| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1292499 | 158 (0.780) | 18 (0.110) | 7/128 | NT | 12.2% | intergenic (+53/‑333) | infB/rbfA | Translation initiation factor IF‑2/Ribosome‑binding factor A |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1292522 | 134 (0.820) | intergenic (+76/‑310) | infB/rbfA | Translation initiation factor IF‑2/Ribosome‑binding factor A | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/1292396‑1292499‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atatgctccctataaaGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTT < USA300TCH1516_ALE/1292522‑1292433 AAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATA > 2:2524074/1‑91AAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATA < 1:1950326/91‑1AAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATA < 2:1104441/91‑1AAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATA > 2:1772573/1‑91AAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATA < 2:637138/91‑1AAAGAAGGAGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATGACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATA < 2:3435540/91‑1 AAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATAT > 2:811387/1‑91 AAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATAT > 2:810919/1‑91 gccAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG > 1:3634276/4‑91 AGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG > 2:667326/1‑91 AGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG < 1:3514122/91‑1 AGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG < 1:412506/91‑1 AGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG > 1:1951651/1‑91 AGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG > 1:2010730/1‑91 AGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTCGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG > 2:1252520/1‑91 GAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGC > 2:134308/1‑91 GAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGC > 1:313720/1‑91 GAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGC > 1:3114529/1‑91 GAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGC > 2:2198802/1‑91 AAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCT > 1:3931390/1‑91 GGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATTAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 2:713863/1‑91 GGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATTAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 2:711595/1‑91 GGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 1:446998/1‑91 GGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 2:2666679/1‑91 GGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 1:1188329/1‑91 GGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 1:1378562/1‑91 GGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 1:1595575/1‑91 GGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGATAAGATTGATATGCTCC > 1:3393739/1‑91 GGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAACTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTAGAGTTAAGATTGATATGCTCC > 2:1749558/1‑91 GCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAGGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCC < 2:3221573/91‑1 GCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCC < 2:3762658/91‑1 GCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCC > 1:2359442/1‑91 GCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCC > 2:3232674/1‑91 CGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCT > 2:551882/1‑91 CGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCT < 2:2473658/91‑1 CGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCT < 1:3770755/91‑1 GATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTA < 1:3647627/91‑1 GATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTA > 1:2082613/1‑91 GATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTA < 1:447949/91‑1 ATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTAT < 2:3507548/91‑1 ATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTAT < 2:1985271/91‑1 ATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTAT < 2:3506748/91‑1 ATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTAT > 1:2742088/1‑91 ATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTAT < 2:720018/91‑1 TGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATA < 1:110202/91‑1 TTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAA < 1:2117355/91‑1 TTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAA > 2:3088791/1‑91 AAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATAT < 1:3877069/91‑1 AAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATAT < 1:3877048/91‑1 AAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATAT < 1:3877029/91‑1 AAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATAT < 1:3647818/91‑1 AATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATT < 2:1960043/91‑1 AATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATT < 2:1712279/91‑1 AATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATT < 2:1464558/91‑1 ATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTT < 2:3839043/91‑1 ATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTT < 2:3839021/91‑1 ATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTT < 1:3026452/91‑1 TAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTAT < 2:1628946/91‑1 TAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTAT < 1:1780832/91‑1 AAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATA < 1:3462456/91‑1 GCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGG < 1:1117223/91‑1 GCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGG < 1:1118302/91‑1 GCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGG < 1:1118496/91‑1 TACAATCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATGTTTATAGGGAGCATATCAATCTTAA < 2:2842948/91‑1 TATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAA < 1:664854/91‑1 TATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAA < 2:1157089/91‑1 TGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATT < 1:2154973/91‑1 GCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTA > 2:1357090/1‑91 GCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTA < 1:1978670/91‑1 GCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTA < 2:3650526/91‑1 CTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAA > 1:334893/1‑91 TCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAAC < 2:37372/91‑1 TCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAAC < 1:2114898/91‑1 TCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAAC < 1:1677289/91‑1 TCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAAC < 1:2114681/91‑1 CCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACG > 2:2905701/1‑91 CCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACG < 1:3962895/91‑1 CCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGC < 1:3553607/91‑1 CCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGC > 2:3626220/1‑91 CCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGC < 1:847719/91‑1 CTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCT < 2:1515019/91‑1 ATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTA < 1:3896529/91‑1 AAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAAT < 2:3872951/91‑1 AAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAAT > 1:1216247/1‑91 AAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAAT < 2:2170957/91‑1 AAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAAT < 1:1765398/91‑1 AAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATT > 2:587163/1‑91 AAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATT > 1:1053669/1‑91 AAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATT < 2:2659310/91‑1 AAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATT < 1:2404490/91‑1 AAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATT > 1:2743842/1‑91 AAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATT < 2:2066100/91‑1 AAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATT > 2:2027033/1‑91 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTT > 2:2760249/1‑91 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTT > 2:2760248/1‑91 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTT > 1:1535086/1‑91 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTT > 1:1535010/1‑91 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTT > 1:1534758/1‑91 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTT > 2:1116592/1‑91 AGTAGACACGTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTT < 1:3797646/91‑1 AAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/1292396‑1292499‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atatgctccctataaaGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTT < USA300TCH1516_ALE/1292522‑1292433 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |