| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1172339 | 162 (0.800) | 28 (0.170) | 9/130 | NT | 16.3% | coding (248/282 nt) | USA300HOU_RS05840 | hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1172348 | 156 (0.950) | coding (239/282 nt) | USA300HOU_RS05840 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
AAACTTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/1172235‑1172339‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tagagcctaagacatTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTTTAA < USA300TCH1516_ALE/1172348‑1172259 AAACTTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAAT < 1:253726/91‑1AAACTTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAAT > 1:216858/1‑91AAACTTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAAT < 1:1673171/91‑1 AACTTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATA > 1:1088301/1‑91 AACTTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATA > 1:814246/1‑91 ACTTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAG < 2:208147/91‑1 CTTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGA > 2:2382458/1‑91 TTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAG > 1:2755368/1‑91 TTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAG < 2:2971908/91‑1 TATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCC < 1:771538/91‑1 TATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCC < 2:685099/91‑1 ATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCT < 2:1190999/91‑1 ATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCT < 1:1818990/91‑1 ATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCT > 1:1327195/1‑91 TAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTA < 2:2016201/91‑1 gGTTACGAAGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAA < 1:1689950/90‑1 AGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGATATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAA > 2:1032721/1‑91 GTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAG > 1:2839406/1‑91 GTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGCACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAG < 1:1611972/91‑1 TTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGA < 2:1698769/91‑1 TTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGA > 2:2172122/1‑91 TTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGA < 2:3172596/91‑1 TTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGA < 1:35932/91‑1 TTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGA > 1:581094/1‑91 TTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGA < 2:3727759/91‑1 TTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGATATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGA < 1:3427237/91‑1 TACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGAC < 1:336218/91‑1 TACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGAC > 2:2901275/1‑91 TACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGAC < 1:2160166/91‑1 TACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGAC < 1:2474776/91‑1 ACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA < 2:2657292/91‑1 ACTATGTCTCATCAAAAGAACACTAATCAAGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA > 1:299039/1‑91 CTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACAT > 1:3531453/1‑91 CTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACAT < 2:3706612/91‑1 ATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTG < 2:12277/91‑1 ATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTG < 1:1144421/91‑1 ATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATT < 1:774313/91‑1 ATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATT < 1:2594694/91‑1 ATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATT < 1:1078003/91‑1 TTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTA < 2:2756855/91‑1 TTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTA < 1:1204082/91‑1 TTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTA < 1:1204269/91‑1 TTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTA < 1:1462298/91‑1 TTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTA < 1:3914526/91‑1 TTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTA < 2:1062327/91‑1 TTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTA < 2:3025079/91‑1 TAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTAT < 2:1245821/91‑1 TAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTAT < 1:2970451/91‑1 GAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTT < 1:2456184/91‑1 ACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGC < 2:2993189/91‑1 CTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCT < 1:3359518/91‑1 TAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTC < 2:1456509/91‑1 TCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTAT < 1:675518/91‑1 TTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGTGCCTAAGACTTTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTA < 1:3574186/91‑1 ATAGAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGA < 2:3926208/91‑1 TAGAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGAT < 1:1990348/91‑1 AGAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATT > 2:2155583/1‑91 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCTTTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA > 2:2956615/1‑91 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA > 2:1681895/1‑91 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA > 2:1682154/1‑91 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA > 2:3449715/1‑91 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA > 2:767260/1‑91 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA < 1:662831/91‑1 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA < 1:1856924/91‑1 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA < 1:315641/91‑1 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA < 1:2666263/91‑1 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA > 1:3330672/1‑91 GAGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAACTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTA > 2:1548965/1‑91 AGCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAG < 1:2493497/91‑1 GCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGT > 1:1474983/1‑91 GCCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGT < 2:3229007/91‑1 CCTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTG < 2:2729050/91‑1 CTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGT < 1:471191/91‑1 CTAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGT > 1:718836/1‑91 TAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTT < 2:335540/91‑1 TAAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTT < 2:335703/91‑1 AAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTC < 2:3707958/91‑1 AAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTC < 1:1917289/91‑1 AAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTC < 1:3054742/91‑1 AAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTC > 1:1079113/1‑91 AAGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTC < 2:2397241/91‑1 AGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCACTACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCT > 2:2614898/1‑91 AGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCT < 2:142615/91‑1 AGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCT > 2:2615118/1‑91 AGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCT > 1:2217153/1‑91 AGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCT > 1:2516174/1‑91 AGACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAAGTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCT < 2:2493646/91‑1 GACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAGATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTT < 1:348375/91‑1 GACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTT < 1:3157605/91‑1 GACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTT > 1:3017661/1‑91 ACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTT > 1:2473597/1‑91 ACATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTT > 1:76283/1‑91 CATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTTT > 2:2829910/1‑91 CATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTTT > 1:1952802/1‑91 CATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTTT < 2:2715837/91‑1 CATTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTTT < 1:889381/91‑1 TTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTTTAA > 1:3739083/1‑91 TTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTTTAA > 1:3753341/1‑91 TTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTTTAA > 1:3753417/1‑91 TTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTTTAA > 1:676141/1‑91 AAACTTTATAGTTACTATGTCTCATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/1172235‑1172339‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tagagcctaagacatTGATTTATTATGTCTTAGGCTCTATTCCTTCATTTAATGATTAAATTATTATAGCAATACTTTATTGTCCCATGATTAGTGTTCTTTTAA < USA300TCH1516_ALE/1172348‑1172259 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |