| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2053744 = | 215 (1.060) | 37 (0.190) | 16/150 | NT | 15.9% | coding (1116/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2053767 = | 189 (0.990) | coding (1093/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase | |||||
TGCGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/2053838‑2053744‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catacCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAG > USA300TCH1516_ALE/2053767‑2053856 TGCGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGC < 1:156001/91‑1TGCGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGC > 1:159963/1‑91TGCGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGC > 1:2925061/1‑91 GCGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCA < 1:34469/91‑1 GCGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCA > 2:2184061/1‑91 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |