| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1858390 = | 114 (0.560) | 19 (0.120) | 10/126 | NT | 15.3% | intergenic (‑17/+57) | USA300HOU_RS09235/USA300HOU_RS09240 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1858437 = | 121 (0.760) | intergenic (‑64/+10) | USA300HOU_RS09235/USA300HOU_RS09240 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
ATGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1858496‑1858390‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atttaagtgcatttgttTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACGAC > USA300TCH1516_ALE/1858437‑1858526 ATGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTA < 1:1676673/91‑1ATGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTA > 1:2330492/1‑91 TGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTAT < 1:1295962/91‑1 TGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTAT > 2:505844/1‑91 TGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTAT > 2:1450524/1‑91 TGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTAT > 2:1451757/1‑91 TGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTAT < 1:3776762/91‑1 GTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATT < 2:2488355/91‑1 GTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGCTTGTTACTTATT < 1:3023206/91‑1 TAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAGACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTT < 2:90992/91‑1 AGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTCAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTA > 2:1241545/1‑91 AGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTA < 2:1030951/91‑1 AGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTA < 1:796446/91‑1 AGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTA < 2:457820/91‑1 GCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAA < 2:1659418/91‑1 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATGATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAG < 2:2130987/91‑1 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAG < 1:905443/91‑1 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAG < 1:905149/91‑1 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAG > 2:1640032/1‑91 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGATGTTACTTATTTAAG > 2:188521/1‑91 AACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGT < 1:2582807/91‑1 AACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGT < 1:2582484/91‑1 ACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTG > 2:3152026/1‑91 CTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGC < 2:1108845/91‑1 CTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGC < 1:3018408/91‑1 CTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGC < 2:61754/91‑1 CTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGC < 1:2528409/91‑1 CTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGC < 1:3804110/91‑1 CTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTACAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGAACTTAAATGAGGGTGTTACTTATTTAAGTGC < 2:1108834/91‑1 TGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTTAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCA < 1:3424563/91‑1 GATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCAT < 2:656943/91‑1 GATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCAT > 2:2489248/1‑91 ATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATT > 2:2711731/1‑91 ATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATT > 2:3730853/1‑91 GCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTG < 2:1916600/91‑1 GCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTG > 2:2364984/1‑91 CAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGT > 2:96463/1‑91 CAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGT < 1:1550888/91‑1 CAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGT < 1:2469242/91‑1 AAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTT < 2:3931563/91‑1 AAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTT > 1:3324496/1‑91 AAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGATGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTT > 2:2520722/1‑91 AAATCATAGCTATACTTCTAGAGGAGATAAATGATTAATAATTAAACAGGTGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTT < 2:1852706/91‑1 TTCTAGAGTAGATAAATAATTATTAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATT < 2:1284417/91‑1 ATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTA < 1:3481064/91‑1 AAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATT > 1:2684549/1‑91 AAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATT > 1:2684568/1‑91 ACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTT > 2:3159089/1‑91 ACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTT > 1:2647013/1‑91 ACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTT > 2:2591974/1‑91 CTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTACTTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCCGTTG > 2:3544829/1‑91 CTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTACTTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTG > 2:3544601/1‑91 AAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGCTTTGCATCAGTTGCTA > 1:1355177/1‑91 AAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTA > 1:535885/1‑91 AATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTAC > 2:1209378/1‑91 ATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACc > 2:2471383/1‑90 ATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACA > 2:2471327/1‑91 GAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTCATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTCTGATTTGCATCAGTTGCTACATT > 2:3015701/1‑91 GAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATT > 2:683656/1‑91 GAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATT > 1:3868139/1‑91 GAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCAACATT > 2:3640382/1‑91 AGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTA > 2:2963206/1‑91 ACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTT > 2:3352083/1‑91 ACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTT > 2:3351987/1‑91 tcgTTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTTCTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGT < 2:3874278/88‑1 ATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAA < 2:2442960/91‑1 ATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAA > 2:1460898/1‑91 ATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAA > 2:1460658/1‑91 ATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAA > 2:2800574/1‑91 TTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAAT > 2:451695/1‑91 TTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAAT > 1:2112007/1‑91 TTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATT < 2:3385500/91‑1 TAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTT > 2:934686/1‑91 AGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGC > 2:803387/1‑91 AGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGC > 2:803346/1‑91 GTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA < 2:1020487/91‑1 GTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA < 1:1617148/91‑1 GTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA > 2:1929575/1‑91 GTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA > 2:2464000/1‑91 GTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA > 1:286901/1‑91 GNGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTNTAGAAGTATAGCTANGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA > 2:1961728/1‑91 TGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCAC > 1:3088510/1‑91 TGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCAC > 1:67162/1‑91 GCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACT < 2:3155788/91‑1 GCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACT < 1:1446541/91‑1 GCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACT < 1:1416258/91‑1 CATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTT > 2:1228134/1‑91 CATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTT > 2:3325856/1‑91 CATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTT > 2:200488/1‑91 ATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTC > 1:3465619/1‑91 TTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCC > 1:2702551/1‑91 TTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCC > 2:172632/1‑91 TTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCC > 2:206399/1‑91 TGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCAC < 1:3354013/91‑1 TGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCAC < 2:2287427/91‑1 TGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCAC > 2:2324851/1‑91 TGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCAC > 1:542856/1‑91 GTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACG > 1:775785/1‑91 TTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACGAC < 2:894404/91‑1 ATGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1858496‑1858390‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atttaagtgcatttgttTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACGAC > USA300TCH1516_ALE/1858437‑1858526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |