| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2388283 = | 137 (0.670) | 17 (0.110) | 9/126 | NT | 13.0% | intergenic (+18/+84) | ribZ_1/sarV | Riboflavin transporter RibZ/HTH‑type transcriptional regulator SarV |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2388362 = | 121 (0.760) | intergenic (+97/+5) | ribZ_1/sarV | Riboflavin transporter RibZ/HTH‑type transcriptional regulator SarV | |||||
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
ATATTCAAAAATAAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATACT > USA300TCH1516_ALE/2388272‑2388451 | atatTCAAAAATAAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTaa < 2:2814092/91‑1 (MQ=255) tatTCAAAAATAAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAg < 1:2157187/91‑1 (MQ=255) ttCAAAAATAAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTATTGATTGGCATGCTTTTTAAGtt > 2:3193052/1‑91 (MQ=255) aaTAAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGt < 2:465777/91‑1 (MQ=255) aTAAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGtt < 2:676894/91‑1 (MQ=255) aTAAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGtt < 2:503482/91‑1 (MQ=255) TAAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGttt < 1:2718478‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTg < 2:2413693‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTg < 1:363286‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGt < 2:3299379‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGt < 2:1043953‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTaa < 2:1974873‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTaa < 1:3707777‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAAc < 1:1079173‑M1/91‑1 (MQ=255) GCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACg < 1:849772‑M1/91‑1 (MQ=255) GCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATATACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACg < 1:2590815‑M1/91‑1 (MQ=255) atgccaatcagtacatcataattgcgtcttggggacagacaaatgatgaatagagattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCt > 2:2451339‑M2/72‑91 (MQ=255) GCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTa < 1:1012100‑M1/91‑1 (MQ=255) ccaatcagtacatcataattgcgtcttggggacagacaaatgatgaatagagattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTaa > 2:1776742‑M2/69‑91 (MQ=255) CAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAac < 1:1513377‑M1/91‑1 (MQ=255) CAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAac < 1:2889962‑M1/91‑1 (MQ=255) aatcagtacatcataattgcgtcttggggacagacaaatgatgaatagagattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAaca > 2:2754206‑M2/67‑91 (MQ=255) gatctGTTCATCATGTGTCTGTCCCCAAGACGCAAGTATGATGTAGTGAGTGGCATGCTTTTTAAGCTTTTAGTTTGTAGCGCTGAACACt < 2:30356/89‑1 (MQ=255) cagtacatcataattgcgtcttggggacagacaaatgatgaatagagattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACtt > 1:166916‑M2/64‑91 (MQ=255) cagtacatcataattgcgtcttggggacagacaaatgatgaatagagattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACtt > 1:2227179‑M2/64‑91 (MQ=255) cagtacatcataattgcgtcttggggacagacaaatgatgaatagagattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACtt > 2:820957‑M2/64‑91 (MQ=255) cagtacatcataattgcgtcttggggacagacaaatgatgaatagagattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACtt > 1:628504‑M2/64‑91 (MQ=255) tctATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTc < 1:562376/91‑1 (MQ=255) ctATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCt > 1:3224826/1‑91 (MQ=255) tATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTa > 1:618906/1‑91 (MQ=255) tATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTa < 2:3928551/91‑1 (MQ=255) aTTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTAt > 2:2230948/1‑91 (MQ=255) ttCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACAGTTCTAtt > 2:3520758/1‑91 (MQ=255) catcatTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTc > 2:712870/1‑91 (MQ=255) atcatTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCt < 1:143425/91‑1 (MQ=255) tcatTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTcaa < 1:960136/91‑3 (MQ=255) catTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCttt > 1:3101343/1‑91 (MQ=255) atTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTa < 2:2549325/91‑1 (MQ=255) tctgtcCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTAGTTCTTTAGTAAt < 1:3029626/91‑1 (MQ=255) ctgtcCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAAtt > 1:3292389/1‑91 (MQ=255) ctgtcCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAAtt > 1:616221/1‑91 (MQ=255) gtcCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAAtttt < 1:3311075/91‑1 (MQ=255) tcCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTa > 1:3891979/1‑91 (MQ=255) tcCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTa > 2:183811/1‑91 (MQ=255) ccccAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTAt > 1:1708013/1‑91 (MQ=255) ccAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCt > 1:196112/1‑91 (MQ=255) cAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTa > 2:2139386/1‑91 (MQ=255) cAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTa > 1:342523/1‑91 (MQ=255) aGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTCGTAATTTTATCTAAc < 1:3376657/91‑1 (MQ=255) gACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACa < 2:1521391/91‑1 (MQ=255) aCGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACaa < 1:2934217/91‑1 (MQ=255) aCGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACaa > 1:3537615/1‑91 (MQ=255) cGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAAt < 1:108475/91‑1 (MQ=255) cGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAAt < 2:2841520/91‑1 (MQ=255) cGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAAt < 2:1462272/91‑1 (MQ=255) cGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAAt > 1:130006/1‑91 (MQ=255) cacctATGACGTACTGATTGGCCGGCTTCTCAAGATTTTAGTCTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAAttt > 2:2919391/5‑91 (MQ=255) aaTTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAGCGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTc < 1:1815887/91‑1 (MQ=255) aaTTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTc < 1:2729668/91‑1 (MQ=255) aaTTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTc > 2:2575862/1‑91 (MQ=255) aaTTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTc > 1:1625610/1‑91 (MQ=255) aaTTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTc > 1:2961498/1‑91 (MQ=255) aaTTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTc < 1:543225/91‑1 (MQ=255) aaTTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTc < 2:3866095/91‑1 (MQ=255) ttATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCtt > 1:1916677/1‑91 (MQ=255) gatgTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTga > 1:2594327/1‑91 (MQ=255) atgTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTgag < 2:1547497/91‑1 (MQ=255) gTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGaa > 2:1920352/1‑91 (MQ=255) gTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGaa > 2:3085388/1‑91 (MQ=255) gTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTGTTTAGGTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGaa > 2:1425905/1‑91 (MQ=255) aCTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGt > 1:1258764/1‑91 (MQ=255) aCTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGt > 1:241589/1‑91 (MQ=255) tgagtggcatgctttttaAGTTTTTAGTTAGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTAc < 2:873394‑M2/73‑1 (MQ=255) gattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACt > 2:3361412‑M2/18‑91 (MQ=255) gattggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACt > 1:718582‑M2/18‑91 (MQ=255) attggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACGTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACta < 2:3581508‑M2/75‑1 (MQ=255) ttggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACtat < 2:2280571‑M2/76‑1 (MQ=255) tggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACtata > 2:3394712‑M2/15‑91 (MQ=255) ggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatag > 1:1731789‑M2/14‑91 (MQ=255) ggcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatag < 1:3656603‑M2/78‑1 (MQ=255) gcatgttttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTataga > 1:2375465‑M2/13‑91 (MQ=255) gcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTataga > 1:866989‑M2/13‑91 (MQ=255) gcatgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTataga > 1:1492711‑M2/13‑91 (MQ=255) catgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatagaa < 1:378418‑M2/80‑1 (MQ=255) atgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatagaaa > 2:963368‑M2/11‑91 (MQ=255) tgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatagaaat > 2:3073950‑M2/10‑91 (MQ=255) tgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatagaaat > 1:2505785‑M2/10‑91 (MQ=255) tgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatagaaat < 2:1656807‑M2/82‑1 (MQ=255) tgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatagaaat < 2:3732785‑M2/82‑1 (MQ=255) tgctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatagaaat > 2:2459080‑M2/10‑91 (MQ=255) ctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatagaaatag > 2:1846459‑M2/8‑91 (MQ=255) ctttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATCGCTTTTGAGAATTACTatagaactag > 2:1590682‑M2/8‑91 (MQ=255) tttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatagaaataga > 1:489893‑M2/7‑91 (MQ=255) tttttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTatagaaataga < 1:1534678‑M2/85‑1 (MQ=255) tttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAAt < 2:3533668‑M2/87‑1 (MQ=255) ttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATa > 2:3663097‑M2/4‑91 (MQ=255) ttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATa > 1:1191568‑M2/4‑91 (MQ=255) ttaAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATa > 2:2389720‑M2/4‑91 (MQ=255) taAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATAc < 1:1840709‑M2/89‑1 (MQ=255) aAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATACt > 2:2976731‑M2/2‑91 (MQ=255) | ATATTCAAAAATAAAAAGCATGCCAATCTCTATTCATCATTTGTCTGTCCCCAAGACGCAATTATGATGTACTGATTGGCATGCTTTTTAAGTTTTTAGTTTGTAACGCTTAACACTTCTATTTCTTTAGTAATTTTATCTAACAATTTCTTTTGAGAAGTACTATAGAAATAGAATACT > USA300TCH1516_ALE/2388272‑2388451 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |