| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2307822 | 153 (0.750) | 16 (0.100) | 9/128 | NT | 11.2% | intergenic (‑186/+50) | USA300HOU_RS11770/fecD_2 | hypothetical protein/Fe(3+) dicitrate transport system permease protein FecD |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2307835 | 131 (0.810) | intergenic (‑199/+37) | USA300HOU_RS11770/fecD_2 | hypothetical protein/Fe(3+) dicitrate transport system permease protein FecD | |||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
AATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAAT > USA300TCH1516_ALE/2307745‑2307925 | aataatGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTc < 2:1537741/91‑1 (MQ=255) gtgcaccagacttcttaatattattccgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttTAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCg > 2:3433220‑M1/62‑91 (MQ=255) tgcaccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGt > 2:2486704‑M1/61‑91 (MQ=255) taatGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgt < 2:656471‑M2/91‑3 (MQ=255) aatGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgta < 1:1464366‑M2/91‑4 (MQ=255) aatGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgta > 1:2252481‑M2/1‑88 (MQ=255) attaataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCCTGTAATGTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTAc > 2:177790/4‑91 (MQ=255) atcaataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTAc > 2:1386819/4‑91 (MQ=255) atGGATAAGTACAGCTATGAAATATACCCTATTTCTTGTAGTTTTTCAAGATGAAATCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtac > 2:3296213‑M2/1‑87 (MQ=255) atGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtac < 2:1509578‑M2/91‑5 (MQ=255) atGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtac > 1:656296‑M2/1‑87 (MQ=255) tGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtact > 1:1055155‑M2/1‑86 (MQ=255) gAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtgctt > 2:3500349‑M2/1‑85 (MQ=255) ccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACtt > 1:426185‑M1/57‑91 (MQ=255) aataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtactta < 1:187096‑M2/91‑8 (MQ=255) aataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtactta < 1:3741910‑M2/91‑8 (MQ=255) aataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtactta > 1:2504394‑M2/1‑84 (MQ=255) acttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAAcc > 1:3606133‑M1/53‑91 (MQ=255) acttcttaatagtattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAAcc > 2:578548‑M1/53‑91 (MQ=255) aatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttatcc > 1:1362992‑M2/1‑81 (MQ=255) aatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaacc > 1:2283108‑M2/1‑81 (MQ=255) atTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaacct < 2:1257442‑M2/91‑12 (MQ=255) tACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaaccttt < 2:112340‑M2/91‑14 (MQ=255) cAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaaccttttt < 2:3773194‑M2/91‑16 (MQ=255) cAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTAgtacttaaccttttt < 2:2794007‑M2/91‑16 (MQ=255) gTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTa < 1:340715/91‑1 (MQ=255) gTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTa < 2:163051/91‑1 (MQ=255) ttattaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTaa < 2:594327/91‑1 (MQ=255) ttattaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTaa < 1:1621729/91‑1 (MQ=255) attaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAAc < 1:1782458/91‑1 (MQ=255) ttaAATATACGCTATTTCTGGTAATGTTTCAAGATGAGTTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAAct < 2:1827982/91‑1 (MQ=255) aaaTATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAActct > 1:1559914/1‑91 (MQ=255) aaTATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTa > 2:1940051/1‑91 (MQ=255) aaTATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTa > 1:2621854/1‑91 (MQ=255) aaTATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTa < 1:2537941/91‑1 (MQ=255) tataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAAt < 1:29300/91‑1 (MQ=255) tataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAAt < 2:2573052/91‑1 (MQ=255) ataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATc > 1:1040757/1‑91 (MQ=255) ataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATc < 2:3574775/91‑1 (MQ=255) ataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAACTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTCTTAAACTCTAATc > 1:3952587/1‑91 (MQ=255) aCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCat < 1:975836/91‑1 (MQ=255) gCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAATAAGGTTAAGTACACTTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTCTAACCTCTACTCatat > 2:3273673/1‑91 (MQ=255) gCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCatat < 2:1862952/91‑1 (MQ=255) cTATTTCTTGTAATTATTCAAGATAAATTCAAAAAAGATTAATTACAATTTTTGCTTTCGTCCTTAACCTTTTTTAAACTTTGATCatatt > 2:2606120/1‑90 (MQ=255) aTTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgtt > 1:3451091/1‑91 (MQ=255) cTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTGAAACTCTAATCATATgttagtt > 2:3182087/1‑91 (MQ=255) ttGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgttagtta > 2:3619596/1‑91 (MQ=255) tGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTAt > 1:159075/1‑91 (MQ=255) tGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTAt < 2:2258555/91‑1 (MQ=255) gTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTATACTCTAATCATATGTTAGTTAtt > 2:3023736/1‑91 (MQ=255) gTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTAtt < 2:2649879/91‑1 (MQ=255) aTTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCa < 2:1081943/91‑1 (MQ=255) tttCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttc > 1:2818150/1‑91 (MQ=255) ttCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCCttct > 2:23201/1‑91 (MQ=255) ttCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAtttt > 2:3727384/1‑89 (MQ=255) ttCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttct < 2:1394097/91‑1 (MQ=255) ttCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttct < 1:2631766/91‑1 (MQ=255) cAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttcttc < 1:3284890/91‑1 (MQ=255) cAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttcttc > 1:2631292/1‑91 (MQ=255) cAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttcttc < 1:3122193/91‑1 (MQ=255) aaGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttcttct > 2:2713218/1‑90 (MQ=255) aGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGt < 1:1188114/91‑1 (MQ=255) gATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGta < 1:2775535/91‑1 (MQ=255) aTGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGtaa < 2:3135952/91‑1 (MQ=255) gAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGtaata < 2:1609984/91‑1 (MQ=255) aaTTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGtaataa < 1:305277/91‑1 (MQ=255) aaTTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGtaataa < 1:3073267/91‑1 (MQ=255) aaTTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACCCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGtaataa < 1:316789/91‑1 (MQ=255) ttCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAataata > 2:2023645/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTATACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAatat > 2:2949306/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAatat > 1:2072071/1‑91 (MQ=255) cAAATAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTATCCTTTTTTAAACGCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATAtt < 2:535701/91‑1 (MQ=255) AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGGTTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTa < 1:943134‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTaa < 1:882629‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTaa > 2:3365403‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTaaga > 1:379806‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTaaga < 2:2880008‑M1/91‑1 (MQ=255) aaGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaaccttttttgaattcatcttgaaaaattacaagaaatagcgtatatttaataactgtaa < 1:2046835‑M2/91‑67 (MQ=255) GGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGt > 2:834135‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTa < 2:2964516‑M1/91‑1 (MQ=255) tAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaaccttttttgaattcatcttgaaaaattacaagaaatagcgtatatttaataactgtaattatt < 1:2386500‑M2/91‑72 (MQ=255) TAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATg < 1:1430118‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATgg > 2:1300212‑M1/1‑91 (MQ=255) aGTACAATTACTGATTTCgtacttaaccttttttgaattcatcttgaaaaattacaagaaatagcgtatatttaataactgtaattattca < 1:2831678‑M2/91‑74 (MQ=255) AGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGt < 1:265415‑M1/91‑1 (MQ=255) TACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGc < 2:3860769‑M1/91‑1 (MQ=255) ACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCa > 2:2173244‑M1/1‑91 (MQ=255) ACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCa > 2:485251‑M1/1‑91 (MQ=255) cAATTACTGATTTCgtacttaaccttttttgaattcatcttgaaaaattacaagaaatagcgtatatttactaactgtaattattcattat < 2:3797868‑M2/91‑78 (MQ=255) cAATTACTGATTTCgtacttaaccttttttgaattcatcttgaaaaattacaagaaatagcgtatatttaataactgtaattattcattat < 2:2412218‑M2/91‑78 (MQ=255) CAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATCTGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCAc < 2:3048093‑M1/91‑1 (MQ=255) aaTTACTGATTTCgtacttaaccttttttgaattcatcttgaaaaattacaagaaatagcgtatatttaataactgtaattattcattata < 2:3930057‑M2/91‑79 (MQ=255) aaTTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCAcc > 2:1540502/1‑91 (MQ=255) ttttcTGATTTCGTACTTATCCTTTTTTAGACTCTAGTCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCAACg < 2:1758343/87‑1 (MQ=255) aTTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATGTGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCg < 2:3473834/91‑1 (MQ=255) aTTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCg > 2:1032271/1‑91 (MQ=255) tACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGAt < 1:1662881/91‑1 (MQ=255) aCTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATa > 1:803790/1‑91 (MQ=255) tGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAAt > 1:2576972/1‑91 (MQ=255) aTTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTATTAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTg > 2:2446653/1‑91 (MQ=255) | AATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAAT > USA300TCH1516_ALE/2307745‑2307925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |