| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 88662 = | 245 (1.200) | 19 (0.120) | 9/126 | NT | 9.7% | intergenic (+35/‑730) | nusG_1/USA300TCH1516_00080 | Transcription termination/antitermination protein NusG/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 88722 = | 163 (1.020) | intergenic (+95/‑670) | nusG_1/USA300TCH1516_00080 | Transcription termination/antitermination protein NusG/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TTTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/88768‑88662‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAC > USA300TCH1516_ALE/88722‑88811 TTTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGAT < 2:1782218/91‑1TTTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGAT > 1:1901303/1‑91 TTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATT > 2:3720968/1‑91 TTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATT > 2:164894/1‑91 TTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATT > 2:115033/1‑91 TTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTA < 1:2750140/91‑1 TTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTA > 2:249101/1‑91 TTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTA > 1:2199677/1‑91 TGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAA < 1:1953258/91‑1 TGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAA > 2:3170178/1‑91 ATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAATAATATCCTCCTTAACAATGATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGG < 2:1688787/91‑1 ATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGG < 1:3886734/91‑1 ATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGG > 1:639274/1‑91 ATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGG > 2:3797944/1‑91 ATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGG > 2:3638141/1‑91 TAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGA > 2:34055/1‑91 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAG < 1:3624718/91‑1 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAG > 1:2017723/1‑91 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAG > 1:3901335/1‑91 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAG < 1:2114778/91‑1 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAG < 1:3690705/91‑1 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAG < 1:2485626/91‑1 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAG < 1:3695865/91‑1 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAG > 1:1319288/1‑91 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATCAAGGAG > 1:2034362/1‑91 ATGTTATTCTTCTAATATTCTTTTTTCTTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGA < 2:3420436/91‑1 ATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGA < 2:3413256/91‑1 ATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGA < 2:2201093/91‑1 ATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGA < 2:2578147/91‑1 TGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGAT > 1:1039819/1‑91 TGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGAT > 2:1802656/1‑91 TGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGAT > 1:2114086/1‑91 TGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGAT < 1:1730206/91‑1 GTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATA < 1:2490909/91‑1 GTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATA > 1:2176718/1‑91 TATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATT > 2:1177510/1‑91 TATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATT > 1:1271845/1‑91 ATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTT < 1:856216/91‑1 ATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTT > 2:2710411/1‑91 ATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTT < 1:855890/91‑1 TCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTCAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTT > 2:449557/1‑91 TCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTT > 2:2922874/1‑91 TTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTA > 2:2262565/1‑91 TACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACCATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TG‑TTAAGGAGGCTATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATT > 2:271789/1‑91 AATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATA > 1:3521731/1‑91 TCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACAT > 1:3017446/1‑91 CTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTT > 1:3538361/1‑91 CTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTT > 2:3342097/1‑91 CTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTT > 2:3759940/1‑91 CTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTT > 2:1780869/1‑91 CTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTT > 2:1780266/1‑91 CTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTT > 1:302910/1‑91 CTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTT > 1:3379207/1‑91 TCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTA > 1:3568794/1‑91 TCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTA > 2:1632367/1‑91 AATAATAAGTTATTTAAATTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAA > 1:3856934/1‑91 ATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAAC > 1:1168339/1‑91 TATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTA > 1:2024472/1‑91 TTAAGGAGGATATTTTTTTTTTTTTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAA > 2:948735/1‑91 TTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAA < 1:1594276/91‑1 AAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATT < 2:1444279/91‑1 GGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTAT < 1:431593/91‑1 GGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTAT < 2:2420956/91‑1 GGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTAT < 1:2933458/91‑1 AGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGACATTATAT > 1:1968790/1‑91 AGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATAT > 1:1211604/1‑91 AGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATAT < 2:2149835/91‑1 AGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATAT > 1:3921571/1‑91 AGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATAT > 1:3921586/1‑91 GGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATA > 2:1803446/1‑91 GGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATA > 1:64316/1‑91 GGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATA > 1:698613/1‑91 GATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAA < 1:1759463/91‑1 ATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAT > 2:918369/1‑91 ATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAT < 2:1285531/91‑1 ATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAT > 1:2675102/1‑91 ATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAT > 1:1020274/1‑91 ATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTAAAAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAT < 2:1285983/91‑1 TATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATT < 1:3853037/91‑1 TATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATT < 1:1373059/91‑1 TATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATT < 2:1854208/91‑1 ATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTA > 2:3319413/1‑91 ATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTA > 2:2499219/1‑91 ATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTA > 1:3459935/1‑91 ATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTA < 2:3085757/91‑1 TTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTATCTTATTAATTGAAATTATATAATTAA > 2:3419057/1‑91 TTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAA < 1:1438584/91‑1 TTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAA < 1:1438547/91‑1 TTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAA > 1:3947192/1‑91 TTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAA < 2:1125361/91‑1 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA < 2:3656743/91‑1 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA > 2:892397/1‑91 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA > 2:3940863/1‑91 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA > 2:2008512/1‑91 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA < 2:3656652/91‑1 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA > 2:2008539/1‑91 TTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAA > 2:816257/1‑91 TTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAA > 2:2652632/1‑91 TTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAC < 1:273152/91‑1 TTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAC < 1:269832/91‑1 TTTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTAT‑‑TGATTAAGGAGGATATTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/88768‑88662‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAC > USA300TCH1516_ALE/88722‑88811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |