| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2053744 = | 215 (1.060) | 37 (0.190) | 16/150 | NT | 15.9% | coding (1116/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2053767 = | 189 (0.990) | coding (1093/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase | |||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
AACACTTGTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTA > USA300TCH1516_ALE/2053654‑2053834 | tgtatttgaagataatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGt > 1:1622865‑M1/90‑91 (MQ=255) tgtatttgaagataatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGt > 2:1629119‑M1/90‑91 (MQ=255) gtatttgaagataatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTa < 2:554711‑M1/3‑1 (MQ=255) gtatttgaagataatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtggcttattagcattaattaataaagGTa > 2:2245741‑M1/89‑91 (MQ=255) cacTTGTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTa < 2:2025580/91‑1 (MQ=255) acTTGTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTAt < 2:606054/91‑1 (MQ=255) 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aatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACg > 1:3702634‑M1/77‑91 (MQ=255) cTCATCTTGTTGGATTACTTGAGGGATTGGTGTTTGCGGTTCTGATTATATCATCGCTTTTGGTTGTCCTTTGTCGTATGCTGCTTCACGa < 2:422216/91‑1 (MQ=255) atatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACGa > 1:2386867‑M1/76‑91 (MQ=255) atatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACGa > 1:318612‑M1/76‑91 (MQ=255) atatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACGa > 2:797580‑M1/76‑91 (MQ=255) tatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACGaa > 1:1741182‑M1/75‑91 (MQ=255) tatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACGaa > 1:294746‑M1/75‑91 (MQ=255) cATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAAc < 1:3897560/91‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |