| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 344426 | 177 (0.870) | 48 (0.280) | 14/136 | NT | 23.1% | intergenic (+25/‑183) | yezG_1/USA300HOU_RS01545 | putative antitoxin YezG/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 344433 | 170 (0.980) | intergenic (+32/‑176) | yezG_1/USA300HOU_RS01545 | putative antitoxin YezG/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GAATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/344325‑344426‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagactaaac‑‑‑aaAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTCATAT < USA300TCH1516_ALE/344433‑344344 GAATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTGATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTA < 2:2415831/91‑1GAATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTA < 2:1409560/91‑1GAATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTA > 1:1246448/1‑91GAATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTA > 1:1965584/1‑91 AATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAA > 1:362847/1‑91 AATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAA < 1:2788775/91‑1 AATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAA > 1:2552122/1‑91 AATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAA < 1:2021182/91‑1 AATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAA > 1:1839568/1‑91 AATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCAAGAAGAATAGACAATCTTAATGTAA > 2:119631/1‑91 AATTGTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAA > 1:3129809/1‑91 ATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATACAGTTAAAGACATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGACGAATAAACTACCTTAATGTAAG > 2:3010524/1‑91 ATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAG < 2:495112/91‑1 TTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGA < 1:873448/91‑1 TTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGA < 2:1902113/91‑1 TTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGAC > 1:1946755/1‑91 TTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGAC < 2:1984168/91‑1 TTACCAGGAACGGAATATGAAAGTAATAAAGTTAAAGAAAGCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAGCTATCTTAATGTAAGACT < 2:45409/91‑1 ACCAGAAACGGAATATGAAAGTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAA < 2:3710857/91‑1 CCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAA > 2:1456583/1‑91 CCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAA > 1:3017698/1‑91 CCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAA > 1:1188459/1‑91 CCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAA < 2:553812/91‑1 CCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAA > 1:1188433/1‑91 CCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAA > 2:1456274/1‑91 CAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC > 1:2616868/1‑91 CAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC < 2:1394697/91‑1 CAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC < 1:3833076/91‑1 GAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AA < 2:2488569/91‑1 GAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AA > 2:3887123/1‑91 AAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAA < 2:3827117/91‑1 ACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTATTGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGC < 1:851192/91‑1 ACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGC < 1:148037/91‑1 GAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTT < 2:1999692/91‑1 GAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTT < 1:2654605/91‑1 GAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTT < 2:1140949/91‑1 GAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTT < 1:1407246/91‑1 AATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTGAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AATGCTTTA < 2:27567/91‑1 ATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGGAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTAT < 2:1006554/91‑1 ATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGTCTAAAC‑‑‑AAAGCTTTAT < 2:2421703/91‑1 ATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTAT < 2:3738020/91‑1 ATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTAT < 1:399837/91‑1 ATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTAT < 2:1837879/91‑1 ATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTAT < 2:2244300/91‑1 ATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTAT < 1:2943258/91‑1 ATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTAT < 1:2521550/91‑1 TATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAACCTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATT < 2:1867158/91‑1 TATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATT < 2:1744287/91‑1 TATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATT < 1:3850189/91‑1 TATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATT < 1:925352/91‑1 ATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTG < 2:1518249/91‑1 ATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTG < 1:3428241/91‑1 ATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTG < 2:274609/91‑1 TGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGT < 1:1071201/91‑1 GAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTT < 2:3865044/91‑1 GAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTT < 2:2951913/91‑1 AAATTAATAAAGTTAGAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTT < 2:2830373/91‑1 AAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTT < 1:2366911/91‑1 AAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTT < 1:1778917/91‑1 AAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTT < 1:1535683/91‑1 AAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTT < 2:48199/91‑1 AAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTT < 2:2240587/91‑1 AAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTT < 2:2156652/91‑1 AAATTAAGAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTT < 2:195855/91‑1 ATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAG < 1:104720/91‑1 TTAATAAAGTTAAAGAAATCGATCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAGACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGT < 2:3002381/91‑1 TTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAATAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGT < 2:1162267/91‑1 TTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGT < 2:139104/91‑1 TTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGT < 1:1973742/91‑1 TTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGT < 1:1586901/91‑1 TTAATAAAGGTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGT < 1:196946/91‑1 TAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTC < 2:544253/91‑1 ATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTT < 2:3508222/91‑1 AGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCT‑‑‑TTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTG > 1:608540/1‑91 AATAAACTATCTTACTGTAAGACGGAAC‑‑‑GAAGCTTTATTGTTTGGTCTTATATTGAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATGTATTGCT < 2:3679497/91‑1 AAGACTAAAC‑‑‑GAAGCTTTATTGTTTAGTCGTACATTAAGATAGTGTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTAT < 2:2278744/91‑1 AAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTAT > 2:3402539/1‑91 AAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTAT > 1:1318377/1‑91 AAGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTAT < 1:3636511/91‑1 AGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTGATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATT < 1:3138646/91‑1 AGACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTGACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATT < 1:3165307/91‑1 GACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTA > 1:2935703/1‑91 GACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTA > 1:3874022/1‑91 ACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAA > 2:3238441/1‑91 ACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAA > 2:3239686/1‑91 ACTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAA < 1:3601387/91‑1 CTAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAAT < 2:218552/91‑1 TAAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATT > 1:3500162/1‑91 AAAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTT < 1:1728341/91‑1 AAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTC > 1:2171172/1‑91 AAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTC > 1:1263421/1‑91 AAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTC < 2:2279703/91‑1 AAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTC < 2:2279672/91‑1 AAC‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTC < 1:3934613/91‑1 C‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTCAT > 2:3102484/1‑91 C‑‑‑AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTCAT < 1:3353723/91‑1 AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTCATA < 1:2725722/91‑1 AAAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTCATA > 2:672292/1‑91 AAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTCATAT < 1:603086/91‑1 AAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTCATAT > 1:778039/1‑91 GAATTTTACCAGAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAAC‑‑‑AA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/344325‑344426‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagactaaac‑‑‑aaAGCTTTATTGTTTAGTCTTACATTAAGATAGTTTATTCTTCTAGCTCTTTAATATATTGCTCGATTTCTTTAACTTTATTAATTTCATAT < USA300TCH1516_ALE/344433‑344344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |