| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2699646 | 93 (0.460) | 18 (0.120) | 11/122 | NT | 18.3% | intergenic (+53/+37) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2699665 | 90 (0.580) | intergenic (+72/+18) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2699538‑2699646‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaatcgaactgatgagaTAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAAC < USA300TCH1516_ALE/2699665‑2699577 TTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAA < 1:2456592/91‑1TTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAA > 1:327932/1‑91TTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAA > 2:2068883/1‑91 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA > 1:1026708/1‑91 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA > 1:2899946/1‑91 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA < 1:3254760/91‑1 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA > 1:3933495/1‑91 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA < 1:934979/91‑1 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA > 2:1116071/1‑91 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA > 2:2139925/1‑91 TGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAA > 2:1891626/1‑91 TGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAA < 1:3538290/91‑1 GTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCGATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAAT < 1:2999993/91‑1 tagCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGACGTTTGATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACAAAAAAAAAAAAAATC < 2:2793551/88‑1 TATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATC > 2:1757863/1‑91 TATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATC < 2:2792986/91‑1 TATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATC < 2:2793585/91‑1 TATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATC > 1:1129687/1‑91 TATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATC > 1:1129208/1‑91 ATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCG < 1:3507700/91‑1 ATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCG < 1:3507584/91‑1 CTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAA < 2:1147288/91‑1 CAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACT < 1:405500/91‑1 AAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTG > 1:2238015/1‑91 AAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTG > 1:2192425/1‑91 AATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAATTCGAACTGA < 1:1977124/91‑1 AATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGA < 1:2117713/91‑1 AATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGA < 1:3217214/91‑1 AATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGA < 2:1719232/91‑1 ATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGAT > 1:3425468/1‑91 TGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATG > 2:1280153/1‑91 gatAGACGCCATTGAAGATCACGGCTACGATGTCGTCTAGTTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAACTTAAAAAATCGAACTGATGA < 2:2667045/88‑1 GAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGA < 2:2568341/91‑1 GAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGA < 2:2568786/91‑1 GAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGA < 1:3719177/91‑1 GAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGA < 1:3272901/91‑1 GAAACACGCAATGGAAAATCAAAGTTACAATGTCGTTTAATGAGGCAATAATCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGA < 2:2568752/91‑1 acaACGCAATTGAAGATCCAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGCGA > 2:372054/4‑91 AAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA < 2:3633098/91‑1 AAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA < 2:759201/91‑1 AAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA > 1:2378748/1‑91 AAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA > 1:2378848/1‑91 CAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATT‑AAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGA < 1:1317737/91‑1 CAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATT‑AAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGA < 1:1317578/91‑1 AGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGAT < 1:3748753/91‑1 GGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATANTCAANGTCATCAACACNAAATT‑AAAAATCGANCTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTC < 1:1488754/91‑1 GTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTC < 1:3380543/91‑1 TTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACTTCATCAACAAAAAATAAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCT < 2:102278/91‑1 TTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCT < 1:2185924/91‑1 TTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCT < 2:517109/91‑1 TTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCT < 2:3816309/91‑1 TTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATAGTCAATGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCT < 2:102602/91‑1 TACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATT‑AAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCA < 1:1283885/91‑1 CGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCAT < 1:1022849/91‑1 GATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATC < 1:1512354/91‑1 GATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATT‑AAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCA < 1:2160886/91‑1 TCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTT < 1:2536774/91‑1 TCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTT < 1:2536339/91‑1 CGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATT‑AAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCG < 2:3791513/91‑1 TTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTT < 1:1881045/91‑1 AAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAAT > 1:898084/1‑91 AAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAAT > 1:1899347/1‑91 AAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATT < 1:623662/91‑1 AAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATT < 2:2033283/91‑1 AATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTA < 2:3291035/91‑1 AATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTA > 2:3896154/1‑91 AATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTA < 2:1394349/91‑1 AATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTA < 1:2005009/91‑1 AATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGGTCGATTTTTAAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTA > 2:3569134/1‑91 TCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAA < 1:1493412/91‑1 TCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAA > 1:1310428/1‑91 TCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAA > 1:1311515/1‑91 CGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAAC > 2:1119924/1‑91 CGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAAC < 1:994230/91‑1 GAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACG > 1:3560909/1‑91 GAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACG > 1:226362/1‑91 ACTGATGTGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGAC < 2:2304616/91‑1 ACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGTTGACGTTGAATATTGCCTAATTAAATGAC > 1:3181857/1‑91 ACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAGTATTGCCTAATTAAACGAC < 2:3455481/91‑1 ACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGAC > 2:574492/1‑91 TGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACAT > 1:1704188/1‑91 GATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATC < 2:368626/91‑1 GATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATC < 1:1350956/91‑1 GATGACATAATTTGGATTGTTGGGAGTCTCATCAGTTCGCTTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATC < 1:3670624/91‑1 GATGACATAATTTGGATTGTTGGGACTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGAGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATC < 1:3670673/91‑1 ATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCG > 1:467690/1‑91 ATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCG > 1:534616/1‑91 TGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGT < 2:1933044/91‑1 TGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGT < 2:659296/91‑1 TGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGT < 2:1533653/91‑1 TGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTATTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGT < 2:3479300/91‑1 GAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTA < 2:3603748/91‑1 GAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTA < 2:3128596/91‑1 AGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAA < 1:2442569/91‑1 AGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAA > 2:2313403/1‑91 AGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAA > 2:421421/1‑91 AGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAA > 1:1721492/1‑91 AGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGAAATCGTAA > 2:1173266/1‑91 GATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAAC > 2:1770129/1‑91 GATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAAC > 1:2201454/1‑91 TTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2699538‑2699646‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaatcgaactgatgagaTAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAAC < USA300TCH1516_ALE/2699665‑2699577 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |