New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2053744 = | 215 (1.060) | 37 (0.190) | 16/150 | NT | 15.9% | coding (1116/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase |
? | USA300TCH1516_ALE | 2053767 = | 189 (0.990) | coding (1093/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
GTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAGT > USA300TCH1516_ALE/2053677‑2053857 | gTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATAcc < 2:3044789/91‑1 (MQ=255) gTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATAGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATAcc > 1:3140951/1‑91 (MQ=255) tCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCtt < 1:2050350/91‑1 (MQ=255) tCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCtt > 2:3594807/1‑91 (MQ=255) tCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCtt > 1:1809519/1‑91 (MQ=255) cGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCttt > 1:3222739/1‑91 (MQ=255) 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catcGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGa > 1:987086/1‑91 (MQ=255) catcGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGa < 2:1466948/91‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCaa < 1:911082/91‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCaa > 1:2767167/1‑91 (MQ=255) ttttGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACTAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGACAAAATCAGACCAAAt < 1:3370422/91‑1 (MQ=255) ttttGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAAt < 2:3146034/91‑1 (MQ=255) ttttGATTGTTCTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAAt < 2:282250/91‑1 (MQ=255) ggTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGttt > 1:3607961/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |