| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1759680 | 163 (0.800) | 16 (0.100) | 11/132 | NT | 10.6% | intergenic (‑387/+87) | USA300HOU_RS08780/USA300HOU_RS08785 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1759708 | 136 (0.810) | intergenic (‑415/+59) | USA300HOU_RS08780/USA300HOU_RS08785 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
AAGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/1759577‑1759680‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaactcctaatgtGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCGGTAAAAATC < USA300TCH1516_ALE/1759708‑1759619 AAGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACA > 1:1201138/1‑91AAGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACA > 1:1202472/1‑91 AGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAA > 1:820269/1‑91 AGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAA < 2:2412653/91‑1 AGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAA > 2:1866275/1‑91 AGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAA > 1:1950189/1‑91 GGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAA < 1:2396644/91‑1 GGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAA > 2:3322645/1‑91 GGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAA < 1:1639242/91‑1 GGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAA < 1:1639269/91‑1 GTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTTTTTTTTTTAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAA > 2:187554/1‑91 GTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCACAACAAAA < 1:547418/91‑1 TTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAAC < 2:3783068/91‑1 TTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAAC < 2:1807734/91‑1 TTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAAC > 1:380025/1‑91 TTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGAATTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAAC > 2:3259906/1‑91 TTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACT > 1:3620718/1‑91 TTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACT < 2:900163/91‑1 TTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACT < 2:2978420/91‑1 TAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCTTATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTCCATAACAAAACTC > 2:1524945/1‑91 TAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTC < 2:1161286/91‑1 TAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATACTGCATAACAAAACTC > 2:3785200/1‑91 AATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCC > 2:2816490/1‑91 AATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCC > 1:1424075/1‑91 AATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCC < 2:1029810/91‑1 ATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCT > 1:2511003/1‑91 ATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCT > 1:308301/1‑91 ATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCT < 1:877139/91‑1 ATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCT > 1:91541/1‑91 ATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCT > 2:2817022/1‑91 TTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTA > 2:68863/1‑91 TTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTA > 2:3136609/1‑91 TTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATATTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAATCTCCTAA < 2:85970/91‑1 TTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAA < 1:3712801/91‑1 TTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAA < 1:1143727/91‑1 TTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAA < 1:1143714/91‑1 GGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACGATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATG < 2:2250536/91‑1 GGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATG > 1:1239278/1‑91 GGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATG > 1:2273683/1‑91 GGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATG < 2:2136767/91‑1 GGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATG > 2:197728/1‑91 GGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATG > 1:3109076/1‑91 GGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATG < 1:2542130/91‑1 GGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATG < 2:1563249/91‑1 GTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT > 1:3594652/1‑91 GTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT < 2:680192/91‑1 GTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT > 1:2831943/1‑91 TTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGT < 1:3006932/91‑1 AAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTA < 1:2971428/91‑1 AAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTA < 1:2971804/91‑1 AGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT‑‑‑ACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGT < 1:571685/91‑1 AGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT‑‑‑ACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGT < 1:571987/91‑1 ATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTAC < 1:3058867/91‑1 ATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTAC < 1:3059064/91‑1 TTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATT < 2:1397388/91‑1 TTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTA < 2:2252728/91‑1 ACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGG < 1:963657/91‑1 ACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGG < 1:963578/91‑1 CCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAGAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGA < 2:3463811/91‑1 CCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAGCTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGA < 2:3463802/91‑1 CGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAG < 1:200283/91‑1 GCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGT < 1:1476569/91‑1 TTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTG < 1:3458740/91‑1 AAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAG > 2:2322388/1‑91 AAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAG < 1:2145665/91‑1 AAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAG > 1:490984/1‑91 AAAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAG < 1:1490530/91‑1 AAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTCAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGACAGT > 1:338971/1‑91 AAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGT > 2:3954231/1‑91 AAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGT > 1:339214/1‑91 AAACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGT > 2:942023/1‑91 AACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTG < 2:2469704/91‑1 AACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTG < 1:996101/91‑1 AACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTG < 1:997528/91‑1 AACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTG > 1:3267896/1‑91 AACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTG > 2:1442019/1‑91 AACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTG > 1:2904621/1‑91 ACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGC < 1:2993336/91‑1 ACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGC < 2:3204271/91‑1 ACTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGC > 1:1643776/1‑91 ACTCCGAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGC < 2:3204125/91‑1 CTCCTAATGTGGATCTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCG < 1:3951179/91‑1 CTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCG < 2:2619901/91‑1 CTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCG > 2:3417724/1‑91 CTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCG > 2:3196196/1‑91 CTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCG < 1:2531295/91‑1 CTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCG > 2:264922/1‑91 CTCCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCG > 2:263040/1‑91 CCTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCGGT < 1:2512816/91‑1 CTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCGGTA > 1:1605168/1‑91 CTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCGGTA < 2:1830200/91‑1 CTAATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCGGTA < 1:637909/91‑1 AATGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCGGTAAA > 1:142256/1‑91 TGTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCGGTAAAAA > 1:447555/1‑91 tTGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCGGTAAAAAT < 2:3913445/90‑1 TGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCGGTAAAAATC < 2:1539538/91‑1 AAGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/1759577‑1759680‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaactcctaatgtGGAACTAGTTAAAAAATTCTAAACTAGTACATTAGGAGTTTTGTTATGCAGAATAAATTTAATTGTTAAATTGAAAGTGCGGTAAAAATC < USA300TCH1516_ALE/1759708‑1759619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |