| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2699646 | 93 (0.460) | 18 (0.120) | 11/122 | NT | 18.3% | intergenic (+53/+37) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2699665 | 90 (0.580) | intergenic (+72/+18) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
AGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGA > USA300TCH1516_ALE/2699575‑2699755 | aGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTa > 2:2948139/1‑91 (MQ=255) atgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAt > 1:1207088‑M1/47‑91 (MQ=255) tgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtc > 1:980673‑M1/46‑91 (MQ=255) ggtacGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtc > 2:3599000‑M2/3‑89 (MQ=255) gTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGGGAATCCCAACAATCCAAATTAtc > 2:1237440‑M2/1‑89 (MQ=255) gTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtc > 1:2201454‑M2/1‑89 (MQ=255) gTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtc > 2:1770129‑M2/1‑89 (MQ=255) ttACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtct > 2:421421‑M2/1‑88 (MQ=255) tACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctc < 2:3128596‑M2/91‑5 (MQ=255) aCGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctca < 2:1933044‑M2/91‑6 (MQ=255) cGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcat > 1:534616‑M2/1‑85 (MQ=255) acattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCtcat > 1:998601‑M1/42‑91 (MQ=255) acattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAA‑TCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCtcatc > 1:2267845‑M1/42‑91 (MQ=255) gATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatc < 1:1350956‑M2/91‑8 (MQ=255) gATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatc < 2:368626‑M2/91‑8 (MQ=255) gATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAAGCGAACTGATGAGACTCCCAACAATCCAAATTAtgtcatc < 1:3670624‑M2/91‑8 (MQ=255) attagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAA‑TCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAg > 1:494033‑M1/40‑91 (MQ=255) gTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagt < 2:2304927‑M2/91‑11 (MQ=255) gTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagt > 2:574492‑M2/1‑81 (MQ=255) gTCGTTTAATTAGGCAATACTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagt < 2:3455481‑M2/91‑11 (MQ=255) cGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttc > 1:226362‑M2/1‑79 (MQ=255) tttAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcga < 1:1493412‑M2/91‑15 (MQ=255) tttAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcga > 1:1311515‑M2/1‑77 (MQ=255) tAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTTAAAAATCGACCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatt > 2:3569134‑M2/1‑75 (MQ=255) tAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatt < 2:1394349‑M2/91‑17 (MQ=255) aaTTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattt < 1:623662‑M2/91‑18 (MQ=255) tAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTa > 2:3861479/1‑91 (MQ=255) tAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTa > 1:1112275/1‑91 (MQ=255) ggCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGCATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGATCGATTTTTAAt > 2:3292244/1‑91 (MQ=255) ggCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAt > 2:2285610/1‑91 (MQ=255) gCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGCGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAtt > 1:3141909/1‑91 (MQ=255) gCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAtt > 1:1535237/1‑91 (MQ=255) cAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAttt < 1:2283565/91‑1 (MQ=255) atatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTAc > 1:3021655/1‑91 (MQ=255) atatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTAc > 2:3606216/1‑91 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 2:1102325/91‑1 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 2:289174/91‑1 (MQ=255) ttCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCg > 1:172036/1‑91 (MQ=255) aaCGTCATCAACACCAAATTAAAACATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTaa > 2:1339498/1‑91 (MQ=255) cGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc > 2:170631/1‑91 (MQ=255) gTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGACCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCACATCGATTTTTAACTTCCTCGCAAccc > 2:2729768/1‑90 (MQ=255) gTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCt > 2:775475/1‑91 (MQ=255) tcatcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTa > 1:502221/1‑91 (MQ=255) tcatcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTa < 1:1471651/91‑1 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt < 1:2034061/91‑1 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt > 1:2412648/1‑91 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt > 1:1071194/1‑91 (MQ=255) tcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTa > 1:1004549/1‑91 (MQ=255) caACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAt > 2:1849410/1‑91 (MQ=255) caACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAt < 1:164952/91‑1 (MQ=255) acacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtct > 2:1550098/1‑91 (MQ=255) acaacaAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCATAGTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtct < 2:2622393/91‑1 (MQ=255) cacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtctc > 1:2411170/1‑91 (MQ=255) cacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtctc > 2:3488675/1‑91 (MQ=255) cacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtctc > 2:2521614/1‑91 (MQ=255) acCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTcc < 2:894772/91‑1 (MQ=255) acCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTcc < 1:1876756/91‑1 (MQ=255) AATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTc < 2:1213905‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCt < 1:881728‑M1/91‑1 (MQ=255) TTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTg < 2:3693260‑M1/91‑1 (MQ=255) TAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGc < 1:3417852‑M1/91‑1 (MQ=255) TAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGc < 1:90019‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCaa < 1:3528356‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCaa > 1:343153‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTCATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTgcact < 1:1402082‑M1/91‑3 (MQ=255) AAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATa < 2:2232555‑M1/91‑1 (MQ=255) AAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATa < 1:3547037‑M1/91‑1 (MQ=255) aTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACa > 1:1925092/1‑91 (MQ=255) cGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacg < 2:3791513‑M2/91‑60 (MQ=255) aaCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacga < 1:2536774‑M2/91‑62 (MQ=255) aaCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTa > 2:210523/1‑91 (MQ=255) aCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTaa < 1:2457995/91‑1 (MQ=255) aCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTaa > 2:2457839/1‑91 (MQ=255) cTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAAt > 1:1183595/1‑91 (MQ=255) tgatgaGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacgacatc < 1:2160886‑M2/91‑65 (MQ=255) atgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGtt > 2:3945657/1‑91 (MQ=255) tgaGAATCTCAACAGTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACGTCTAATGTTg < 2:1749487/91‑1 (MQ=255) tgaGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacgacatcgta < 1:1283885‑M2/91‑68 (MQ=255) tgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTg > 1:659652/1‑91 (MQ=255) tgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTg > 2:1458084/1‑91 (MQ=255) tgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTg < 1:2100827/91‑1 (MQ=255) gagaATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGc < 1:1146075/91‑1 (MQ=255) agaATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacgacatcgtaa < 2:517109‑M2/91‑70 (MQ=255) agaATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacattgactattgcctaattaaacgacatcgtaa < 2:102602‑M2/91‑70 (MQ=255) gaATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacgacatcgtaac < 1:3380543‑M2/91‑71 (MQ=255) aaTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATc < 1:1506634/91‑1 (MQ=255) aaTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATc < 1:198987/91‑1 (MQ=255) aTCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacgacatcgtaacct < 1:3748753‑M2/91‑73 (MQ=255) aTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCt < 2:3228521/91‑1 (MQ=255) tCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatttttaatttggtgttgatgacgttgaatattgcctaattaaacgacatcgtaaccttg < 1:1317737‑M2/91‑74 (MQ=255) ccAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAAt > 1:1056379/1‑91 (MQ=255) ccAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAAt < 1:1891626/91‑1 (MQ=255) aacaaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGc > 1:921603/1‑91 (MQ=255) caaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCAt > 1:2931406/1‑91 (MQ=255) cAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACa > 1:3891269/1‑91 (MQ=255) aaaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACaa > 2:1648582/1‑91 (MQ=255) aaaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACaa < 1:2417504/91‑1 (MQ=255) aaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAAt > 2:3650564/1‑91 (MQ=255) aaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAAt < 2:2005009/91‑1 (MQ=255) aTCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAACTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGa < 1:3244787/91‑1 (MQ=255) | AGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGA > USA300TCH1516_ALE/2699575‑2699755 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |