| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 407101 | 132 (0.650) | 8 (0.050) | 7/136 | NT | 6.4% | intergenic (+16/+67) | USA300HOU_RS01880/kynB | putative acetyl‑CoA acyltransferase/Kynurenine formamidase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 407127 | 123 (0.710) | intergenic (+42/+41) | USA300HOU_RS01880/kynB | putative acetyl‑CoA acyltransferase/Kynurenine formamidase | |||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
GTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTAATTGC > USA300TCH1516_ALE/407011‑407191 | gTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTAT > 2:80603‑M1/1‑91 (MQ=255) gAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATcac > 2:2077083/1‑91 (MQ=255) gAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATcac > 1:967324/1‑91 (MQ=255) aaaCTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATcaca < 1:408830/91‑1 (MQ=255) aaCTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCacaa > 1:3949913/1‑91 (MQ=255) aCTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCacaac > 1:3152809/1‑91 (MQ=255) aCTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCacaac < 2:384771/91‑1 (MQ=255) aCTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCacaac < 2:2899007/91‑1 (MQ=255) cTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTAATCacaaca > 2:1999569/1‑91 (MQ=255) aCATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCTAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTattaat < 1:3678042/91‑1 (MQ=255) aCATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTattaat < 1:1654762/91‑1 (MQ=255) aCATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTattaat < 2:2701241/91‑1 (MQ=255) aCATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTattaat < 2:1331/91‑1 (MQ=255) catcatTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTattaatt < 1:256976/91‑1 (MQ=255) catcatTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGCTATCACAACAGTattaatt > 1:1006673/1‑91 (MQ=255) atcatTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTattaatta > 2:3342261/1‑91 (MQ=255) catCGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACa < 1:3115844/91‑1 (MQ=255) atTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACAt < 1:1377379/91‑1 (MQ=255) ttGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATg < 2:744848/91‑1 (MQ=255) tATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGCTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGc > 2:1637972/1‑91 (MQ=255) aTTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCa > 1:2802974‑M2/1‑90 (MQ=255) aTTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCa < 1:102780‑M2/91‑2 (MQ=255) aTTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCa > 1:2105223‑M2/1‑90 (MQ=255) ttGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCat > 2:1012348‑M2/1‑89 (MQ=255) ttGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCat > 1:485254‑M2/1‑89 (MQ=255) tggtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATgccaacatgtaattaatactgttgtgata < 2:310342‑M1/91‑30 (MQ=255) tggtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCata > 1:1821820‑M2/1‑88 (MQ=255) tggtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCata > 1:1833741‑M2/1‑88 (MQ=255) tggtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCata > 1:3824869‑M2/1‑88 (MQ=255) aattaaaccatcaaatgactaatattacccaataaatccataaacaaataAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATa > 1:1447255‑M1/51‑91 (MQ=255) ggtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAGTAAGAAAACAGGTTATgccaacatgtaattaatactgttgtgataa < 1:3138678‑M1/91‑31 (MQ=255) ggtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataa > 1:684060‑M2/1‑87 (MQ=255) ggtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataa < 2:1698526‑M2/91‑5 (MQ=255) ggtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataa > 2:1230385‑M2/1‑87 (MQ=255) ggtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataa < 1:899626‑M2/91‑5 (MQ=255) ggtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataa < 1:1119601‑M2/91‑5 (MQ=255) gtggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataac > 2:1763322‑M2/1‑86 (MQ=255) tggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCATAACAGTATTAATTACATGTTGGCataacc < 1:3231721‑M2/91‑7 (MQ=255) tggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataacc > 1:1142059‑M2/1‑85 (MQ=255) ggCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataacct > 1:3740465‑M2/1‑84 (MQ=255) aaaccatcaaatgactaatattacccaataaatccataaacaaataAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCt > 1:2754378‑M1/47‑91 (MQ=255) gCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATCAGAAAACAGGTTATCACCACAGTATTAATTACATGTTGGAATCAACTg > 2:2536958/1‑91 (MQ=255) aaccatcaaatgactaatattacccaataaatccataaacaaataAAAACTGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTg > 2:3256517‑M1/46‑91 (MQ=255) cGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataacctgt < 2:2248662‑M2/91‑10 (MQ=255) gTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataacctgttt > 2:714501‑M2/1‑80 (MQ=255) aaGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTa < 2:3332667/91‑1 (MQ=255) aaGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTa > 1:388354/1‑91 (MQ=255) aGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTAt < 1:2231954/91‑1 (MQ=255) gCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTAtt > 2:3415637/1‑91 (MQ=255) cTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTAttt < 2:1312522/91‑1 (MQ=255) cTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTAt < 1:503558/91‑1 (MQ=255) tGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATg > 1:2652703/1‑91 (MQ=255) tGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATg < 1:1937983/91‑1 (MQ=255) gTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGAtt > 1:3367668/1‑91 (MQ=255) ttGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGAttt < 2:3897460/91‑1 (MQ=255) gTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTAt > 2:1861091/1‑91 (MQ=255) gTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTAt > 2:1186003/1‑91 (MQ=255) gTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTAt > 2:1790589/1‑91 (MQ=255) tATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGCTTTAtt > 1:725286/1‑91 (MQ=255) tCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTgg > 1:2290336/1‑91 (MQ=255) cAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTggg > 2:2444375/1‑91 (MQ=255) aGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTaa > 2:3175673/1‑91 (MQ=255) aGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTaa > 2:472849/1‑91 (MQ=255) gTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAat < 1:695690/91‑1 (MQ=255) tataAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGTTTTATTGGGTAata > 1:3617007/1‑91 (MQ=255) ataaataaTAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAatat < 2:2320430/91‑1 (MQ=255) taaataaTAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataacctgtttttatttgtttatactttgatacaactgcagc < 1:1952726‑M2/91‑43 (MQ=255) taaataaTAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATAtt < 2:3792287/91‑1 (MQ=255) aataatAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAg < 2:279901/91‑1 (MQ=255) aataatAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAg > 2:1558256/1‑91 (MQ=255) ataaGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCAt < 1:2824508/91‑1 (MQ=255) taaGAAAACAGGTTATCACCACAGTATTAATTCCATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTCATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCAtt > 2:2354849/1‑91 (MQ=255) aaGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataacctgttttcttattatttatactttgatacaactgcagcgatagct < 1:97046‑M2/91‑51 (MQ=255) aGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTg < 1:2075398/91‑1 (MQ=255) gAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGa > 1:3816977/1‑91 (MQ=255) AAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGAt < 2:1947000‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGATTTTATTTGTATATGGAATTATTGGGTAATATTAGTCTTTTGAt < 2:1516830‑M1/91‑1 (MQ=255) aaaCAGGTTATgccaacatgtaattaatactgttgtgataacctgttttcttattatttatactttgatacaactgcagcgatagcttgac < 2:707952‑M1/91‑81 (MQ=255) aaaCAGGTTATgccaacatgtaattaatactgttgtgataacctgttttcttattatttatactttgatacaactgcagcgatagcttgac > 1:2343744‑M1/1‑11 (MQ=255) aaaCAGGTTATgccaacatgtaattaatactgttgtgataacctgctttcttattatttatactttgatacaactgcagcgatagcttgac > 2:1854616‑M1/1‑11 (MQ=255) aaCAGGTTATgccaacatgtaattaatactgttgtgataacctgttttcttattaattatactttgatacaactgcagcgatagcttgacc > 2:662309‑M1/1‑10 (MQ=255) ACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGt > 1:1220883‑M1/1‑91 (MQ=255) ACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGt < 2:1684479‑M1/91‑1 (MQ=255) cAGGTTATgccaacatgtaattaatactgctgtgataacctgttttcttattatttatactttgatacaactgcagcgatagcttgaccgc > 2:3444999‑M1/1‑8 (MQ=255) aGGTTATgccaacatgtaattaatactgttgtgataacctgttttcttattatttatactttgatacaactgcagcgatagcttgaccgcc > 1:770902‑M1/1‑7 (MQ=255) aGGTTATgccaacatgtaattaatactgttgtgataacctgttttcttattatttatactttgatacaactgcagcgatagcttgaccgcc < 1:1738182‑M1/91‑85 (MQ=255) aGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataacctgttttcttattatttatactttgatacaactgcagcgatagcttgaccgcc < 1:1691787‑M2/91‑59 (MQ=255) AGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGttt > 1:3754839‑M1/1‑91 (MQ=255) acTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGATTTa < 1:3291273‑M1/89‑1 (MQ=255) acTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGAGTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTa < 1:1768030‑M1/89‑1 (MQ=255) GGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTa < 2:1923492‑M1/91‑1 (MQ=255) GTTATCAGAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTaa > 2:3512681‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTaa > 1:835107‑M1/1‑91 (MQ=255) ttATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCataacctgttttcttattatttatactttgatacaactgcagcgatagcttgaccgccacc < 1:2040501‑M2/91‑62 (MQ=255) TTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTAAt > 2:2821693‑M1/1‑91 (MQ=255) TATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTAAtt > 1:2587396‑M1/1‑91 (MQ=255) TATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTAAtt < 1:458104‑M1/91‑1 (MQ=255) TATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTAAtt < 2:1101033‑M1/91‑1 (MQ=255) ATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTAATTg < 1:2417707‑M1/91‑1 (MQ=255) TCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATCTTAGTCATTTGCTGGTTTAATTGc < 2:3666579‑M1/91‑1 (MQ=255) | GTTGAAACTGGTTTAACATCATTGTGTATTGGTGGCGGTCAAGCTATCGCTGCAGTTGTATCAAAGTATAAATAATAAGAAAACAGGTTATCACAACAGTATTAATTACATGTTGGCATAACCTGTTTTTATTTGTTTATGGATTTATTGGGTAATATTAGTCATTTGATGGTTTAATTGC > USA300TCH1516_ALE/407011‑407191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |