| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2388283 = | 137 (0.670) | 17 (0.110) | 9/126 | NT | 13.0% | intergenic (+18/+84) | ribZ_1/sarV | Riboflavin transporter RibZ/HTH‑type transcriptional regulator SarV |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2388362 = | 121 (0.760) | intergenic (+97/+5) | ribZ_1/sarV | Riboflavin transporter RibZ/HTH‑type transcriptional regulator SarV | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
AAGTGTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/2388389‑2388283‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATACT > USA300TCH1516_ALE/2388362‑2388451 AGTGTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGA < 1:2687790/91‑1 AGTGTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGA > 1:3774651/1‑91 GTGTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGAT > 1:2443204/1‑91 GTGTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGAT > 1:179881/1‑91 GTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTG > 1:2903179/1‑91 GTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTG > 2:153435/1‑91 GTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTG < 1:1510649/91‑1 GTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTG < 1:1513377/91‑1 GTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTG > 2:1436270/1‑91 GTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTG > 1:3826960/1‑91 TAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGC < 1:1012100/91‑1 TAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGC < 1:1298314/91‑1 CGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTATATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGC < 1:2590881/91‑1 CGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTATATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGC < 1:2590815/91‑1 CGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGC < 1:849772/91‑1 CGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGC > 2:1711762/1‑91 CGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGC < 1:3410554/91‑1 GTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCT < 2:2087991/91‑1 GTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCT < 2:2658480/91‑1 GTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCT > 1:2545170/1‑91 GTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCT < 1:1079173/91‑1 GTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCT < 1:1079196/91‑1 TTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTT < 2:1974873/91‑1 TACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTT < 1:721431/91‑1 gCAAATTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTT < 2:1849056/90‑1 ACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTT < 2:2979867/91‑1 ACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTT < 1:86322/91‑1 ACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTT < 2:1043953/91‑1 ACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTT < 2:3299379/91‑1 ACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTT < 1:1863305/91‑1 ACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTT < 1:1863569/91‑1 ACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTT < 2:2756155/91‑1 CAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTT < 1:3089872/91‑1 CAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTT < 1:363286/91‑1 CAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTT < 2:1027388/91‑1 AAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTA < 1:2718478/91‑1 AAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTA < 1:2718551/91‑1 AAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTA > 2:2818991/1‑91 CATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGC > 2:2879059/1‑91 ATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCT > 2:2451339/1‑91 CCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAA > 2:1776742/1‑91 CAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACCGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAAC > 2:3889312/1‑91 CAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAAC > 1:3704352/1‑91 AATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACA > 2:2754206/1‑91 CAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTT > 1:166916/1‑91 CAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTT > 1:628504/1‑91 CAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTT > 1:628184/1‑91 CAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTT > 1:2227179/1‑91 CAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTT > 1:2185389/1‑91 AGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTC > 2:3633430/1‑91 GTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTGTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCT > 1:3695231/1‑91 TAATTGCGTCTTGGGGACAGACAATTGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTT < 2:2457486/91‑1 tgagTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTAGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTAC < 2:873394/87‑1 GATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACT > 2:3361317/1‑91 GATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACT < 1:2171446/91‑1 ATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTA > 2:2879803/1‑91 ATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTA < 2:1656400/91‑1 ATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACGTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTA < 2:3581508/91‑1 TTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTAT < 1:51820/91‑1 TTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTAT < 2:2280571/91‑1 TGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATA > 2:3394712/1‑91 TGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATA > 1:2477672/1‑91 GGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAG > 1:1731789/1‑91 GGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAG > 1:1731767/1‑91 GGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAG < 1:3656603/91‑1 GGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAG < 1:558185/91‑1 GCATGTTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGA > 1:2375465/1‑91 GCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGA < 1:1829462/91‑1 GCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGA < 1:1832430/91‑1 GCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGA > 1:1492711/1‑91 CATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAA < 2:78701/91‑1 CATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAA < 2:3362890/91‑1 CATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAA < 1:378418/91‑1 CATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAA < 2:78700/91‑1 ATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAA > 2:963368/1‑91 TGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAAT > 2:2459080/1‑91 TGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAAT < 2:3732785/91‑1 TGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAAT < 2:1656807/91‑1 TGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAAT > 2:3073950/1‑91 GCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATA > 1:2960925/1‑91 CTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAG > 1:3649085/1‑91 CTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAG > 2:1846459/1‑91 TTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGA < 2:826902/91‑1 TTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGA < 1:1534678/91‑1 TTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGA > 1:489893/1‑91 ttgTAAGTTTTGAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACTATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAA < 2:3695825/88‑1 TTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAA < 2:1096194/91‑1 TTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAAT < 2:3212900/91‑1 TTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAAT < 2:1513142/91‑1 TTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAAT < 2:3533668/91‑1 TTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATA > 1:447977/1‑91 TTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATA > 2:68615/1‑91 TTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATA > 2:2389753/1‑91 TTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATA > 2:3662546/1‑91 TTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATA > 1:1461400/1‑91 TTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATA > 1:1191568/1‑91 TTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATA > 2:2389720/1‑91 AAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATACT > 2:2046892/1‑91 AAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATACT > 2:2976731/1‑91 AAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATACT > 1:199744/1‑91 AAGTGTTAAGCGTTACAAACTAAAAACTTAAAAAGCATGCCAATCAGTACATCATAATTGCGTCTTGGGGACAGACAAATGATGAATAGAGATTGGCATGCTTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/2388389‑2388283‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATACT > USA300TCH1516_ALE/2388362‑2388451 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |