Sin recombinase |
? | CP000731 | 24471 = | 77 (0.860) | intergenic (+463/‑23) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0029/USA300HOU_pUSA300HOUMR0030 | macrolide 2'‑phosphotransferase/Sin recombinase |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACAGAGAAACAGTCGGGAAAGTCAG > CP000731/24331‑24611 | gtctttctaaattttgatctatcgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGtat > 2:43506‑M1/76‑141 (MQ=255) gtctttctaaattttgatctatcgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGtat > 1:129217‑M1/76‑141 (MQ=255) tctttctaaattttgatctatcgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGtata > 1:388131‑M1/75‑141 (MQ=255) gAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGtata < 2:134772/141‑1 (MQ=255) aaCGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTatat > 1:158826/1‑141 (MQ=255) tttctaaattttgatctatcgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt > 2:235800‑M1/73‑141 (MQ=255) tttctaaattttgatctatcgatgatactctcgcataacctataatcattcatcttcactccataataaataTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt > 2:10832‑M1/73‑141 (MQ=255) aCGGTTCTGTTACAAAGCAAAAATCTCTATTTATTTTTCGTAAGTTTTAATTAAAGCTATGTACCCTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt < 2:165139/141‑1 (MQ=255) aCGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt > 1:165016/1‑141 (MQ=255) aCGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt < 2:251837/141‑1 (MQ=255) aCGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTACATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtatt > 1:363693/1‑141 (MQ=255) cGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTAtattt > 1:631569/1‑141 (MQ=255) gTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATgg > 1:17295/1‑141 (MQ=255) gTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATgg < 1:710800/141‑1 (MQ=255) cAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTg < 1:327310/141‑1 (MQ=255) cAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTg > 2:37641/1‑141 (MQ=255) cAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTg < 1:285786/141‑1 (MQ=255) aaaaaaTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGat > 1:704937/1‑141 (MQ=255) aaaaaTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatg > 1:479697/1‑141 (MQ=255) aaaaTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatga < 2:12071/141‑1 (MQ=255) aaTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaat > 1:728019/1‑141 (MQ=255) aaTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaaa > 1:606145/1‑140 (MQ=255) aTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaatg > 1:161521/1‑141 (MQ=255) aTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaatg > 1:383380/1‑141 (MQ=255) aTCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGatgaatg > 2:210770/1‑141 (MQ=255) atatTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATta < 2:116949/141‑1 (MQ=255) atatTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATta > 1:486745/1‑141 (MQ=255) tatttattTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATtat < 2:244553/141‑1 (MQ=255) ttatttTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAgg < 2:74156/141‑1 (MQ=255) tatttTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGGTTATAGGt < 1:193740/141‑1 (MQ=255) tatttTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGt < 1:473800/141‑1 (MQ=255) atttTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTATACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGtt > 1:264814/1‑141 (MQ=255) ttttAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTAt > 1:125247/1‑141 (MQ=255) aGTAAGTTTTAATTATAGATATGTAGACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGAATGATTAGGGTGTATACAACTCATGATGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCga > 2:155147/1‑141 (MQ=255) gTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCgag < 1:32544/141‑1 (MQ=255) aaGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACAACCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGagag < 2:102450/141‑1 (MQ=255) aGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGt > 1:106046/1‑141 (MQ=255) aGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGt < 1:37944/141‑1 (MQ=255) tttAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACTAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTatc < 1:424236/141‑1 (MQ=255) ataGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATa > 1:391026/1‑141 (MQ=255) taGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAg > 1:66666/1‑141 (MQ=255) aGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGa < 1:268395/141‑1 (MQ=255) aGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGa < 1:783274/141‑1 (MQ=255) aGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGa < 1:110195/141‑1 (MQ=255) atatGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATc < 1:631011/141‑1 (MQ=255) gTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTAATGCGAGAGTATCATCGACAGATGaaaa > 1:288672/1‑141 (MQ=255) cTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAg > 2:296160/1‑141 (MQ=255) cTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAg > 1:175935/1‑141 (MQ=255) tttGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGa < 1:761013/141‑1 (MQ=255) tttGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGa < 1:381817/141‑1 (MQ=255) tttGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGa < 1:121459/141‑1 (MQ=255) tGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGaaa < 1:688796/141‑1 (MQ=255) aatatacaccctaatcatacgttttaattgttataatttcaacaattctttttgtatggttagggtgtaTATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGaaa > 2:10832‑M2/70‑141 (MQ=255) gAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAg < 2:233478/141‑1 (MQ=255) tatacaccctaatcatacgttttaattgttataatttcaacaattctttttgtatggttagggtgtaTATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGa > 1:388131‑M2/68‑141 (MQ=255) aGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGa > 1:715567/1‑141 (MQ=255) aGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTACGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGa > 1:420885/1‑141 (MQ=255) atacaccctaatcatacgttttaattgttataatttcaacaattctttttgtatggttagggtgtaTATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGAc > 1:129217‑M2/67‑141 (MQ=255) atacaccctaatcatacgttttaattgttataatttcaacaattctttttgtatggttagggtgtaTATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGAc > 2:43506‑M2/67‑141 (MQ=255) TACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACa < 2:233598‑M1/141‑1 (MQ=255) ACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACaa < 1:59530‑M1/141‑1 (MQ=255) ACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACaa < 1:531401‑M1/141‑1 (MQ=255) ACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACaa < 2:181898‑M1/141‑1 (MQ=255) CACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAGAGACAAt < 2:259499‑M1/141‑1 (MQ=255) ACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAAtt < 2:208564‑M1/141‑1 (MQ=255) ACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAAtt > 1:432380‑M1/1‑141 (MQ=255) CCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTgg < 1:509728‑M1/141‑1 (MQ=255) TAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGAt < 1:305645‑M1/141‑1 (MQ=255) AACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATa < 1:190107‑M1/141‑1 (MQ=255) aTACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAAttt > 1:287779/1‑141 (MQ=255) aTACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAAttt > 1:783287/1‑141 (MQ=255) aTACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAAttt > 2:77873/1‑141 (MQ=255) tACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTa > 2:38297/1‑141 (MQ=255) aCAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTaa > 1:78211/1‑141 (MQ=255) aCAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTaa > 1:67545/1‑141 (MQ=255) aCAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATAGTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTaa > 1:400513/1‑141 (MQ=255) aaaGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGAc > 1:443054/1‑141 (MQ=255) aGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGCGAGAAGCTGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGt < 1:75168/141‑1 (MQ=255) aTTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTg > 1:326595/1‑141 (MQ=255) ttgttgAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTgg > 1:596176/1‑141 (MQ=255) tgttgAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGgt < 1:608111/141‑1 (MQ=255) tgttgAAATTATAACAATTAAAACGCATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGgt > 2:80703/1‑141 (MQ=255) gttgAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGgtg > 1:351887/1‑141 (MQ=255) gAAGTTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTTAAGAGGAATGATGATAGAGTATTTGGGATTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTgg < 1:589048/141‑1 (MQ=255) gAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTgg < 1:250081/141‑1 (MQ=255) ttATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGaa > 1:632186/1‑141 (MQ=255) taACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAAt > 2:237423/1‑141 (MQ=255) taACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAAt > 1:478292/1‑141 (MQ=255) aaaTTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTTTTCTGCAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCtt < 2:316519/140‑1 (MQ=255) aaTTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCttt < 1:490048/141‑1 (MQ=255) aaTTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCttt < 1:485782/141‑1 (MQ=255) aaaaCGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACag > 1:101804/1‑141 (MQ=255) aaaCGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACaga < 1:68901/141‑1 (MQ=255) tATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACAGAGAAAc > 2:132977/1‑141 (MQ=255) aTGATTGGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACAGAGAAACa > 1:525299/1‑141 (MQ=255) aTGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACAGAGAAACa < 1:529630/141‑1 (MQ=255) tagggtgtaTATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACAGAGAAACAGTCgg > 1:269020‑M2/10‑141 (MQ=255) tagggtgtaTATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACAGAGAAACAGTCgg < 1:134472‑M2/132‑1 (MQ=255) tagggtgtaTATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCAATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACAGAGAAACAGTCgg > 2:253410‑M2/10‑141 (MQ=255) tatttattATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACAGAGAAACAGTCGGGAAAGTCAg < 1:221228/141‑1 (MQ=255) | TGAACGGTTCTGTTACAAAGAAAAAATCTATATTTATTTTTAGTAAGTTTTAATTATAGATATGTACACTTTGAGTACACCCTAACCATACAAAAAGAATTGTTGAAATTATAACAATTAAAACGTATGATTAGGGTGTATATTTATTATGGAGTGAAGATGAATGATTATAGGTTATGCGAGAGTATCATCGATAGATCAAAATTTAGAAAGACAATTGGATAATTTAAAGACGTTTGGTGTGGAGAAAATCTTTACAGAGAAACAGTCGGGAAAGTCAG > CP000731/24331‑24611 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |