| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 344426 | 177 (0.870) | 48 (0.280) | 14/136 | NT | 23.1% | intergenic (+25/‑183) | yezG_1/USA300HOU_RS01545 | putative antitoxin YezG/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 344433 | 170 (0.980) | intergenic (+32/‑176) | yezG_1/USA300HOU_RS01545 | putative antitoxin YezG/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 363 total aligned reads displayed.
GAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAGATAATT > USA300TCH1516_ALE/344336‑344516 | aaaCGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAt > 1:1352347/1‑91 (MQ=255) aaCGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATa < 2:2934759/91‑1 (MQ=255) aCGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATaa < 2:246058/91‑1 (MQ=255) aCGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATaa < 1:3413118/91‑1 (MQ=255) cGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATaaa > 1:2379559/1‑91 (MQ=255) ggAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAg > 2:510449/1‑91 (MQ=255) gAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagcttt < 2:1140949‑M1/91‑7 (MQ=255) aaTATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTGAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAtgcttta < 2:27567‑M1/91‑8 (MQ=255) aaTATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagcttta < 2:3500297‑M1/91‑8 (MQ=255) aaTATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCt > 2:2407778/1‑91 (MQ=255) atatGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGGAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttat < 2:1006554‑M1/91‑9 (MQ=255) atatGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttat < 2:1837879‑M1/91‑9 (MQ=255) atatGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttat < 1:2827049‑M1/91‑9 (MQ=255) atatGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttat < 2:2244300‑M1/91‑9 (MQ=255) atatGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTt > 1:778039‑M2/1‑90 (MQ=255) tatGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttatt < 2:1744287‑M1/91‑10 (MQ=255) tatGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttatt < 1:925352‑M1/91‑10 (MQ=255) gAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttattgtt < 2:430963‑M1/91‑13 (MQ=255) gAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTttgtt < 1:3934613‑M2/91‑6 (MQ=255) aaaTTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttattgttt < 2:2156652‑M1/91‑14 (MQ=255) aaaTTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttattgttt < 1:2366911‑M1/91‑14 (MQ=255) aaaTTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttattgttt < 1:1535683‑M1/91‑14 (MQ=255) aaTTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTttgttta > 1:3500162‑M2/1‑84 (MQ=255) aTTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTttgtttag < 2:218552‑M2/91‑9 (MQ=255) ttAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttattgtttagt < 2:139104‑M1/91‑17 (MQ=255) ttAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttattgtttagt < 1:1973742‑M1/91‑17 (MQ=255) ttAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAAagctttattgtttagt < 1:1586901‑M1/91‑17 (MQ=255) ttAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTttgtttagt > 2:3239686‑M2/1‑82 (MQ=255) ataaAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTttgtttagtctt < 1:3636511‑M2/91‑13 (MQ=255) ataaAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTttgtttagtctt > 2:3402539‑M2/1‑79 (MQ=255) aaaGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCtttt > 2:1905874/1‑91 (MQ=255) aGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTa > 1:2888910/1‑91 (MQ=255) aaaGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGt < 2:1594019/91‑1 (MQ=255) aaGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGtt < 2:1473021/91‑1 (MQ=255) aaaTCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTaa < 1:2189267/91‑1 (MQ=255) aTCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGt < 1:517101/91‑1 (MQ=255) aTCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGt > 1:1670036/1‑91 (MQ=255) aTCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGt < 1:2472014/91‑1 (MQ=255) tCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCGTTTTAGCGTTTAAGTa > 2:3777678/1‑91 (MQ=255) acGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTa < 2:3931041/90‑1 (MQ=255) aGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTaaaa < 2:3198992/91‑1 (MQ=255) aGCAATACATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTCAATATAAGACCAAACAATAAAGCTtcgttccgtcttacagtaagatagtttatt < 2:3679497‑M2/91‑31 (MQ=255) aaTATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGc < 2:1981935/91‑1 (MQ=255) atatatTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCa < 2:2807144/91‑1 (MQ=255) ttAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGa < 1:1302119/91‑1 (MQ=255) ttAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCATTTAAGTAAAAAGCAATAGa > 1:360237/1‑91 (MQ=255) aaGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATAc < 2:1854668/91‑1 (MQ=255) aaGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATAc > 2:818285/1‑91 (MQ=255) gagCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCg < 2:3084878/91‑1 (MQ=255) agCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGt > 2:2836387/1‑91 (MQ=255) agCTAGAAGAAGAAACTATCTTAAGGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTGAGTCTGTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGt < 2:2232532/91‑1 (MQ=18) gCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTa < 1:709752/91‑1 (MQ=255) cTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTaa > 1:277230/1‑91 (MQ=255) tAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTaaa > 2:2596482/1‑91 (MQ=255) aaTAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGAt > 2:1799064/1‑91 (MQ=255) aTAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATg < 2:67659/91‑1 (MQ=255) aTAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATg < 1:2680561/91‑1 (MQ=255) tAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGc < 1:2026359/91‑1 (MQ=255) tAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGc > 2:3208456/1‑91 (MQ=255) aCTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCtca > 2:3538613/1‑91 (MQ=255) aCTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCCTTGTTTAGTGTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAACAGATACCGTAATGTTGATGCtca > 2:3014956/1‑91 (MQ=18) aTCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCtcatca > 1:3217659/1‑91 (MQ=255) aTCTTAATGGAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCtcatca < 1:3781053/91‑1 (MQ=255) tCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTTATGCTCATCaa > 1:1207814/1‑91 (MQ=255) cTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCaaa < 1:2595713/91‑1 (MQ=255) cTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCaaa < 1:2284594/91‑1 (MQ=255) ttAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAaat > 1:2116901/1‑91 (MQ=255) tAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAaata < 1:1085166/91‑1 (MQ=255) aaTGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAaataa < 2:230043/91‑1 (MQ=255) aTGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAaataat > 2:2564293/1‑91 (MQ=255) aaGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAataataata > 2:2013586/1‑91 (MQ=255) aGACTAAACAAagctttattgtttagtctgacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttatt < 1:3165307‑M1/91‑81 (MQ=255) aGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCCTTATAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAGAGTTGATGCTCATCAAataataataa > 2:1543395/1‑90 (MQ=21) gACTAAACAAagctttattgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttatta > 1:2935703‑M1/1‑10 (MQ=255) gACTAAACAATAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttatta < 2:544253‑M2/91‑75 (MQ=255) aCTAAACAATAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattattctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaa < 2:1162267‑M2/91‑76 (MQ=255) cTAAACAATAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaat < 1:104720‑M2/91‑77 (MQ=255) cTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATaaa < 1:1798153/91‑1 (MQ=255) tAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAg < 2:270938/91‑1 (MQ=255) aaaCAAagctttattgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaattt < 1:1728341‑M1/91‑86 (MQ=255) aaaCAATAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaattt < 2:48199‑M2/91‑79 (MQ=255) aaaCAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAGa > 1:1001666/1‑91 (MQ=255) aaCAAagctttattgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttc < 2:2279672‑M1/91‑87 (MQ=255) aaCAAagctttattgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttc > 1:1263421‑M1/1‑5 (MQ=255) aaCAATAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttc < 2:2951913‑M2/91‑80 (MQ=255) aaCAATAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttc < 2:3865044‑M2/91‑80 (MQ=255) aaCAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAGAt > 1:3328988/1‑91 (MQ=255) aaCAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAGAt > 2:1252368/1‑91 (MQ=255) aaCAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAGAt < 2:2900589/91‑1 (MQ=255) aCAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAGATa > 1:843535/1‑91 (MQ=255) aCAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAGATa > 1:1436167/1‑91 (MQ=255) cAATAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttcat < 1:3428241‑M2/91‑82 (MQ=255) aaagctttattgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttcata > 2:672292‑M1/1‑2 (MQ=255) aaTAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttcata < 1:3850189‑M2/91‑83 (MQ=255) aagctttattgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttcatat < 1:603086‑M1/91‑91 (MQ=255) aTAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttcatat < 1:2943258‑M2/91‑84 (MQ=255) aTAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttcatat < 1:2521550‑M2/91‑84 (MQ=255) aTAAAGCTttgtttagtcttacattaagatagtttattcttctagctctttaatatattgctcgatttctttaactttattaatttcatat < 1:399837‑M2/91‑84 (MQ=255) aTAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAGATAAtt > 2:3853111/1‑91 (MQ=255) aTAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAACTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAGATAAtt > 2:3882951/1‑91 (MQ=255) | GAAACGGAATATGAAATTAATAAAGTTAAAGAAATCGAGCAATATATTAAAGAGCTAGAAGAATAAACTATCTTAATGTAAGACTAAACAATAAAGCTTTGTTTAGTCTTTTTAGCGTTTAAGTAAAAAGCAATAGATACCGTAAAGTTGATGCTCATCAAATAATAATATAAAGATAATT > USA300TCH1516_ALE/344336‑344516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |