New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1759680 | 163 (0.800) | 16 (0.100) | 11/132 | NT | 10.6% | intergenic (‑387/+87) | USA300HOU_RS08780/USA300HOU_RS08785 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1759708 | 136 (0.810) | intergenic (‑415/+59) | USA300HOU_RS08780/USA300HOU_RS08785 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
GTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGATTACTATTAC > USA300TCH1516_ALE/1759590‑1759770 | gTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT < 2:680192‑M1/91‑1 (MQ=255) tCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAg > 1:3878771/1‑91 (MQ=255) tCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAg > 1:2541859/1‑91 (MQ=255) cGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGt > 2:2564067/1‑91 (MQ=255) gATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGtt < 1:121027/91‑1 (MQ=255) gATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGtt < 2:2285636/91‑1 (MQ=255) gATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACAGCACTTTCAATTTAACAATTAACTTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGtt < 1:3566829/91‑1 (MQ=255) aTTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGttt > 1:1857312/1‑91 (MQ=255) tttttttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTa > 1:3624076/1‑91 (MQ=255) ttttttCAAATAAATAGTGGGTTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTCTTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTCGCTTAg > 1:962516/1‑91 (MQ=255) ttttttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAg < 2:2342072/91‑1 (MQ=255) ttttttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAg < 1:2660234/91‑1 (MQ=255) tttttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGa < 1:1007044/91‑1 (MQ=255) tttttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGa < 1:66623/91‑1 (MQ=255) tttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAt < 1:1368860/91‑1 (MQ=255) ttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAtt < 1:1515830/91‑1 (MQ=255) ttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAtt > 1:1792727/1‑91 (MQ=255) cAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAtttt > 1:158874/1‑91 (MQ=255) cAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAtttt < 1:864139/91‑1 (MQ=255) aataaataGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAtttttt < 2:2104126/91‑1 (MQ=255) aaataGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTggaactagttaaaaaattcta < 1:2971428‑M1/91‑22 (MQ=255) aataGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACt > 2:1341599/1‑91 (MQ=255) taGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAg < 1:1174813/91‑1 (MQ=255) cgtaagtaatagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAg > 1:473737‑M1/54‑91 (MQ=255) aGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGt < 1:2085971/91‑1 (MQ=255) aGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGt < 2:3067771/91‑1 (MQ=255) gTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGtt > 1:718163/1‑91 (MQ=255) ggATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTcc < 2:583575/91‑1 (MQ=255) ggATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTcc > 2:2637225/1‑91 (MQ=255) aTTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtac < 1:3058867‑M1/91‑31 (MQ=255) tACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattag < 1:637909‑M2/91‑8 (MQ=255) tACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattag < 2:1830200‑M2/91‑8 (MQ=255) aCCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattagg < 1:963657‑M1/91‑37 (MQ=255) cGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggag < 2:2619901‑M2/91‑11 (MQ=255) cGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggag > 2:3196196‑M2/1‑81 (MQ=255) gCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagt < 1:2993336‑M2/91‑12 (MQ=255) gCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagt > 1:1643776‑M2/1‑80 (MQ=255) cACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagtt < 1:996101‑M2/91‑13 (MQ=255) cACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagtt < 2:2469704‑M2/91‑13 (MQ=255) aCTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagttt > 2:3954231‑M2/1‑78 (MQ=255) aCTGTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTGAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagttt > 1:338971‑M2/1‑78 (MQ=255) cTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagtttt < 1:2145665‑M2/91‑15 (MQ=255) tttCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttg < 1:3458740‑M1/91‑44 (MQ=255) tttCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTa < 2:3265804/91‑1 (MQ=255) ttCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCAAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAg < 2:3472339/91‑1 (MQ=255) tCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAgt < 1:1064592/91‑1 (MQ=255) aaTTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAgttt < 2:1231987/91‑1 (MQ=255) tAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAgtttgttt > 1:61018/1‑91 (MQ=255) tAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAgtttgttt < 1:3942974/91‑1 (MQ=255) aaCAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGtttt < 1:2836193/91‑1 (MQ=255) aaCAATTAAATTTATTCGGCATAACAAAACTCATAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGtttt < 1:3382352/91‑1 (MQ=255) aaCAATTAAATTGATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGtttt < 2:3682119/91‑1 (MQ=255) aCAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTc > 2:3319770/1‑91 (MQ=255) aaTTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCaa < 2:1635805/91‑1 (MQ=255) tAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCa > 1:2041459/1‑91 (MQ=255) aaaTTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCAc < 1:1485750/91‑1 (MQ=255) aaTTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACg < 1:378787/91‑1 (MQ=255) aTTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACgg > 2:3743233/1‑91 (MQ=255) aTTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACgg < 2:2751428/91‑1 (MQ=255) aTTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACgg < 2:224147/91‑1 (MQ=255) tttATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGa < 1:2404858/91‑1 (MQ=255) tttATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGa < 1:2735853/91‑1 (MQ=255) tATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAta < 2:1825997/91‑1 (MQ=255) aTTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAtac < 2:2071490/91‑1 (MQ=255) cTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAtactac < 1:2988559/91‑1 (MQ=255) gCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACtt > 2:1928216/1‑91 (MQ=255) aTAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTtga < 2:48368/91‑1 (MQ=255) tAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTtgat < 1:1460018/91‑1 (MQ=255) tAACAAAACTCATAATGTACTAGCTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACAGTAGGAGTTTGAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTtgat < 2:3008278/91‑1 (MQ=255) aaCAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTtgatg < 1:133483/91‑1 (MQ=255) aaaCTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagt > 1:339214‑M1/1‑13 (MQ=255) AAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACa < 2:949887‑M1/91‑1 (MQ=255) AAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACa < 1:496082‑M1/91‑1 (MQ=255) AAACTAATAATGTAAGAGTTTAGAATTTTTTAACAAGTTCGACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACa > 2:1407908‑M1/1‑91 (MQ=255) aaCTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtg > 1:3267896‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtgc < 2:3204271‑M1/91‑81 (MQ=255) ACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGa < 1:785740‑M1/91‑1 (MQ=255) ACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGa > 1:206918‑M1/1‑91 (MQ=255) cTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtgcg > 2:264922‑M1/1‑10 (MQ=255) cTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtgcg > 2:3417724‑M1/1‑10 (MQ=255) cTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtgcg < 1:200283‑M2/91‑54 (MQ=255) tCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagctttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtgcgg < 2:3463802‑M2/91‑55 (MQ=255) ccTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtgcggt < 1:2512816‑M1/91‑84 (MQ=255) CCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAATCACGGATACTACTTGATGAACAGatta < 2:1315909‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAGCAGatta < 1:1959926‑M1/91‑1 (MQ=255) cTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtgcggta > 1:1605168‑M1/1‑7 (MQ=255) CTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGattac > 2:1442402‑M1/1‑91 (MQ=255) CTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGattac < 2:1572963‑M1/91‑1 (MQ=255) TAATGTACTAGGTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGattact < 2:1136641‑M1/91‑1 (MQ=255) AATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGattacta < 2:2196545‑M1/91‑1 (MQ=255) AATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGattacta < 2:2832203‑M1/91‑1 (MQ=255) ATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGattactat < 2:3187868‑M1/91‑1 (MQ=255) ATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGattactat < 1:442699‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGattactatt < 2:2440736‑M1/91‑1 (MQ=255) ttggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtgcggtaaaaat < 2:3913445‑M1/90‑90 (MQ=255) gTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtgcggtaaaaat < 1:3059064‑M2/91‑62 (MQ=255) GTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGattactatta > 2:3620718‑M1/1‑91 (MQ=255) GTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGattactatta < 2:1667029‑M1/91‑1 (MQ=255) GTACTAGTTTAGAATTTGTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTGTTAGTTTGTTTTCTAGTACGGGTACTACTTGATGAACAGattactatta > 2:91541‑M1/1‑91 (MQ=255) tggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaagtgcggtaaaaatc < 2:1539538‑M1/91‑91 (MQ=255) | GTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGATTACTATTAC > USA300TCH1516_ALE/1759590‑1759770 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |