| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 407101 | 132 (0.650) | 8 (0.050) | 7/136 | NT | 6.4% | intergenic (+16/+67) | USA300HOU_RS01880/kynB | putative acetyl‑CoA acyltransferase/Kynurenine formamidase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 407127 | 123 (0.710) | intergenic (+42/+41) | USA300HOU_RS01880/kynB | putative acetyl‑CoA acyltransferase/Kynurenine formamidase | |||||
TGAATGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/407000‑407101‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaacaggttatGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCAAT < USA300TCH1516_ALE/407127‑407038 TGAATGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGA > 2:249946/1‑91TGAATGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGCTGTATCAAAGTATAAATAATAAGA > 2:249772/1‑91 AATGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAA > 2:2879466/1‑91 AATGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAA > 1:2342666/1‑91 AATGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAA > 1:2342329/1‑91 ATGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAA > 1:964766/1‑91 ATGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTCGTATCAAAGTCTAAATAATAAGAAAA > 2:3429568/1‑91 TGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAAC > 1:1644363/1‑91 TGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAAC < 2:2062123/91‑1 GATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACA < 1:1436182/91‑1 GATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACA < 1:1914748/91‑1 ATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTGTCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAG > 2:2044063/1‑91 ATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAG > 1:673023/1‑91 ATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAG > 1:188660/1‑91 ATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAG > 1:3863848/1‑91 TGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGG < 2:2151639/91‑1 TGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGG < 1:2470135/91‑1 GAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGT > 1:960451/1‑91 AAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTT > 2:2621632/1‑91 AAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTT < 2:1323714/91‑1 AAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTT < 2:3421893/91‑1 AAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTT > 1:1468147/1‑91 AAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTT < 1:1570781/91‑1 GTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTAT > 1:2703267/1‑91 GTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTAT > 2:80603/1‑91 GTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTAT > 1:955105/1‑91 TGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATA < 2:310342/91‑1 GGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAGTAAGAAAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAA < 1:3138678/91‑1 GGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAA < 1:2040501/91‑1 GGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCT < 1:1691787/91‑1 GCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTG < 2:1601534/91‑1 AGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTT < 1:97046/91‑1 GCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTA < 1:496258/91‑1 GCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAACAA‑ATAAAAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTA < 1:1952726/91‑1 AAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGAC < 2:707952/91‑1 AAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGAC > 1:1432387/1‑91 AAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGAC > 2:714501/1‑91 AAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGAC > 1:2343744/1‑91 AAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGAC > 2:1854565/1‑91 AAACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGCTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGAC > 2:1854616/1‑91 AACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTAATTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACC > 2:662309/1‑91 ACAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCG < 2:2248662/91‑1 CAGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGCTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGC > 2:3444999/1‑91 AGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCC > 1:770902/1‑91 AGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCC > 1:3740465/1‑91 AGGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCC < 1:1738182/91‑1 GGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCA > 2:2575530/1‑91 GGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCA > 1:1142059/1‑91 GGTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTATGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCA < 1:3231721/91‑1 GTTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCAC > 2:1763322/1‑91 TTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACC > 1:684060/1‑91 TTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACC < 2:1698526/91‑1 TTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACC > 2:1230385/1‑91 TTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACC < 1:899626/91‑1 TTATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACC < 1:1119601/91‑1 TATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCA > 1:3824869/1‑91 TATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCA > 1:1833741/1‑91 TATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCA > 1:1821820/1‑91 ATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCAA > 2:1012348/1‑91 ATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCAA > 1:485254/1‑91 ATGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCAA < 1:2571245/91‑1 TGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCAAT < 1:102780/91‑1 TGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCAAT > 1:2802974/1‑91 TGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCAAT > 1:2105223/1‑91 TGAATGATGAAGTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/407000‑407101‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaacaggttatGCCAACATGTAATTAATACTGTTGTGATAACCTGTTTTCTTATTATTTATACTTTGATACAACTGCAGCGATAGCTTGACCGCCACCAAT < USA300TCH1516_ALE/407127‑407038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |