| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2307822 | 153 (0.750) | 16 (0.100) | 9/128 | NT | 11.2% | intergenic (‑186/+50) | USA300HOU_RS11770/fecD_2 | hypothetical protein/Fe(3+) dicitrate transport system permease protein FecD |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2307835 | 131 (0.810) | intergenic (‑199/+37) | USA300HOU_RS11770/fecD_2 | hypothetical protein/Fe(3+) dicitrate transport system permease protein FecD | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2307717‑2307822‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaaaggttaagtacGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCATTAT < USA300TCH1516_ALE/2307835‑2307746 CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATACTGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTCTTCAAGATGAATTCA < 1:3374258/91‑1CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGTATAAGTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCA > 2:781896/1‑91CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGCATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCA > 2:631431/1‑91CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCA > 2:781924/1‑91CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCA > 1:3735945/1‑91CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCA > 2:1278313/1‑91CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCA > 2:630677/1‑91CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCA < 2:758447/91‑1 ATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTTATTTTTCAAGATGAATTCAAA < 2:1609007/91‑1 ATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAA > 1:1385520/1‑91 ATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAA < 2:3596611/91‑1 ATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATCAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAA > 2:2328084/1‑91 ATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATCAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAA > 2:2327853/1‑91 TCTTTCAAAATGAATACGAAAGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAA < 2:3776174/91‑1 CTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAA > 2:3809385/1‑91 CTTTCAAAATGTTTATCTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAA < 2:3030278/91‑1 TTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAA < 1:961128/91‑1 TTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAA < 1:959345/91‑1 TTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAG > 2:1671633/1‑91 TTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAG < 1:1345094/91‑1 TCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGG > 1:508270/1‑91 TCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGG < 2:1714811/91‑1 TCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGG > 2:2442200/1‑91 TCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGG > 1:1345335/1‑91 TCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGG > 1:2423576/1‑91 CAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGT < 1:161190/91‑1 AAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATATGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGATT > 2:2670306/1‑91 AAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTT < 1:1306268/91‑1 AAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTT > 2:2670293/1‑91 AAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGAGGAATTCAAAAAAGGTT < 1:1306230/91‑1 AAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTA > 1:2251091/1‑91 AAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTA > 1:1904963/1‑91 AATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAA < 2:138641/91‑1 AATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAA > 1:3465991/1‑91 AATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAA > 1:195199/1‑91 ATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAG < 1:1468883/91‑1 ATGTTTAGGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAAGTCAAAAAAGGTTAAG < 2:3509261/91‑1 TGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGT < 2:2153890/91‑1 TGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGT < 2:509293/91‑1 GTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATTAATTCAAAAAAGGTTAAGTA > 2:1318085/1‑91 GTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTA < 1:3790201/91‑1 GTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTA > 2:3849360/1‑91 GTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTA < 2:3337223/91‑1 GTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTA > 2:3033303/1‑91 GTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTA > 1:2679913/1‑91 TTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCATTATGAATTCAAAAAAAGTTAAGTAC > 2:3341628/1‑91 TTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTAC > 2:675785/1‑91 TTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTAC > 2:2880728/1‑91 AATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATT < 1:955037/91‑1 ATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTG < 2:2412218/91‑1 ATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTG < 1:175962/91‑1 ATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTG < 2:3797399/91‑1 ATAATGAATAATTACAGTTAGTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTG < 2:3797868/91‑1 TAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGT < 2:1763762/91‑1 GAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTT < 2:3894640/91‑1 AATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTA < 1:2386500/91‑1 ATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAA < 2:1982890/91‑1 ATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAA < 1:2804277/91‑1 TAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAAC < 2:3862113/91‑1 TAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAAC < 2:633361/91‑1 TAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAAC < 1:1362097/91‑1 TTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTT < 1:2046835/91‑1 AAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTG < 2:3773194/91‑1 AAAAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTG < 1:1577134/91‑1 AAAAGGTTAAGTACGAAATCAATAATTGTACTTAACCTTTTTTGAAAACAAAAAGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGT < 2:2636148/91‑1 AAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTA < 2:112340/91‑1 AAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTA > 2:3939420/1‑91 AAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTA < 2:111861/91‑1 AAAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTA > 1:1841188/1‑91 AAGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAA < 1:1686283/91‑1 AGGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAAT < 2:1257442/91‑1 GGTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATT > 2:1517425/1‑91 GTTAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTA < 1:2893711/91‑1 TAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATT > 2:1077218/1‑91 TAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATT > 2:538313/1‑91 TAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATT < 1:187096/91‑1 TAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATT < 1:3741910/91‑1 TAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATT > 1:2504394/1‑91 TAAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATT > 2:2649908/1‑91 TAAGTACGAAATCAGTAATTATACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATT > 2:3738106/1‑91 AAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTC > 1:13734/1‑91 AAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTC < 1:2061731/91‑1 AAGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTC < 2:1784308/91‑1 AAGTACGAAATCAGAAATTGTACTTAACCTTATTTGAATTCATCTTGAAAGATTACAAGAAAGAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTC > 1:778359/1‑91 AGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCA > 2:285214/1‑91 AGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCA > 1:1055155/1‑91 AGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCA > 2:2453448/1‑91 AGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCA > 2:2719130/1‑91 AGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCA > 2:285231/1‑91 AGTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCA > 2:349242/1‑91 GTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGATTTCATCTTGAAAAACTACAAGAAATAGGGTATATTTCATAGCTGTACTTATCCAT > 2:3296213/1‑91 GTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCAT < 2:1509578/91‑1 GTACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCAT > 1:656296/1‑91 TACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGATTTTATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCATT > 2:1739607/1‑91 TACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCATT < 1:1464365/91‑1 TACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCATT > 1:2252481/1‑91 TACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCATT < 1:1464366/91‑1 ACGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCATTA < 2:656471/91‑1 CGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGTTTTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCATTAT > 2:3266897/1‑91 CGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCATTAT < 2:3467009/91‑1 CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2307717‑2307822‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaaaggttaagtacGAAATCAGTAATTGTACTTAACCTTTTTTGAATTCATCTTGAAAAATTACAAGAAATAGCGTATATTTAATAACTGTAATTATTCATTAT < USA300TCH1516_ALE/2307835‑2307746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |