| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1878597 = | 148 (0.730) | 12 (0.080) | 8/124 | NT | 9.8% | intergenic (+56/+61) | USA300HOU_RS09320/ebh_2 | Ferredoxin‑‑NADP reductase/Extracellular matrix‑binding protein ebh |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1878652 = | 106 (0.670) | intergenic (+111/+6) | USA300HOU_RS09320/ebh_2 | Ferredoxin‑‑NADP reductase/Extracellular matrix‑binding protein ebh | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CGGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1878704‑1878597‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttatattaaggtcatttCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATC > USA300TCH1516_ALE/1878652‑1878741 CGGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAG > 2:2930378/1‑91CGGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAG > 2:1752139/1‑91CGGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAG < 1:2197484/91‑1 GGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTCAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGT < 1:3677751/91‑1 GGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGc < 1:252866/91‑2 GGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGT < 1:3413441/91‑1 GGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGT < 1:3936895/91‑1 GGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGT < 1:3092948/91‑1 GGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGT < 1:2364100/91‑1 GCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTT > 2:1322585/1‑91 GCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTT > 2:2872138/1‑91 CTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTA < 1:3228556/91‑1 TTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTAT < 1:2184093/91‑1 TTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTAT > 1:3459978/1‑91 TTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTAT > 2:2694984/1‑91 TTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTAT > 1:1653411/1‑91 TTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTAT < 1:1412412/91‑1 TTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATA < 1:69362/91‑1 TTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATA > 2:3363861/1‑91 TGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATAT > 2:3399522/1‑91 TGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATAT > 2:3880059/1‑91 TGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATAT > 2:1308621/1‑91 TGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATAT > 2:1284080/1‑91 GTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATT > 1:2559845/1‑91 GTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATT > 2:2590291/1‑91 GTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCAGAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATT < 1:3635263/91‑1 TTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATACTTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTACTGACCCAGTTACATTA > 2:317841/1‑91 aagaTAGAAAACGTACTAAAAACAAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAA < 2:2493328/87‑1 TAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAA < 2:2493346/91‑1 AGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAG > 2:2007612/1‑91 AGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAG < 1:1650206/91‑1 AGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAG > 2:2387929/1‑91 AGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAG < 2:1580316/91‑1 AGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAG < 1:1232663/91‑1 AGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAG < 1:2184525/91‑1 AGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAG > 1:3464621/1‑91 GCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGG > 1:514504/1‑91 GCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGG < 2:1027714/91‑1 GCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGG > 2:656968/1‑91 GCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGG < 1:3148625/91‑1 GCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGG < 1:3148526/91‑1 GCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGG > 1:1324195/1‑91 CTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGT < 2:1618601/91‑1 TAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTC < 1:977852/91‑1 TAGAAGACGTAAAAAAAAAAAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTC < 2:2771778/91‑1 AGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCA < 2:1021131/91‑1 AGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCA < 1:2540564/91‑1 AGAAGACCTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATGTTAAGGTCA < 1:1976617/91‑1 GAAGACGTACTAATAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCAT < 2:2872340/91‑1 GAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCAT > 2:3453132/1‑91 GAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCAT < 2:3864597/91‑1 AAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATT < 1:363928/91‑1 AAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATT < 1:974844/91‑1 AAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATT < 1:974866/91‑1 AAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATT > 2:221073/1‑91 AAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATT < 2:3806279/91‑1 AGACGTACTAAAAACGAAAAAGATTCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTT < 1:2988376/91‑1 AGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTT < 2:2077717/91‑1 AGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTT > 2:1544607/1‑91 ATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCTGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTT > 1:3142208/1‑91 ATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCTGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTT > 1:3142397/1‑91 CTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCT > 2:908813/1‑91 TAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAA > 1:820157/1‑91 ATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAA > 2:2090091/1‑91 TAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAG > 2:1880868/1‑91 TAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAG > 1:1283043/1‑91 TAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAG > 1:3841477/1‑91 TAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAG > 1:1282967/1‑91 AACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGC > 1:2072267/1‑91 ACGACACTTTTTAGTGTCTCAGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTCCGTCTTCTAGCTAACAAAGCC > 2:544339/1‑91 TTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGT > 1:1142591/1‑91 GTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCTTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAAT > 2:3222210/1‑91 TTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTATCAAAGCCGCGCCTGTAATCAGTGCAAATT < 2:3448123/91‑1 TTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGGACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATT < 2:1893853/91‑1 TATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTC < 1:1923271/91‑1 TATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTC < 1:2866988/91‑1 TATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTC < 1:547403/91‑1 ATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAACTTCT < 1:3125132/91‑1 ATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTT < 1:316304/91‑1 TAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCA > 1:389232/1‑91 TAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCA < 1:507620/91‑1 TAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCA < 2:1236583/91‑1 AAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAA < 1:2209982/91‑1 AGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAAT > 2:389455/1‑91 AGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAAT > 2:45531/1‑91 AGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAAT < 1:2749625/91‑1 AGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAAT > 2:1610660/1‑91 AGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAAT > 2:1610581/1‑91 GGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATG > 1:2110067/1‑91 TCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAAGTCTTTCAATGGT < 1:3049330/91‑1 CATTTCGTTGATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTACGAGCTAACAAAGCAGCACCTTTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTA < 2:697176/91‑1 CATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTA > 1:3124422/1‑91 CATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTA < 2:697272/91‑1 TTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAA > 1:2313035/1‑91 TTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAA > 1:435569/1‑91 TTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAA > 1:528739/1‑91 TTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAA > 2:466535/1‑91 TTCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAAT > 2:63475/1‑91 TCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCGCCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATC < 1:396003/91‑1 TCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATC > 1:117334/1‑91 CGGCTTTGTTAGCTAGAAGACGTACTAAAAACGAAAAAGAATCATAATTAACGAAATGACCTTAATATAACGACACTTTTTAGTGACTCAGTTATATTAAGGTCATTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1878704‑1878597‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttatattaaggtcatttCGTTAATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATC > USA300TCH1516_ALE/1878652‑1878741 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |