New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 88662 = | 245 (1.200) | 19 (0.120) | 9/126 | NT | 9.7% | intergenic (+35/‑730) | nusG_1/USA300TCH1516_00080 | Transcription termination/antitermination protein NusG/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 88722 = | 163 (1.020) | intergenic (+95/‑670) | nusG_1/USA300TCH1516_00080 | Transcription termination/antitermination protein NusG/hypothetical protein |
Only 100 of 335 total aligned reads displayed.
CTAGTTCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAACC > USA300TCH1516_ALE/88632‑88812 | ttCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAgtg < 2:1149413/91‑1 (MQ=255) cTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAgtgtg > 2:292508/1‑91 (MQ=255) tAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAgtgtgt < 1:1046147/91‑1 (MQ=255) tAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAgtgtgt < 2:912002/91‑1 (MQ=255) tAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCGCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTTTTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAgtgtgt < 1:3508105/91‑1 (MQ=255) aaaTTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTa < 2:141953/91‑1 (MQ=255) ttGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAAt < 2:3898962/91‑1 (MQ=255) ttGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAAt < 2:2816368/91‑1 (MQ=255) ttttaatttacacactaaaaaatatcctccttaacaataataagttatttaaattattgattaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTa > 2:2262565‑M2/78‑91 (MQ=255) gagaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTa < 2:409511/91‑1 (MQ=255) gagaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTa > 1:1112277/1‑91 (MQ=255) gagaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTa < 2:3093572/91‑1 (MQ=255) agaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTGAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaa < 1:3948278/91‑1 (MQ=255) gaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaaa < 1:1340677/91‑1 (MQ=255) aaataaatAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaaaa < 2:3860485/91‑1 (MQ=255) aaataaatAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaaaa < 1:2412894/91‑1 (MQ=255) aataaataGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAGCTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaaaaa < 2:2620778/91‑1 (MQ=255) ataaataGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACAAATTATTGTAACGTTGGATATATCTTAGTGTGTTGATTACAAAg > 2:2166212/1‑91 (MQ=255) taaataGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGa > 2:1499821/1‑91 (MQ=255) taGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAAGTTACTAGTGTTAAGGAGGGAATTTTTTATTGTGTAAATTAAAAAGAAttt < 2:3543112/91‑1 (MQ=255) taGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAAttt < 1:1816752/91‑1 (MQ=255) taGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAAAAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAAttt > 1:3336525/1‑91 (MQ=255) gATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTa > 1:2310666/1‑91 (MQ=255) gATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTa > 2:1296229/1‑91 (MQ=255) gATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTa > 1:1538488/1‑91 (MQ=255) gATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTGAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTa > 1:3685940/1‑91 (MQ=255) atatAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTGAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTag < 1:3418117/91‑1 (MQ=255) ataAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTagaa > 2:1708342/1‑91 (MQ=255) ataAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTagaa < 1:3627533/91‑1 (MQ=255) AAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAgaagaa > 1:3201474‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAAt < 1:856216‑M1/91‑1 (MQ=255) AAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAAt > 2:2710411‑M1/1‑91 (MQ=255) AATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATa > 1:1271845‑M1/1‑91 (MQ=255) ATATCCTCCTTAATCACTAATTTAAATCACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATaa < 1:3853932‑M1/91‑1 (MQ=255) ATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACa > 2:1802656‑M1/1‑91 (MQ=255) ATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACa < 1:1730206‑M1/91‑1 (MQ=255) TCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACAt < 2:2201093‑M1/91‑1 (MQ=255) ctccttaacaataataagttatttaaattattgattaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACAttt > 2:1780266‑M2/52‑91 (MQ=255) ctccttaacaataataagttatttaaattattgattaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACAttt > 1:302910‑M2/52‑91 (MQ=255) ctccttaacaataataagttatttaaattattgattaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACAttt > 2:3342097‑M2/52‑91 (MQ=255) CTCCTTAATCAATCATTTAACCAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTCAATTCAAAAGAATTTGAGACGAATAACAttt > 1:2017724‑M1/1‑91 (MQ=255) CTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACAttt < 1:3695865‑M1/91‑1 (MQ=255) CTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACAttt < 1:2114515‑M1/91‑1 (MQ=255) CTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACAttt < 1:2485626‑M1/91‑1 (MQ=255) tccttaacaataataagttatttaaattattgattaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTa > 1:3568794‑M2/51‑91 (MQ=255) TCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTa > 2:34055‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTAt > 2:3797944‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTAt > 1:639274‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTAt < 1:3886734‑M1/91‑1 (MQ=255) CTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATc < 1:3533636‑M1/91‑1 (MQ=255) TTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCa < 1:1953258‑M1/91‑1 (MQ=255) TTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCa > 2:3170178‑M1/1‑91 (MQ=255) TAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaa > 2:249101‑M1/1‑91 (MQ=255) ATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaaaa > 1:1901303‑M1/1‑91 (MQ=255) caataataagttatttaaattattgattaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaaaaa > 2:1185059‑M2/44‑91 (MQ=255) cAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaaaaaa < 2:679395/91‑1 (MQ=255) aataatTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTATTGTTTATATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAAc > 2:1947771/1‑91 (MQ=255) aataatTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAAc > 1:2056205/1‑91 (MQ=255) aataatTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAAc > 1:1486527/1‑91 (MQ=255) taatTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTg > 2:483093/1‑91 (MQ=255) atTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGtt > 1:44372/1‑91 (MQ=255) atTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGtt > 2:1912212/1‑91 (MQ=255) tttAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTTTTTTTTTTATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTc > 2:323728/1‑91 (MQ=255) tttAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTc > 1:681730/1‑91 (MQ=255) tttAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTc < 2:1642316/91‑1 (MQ=255) tttAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTc < 2:125603/91‑1 (MQ=255) tAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCAt > 1:2178883/1‑91 (MQ=255) aaTAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTa > 1:834594/1‑91 (MQ=255) aaTAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTa < 2:101797/91‑1 (MQ=255) aaTAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTa > 2:1583081/1‑91 (MQ=255) aTAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTAc < 1:2505241/91‑1 (MQ=255) aTAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTAc < 2:286818/91‑1 (MQ=255) tAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTAcc < 1:707126/91‑1 (MQ=255) aCTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCtt < 2:702067/91‑1 (MQ=255) aCTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCtt < 2:1788650/91‑1 (MQ=255) cTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCtta < 1:1618788/91‑1 (MQ=255) cTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCtta < 2:2966903/91‑1 (MQ=255) cTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCtta < 2:2975826/91‑1 (MQ=255) ttattaTTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCttat < 2:3875974/91‑1 (MQ=255) tattatTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCttatt < 1:3593832/91‑1 (MQ=255) tattatTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACAATTATAAAAAAACTGTTCATTACCttatt < 2:2020789/91‑1 (MQ=255) ttattGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTaa < 2:948746/91‑1 (MQ=255) tattGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAAt > 1:1384460/1‑91 (MQ=255) ttGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTg > 1:3773916/1‑91 (MQ=255) ttAAGGAGGATATCTTTTAGTGTGTAAATTAACAAGGACTCTAGAAGACTAACATTTATCAAAAAACTGCACACTAACTCATTAACTTaaa > 2:2572857/1‑91 (MQ=255) ggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATtat < 2:2420956‑M2/78‑1 (MQ=255) aggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATtatat > 1:1211604‑M2/12‑91 (MQ=255) aggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATtatat < 2:2149835‑M2/80‑1 (MQ=255) aggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATtatat > 1:3921586‑M2/12‑91 (MQ=255) atatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAt > 1:1020274‑M2/9‑91 (MQ=255) atatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAt > 1:2675102‑M2/9‑91 (MQ=255) tatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAtt < 2:1854208‑M2/84‑1 (MQ=255) atttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTAACTTATTAATTGAAATTATATAATTa > 2:3711744‑M2/7‑91 (MQ=255) tttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTATCTTATTAATTGAAATTATATAATTaa > 2:3419057‑M2/6‑91 (MQ=255) tttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaa < 1:1438547‑M2/86‑1 (MQ=255) tttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaa < 1:2900752‑M2/86‑1 (MQ=255) tttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaaaa < 2:3656652‑M2/88‑1 (MQ=255) ttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaaaaa > 2:2652632‑M2/3‑91 (MQ=255) ttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaaaaa > 2:816257‑M2/3‑91 (MQ=255) tTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAc < 1:273152‑M2/90‑1 (MQ=255) | CTAGTTCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAACC > USA300TCH1516_ALE/88632‑88812 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |