| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1172339 | 162 (0.800) | 28 (0.170) | 9/130 | NT | 16.3% | coding (248/282 nt) | USA300HOU_RS05840 | hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1172348 | 156 (0.950) | coding (239/282 nt) | USA300HOU_RS05840 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
ATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAGGCGGGGCCC > USA300TCH1516_ALE/1172258‑1172438 | aTTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCa < 2:2525014/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAa > 1:3753417‑M2/1‑90 (MQ=255) ttAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAa > 1:1900670‑M2/1‑90 (MQ=255) aaaaGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatg > 1:1952802‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaaGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatg < 2:2715837‑M2/91‑4 (MQ=255) aaaGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgt > 1:2473597‑M2/1‑87 (MQ=255) aaaGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgt > 1:76283‑M2/1‑87 (MQ=255) aaaGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgt < 1:2124739‑M2/91‑5 (MQ=255) aGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtct < 2:142615‑M2/91‑7 (MQ=255) aGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtct > 1:2217153‑M2/1‑85 (MQ=255) aGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTAGTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtct > 2:2614898‑M2/1‑85 (MQ=255) gAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtctt < 2:2397241‑M2/91‑8 (MQ=255) aaCACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtctta < 2:335703‑M2/91‑9 (MQ=255) acTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtcttaggc < 2:2685073‑M2/91‑12 (MQ=255) cTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtcttaggct > 2:2984672‑M2/1‑79 (MQ=255) tAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAGTTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtcttaggctc > 2:1548965‑M2/1‑78 (MQ=255) tAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtcttaggctc < 1:315641‑M2/91‑14 (MQ=255) tAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtcttaggctc < 1:662831‑M2/91‑14 (MQ=255) tAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtcttaggctc < 1:2666263‑M2/91‑14 (MQ=255) tAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtcttaggctc > 2:3449715‑M2/1‑78 (MQ=255) tGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAat > 2:1053034/1‑91 (MQ=255) tGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAat > 1:704434/1‑91 (MQ=255) gggACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAata > 1:181948/1‑91 (MQ=255) gggACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAata < 1:2990809/91‑1 (MQ=255) gACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAatata < 2:2924479/91‑2 (MQ=255) aaTATAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TATTAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAatattata > 2:1195313/1‑91 (MQ=255) aaTAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAGTAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAatattata < 2:1965731/91‑1 (MQ=255) aaTAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAatattata < 1:1340779/91‑1 (MQ=255) aaTAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAatattata < 2:330983/91‑1 (MQ=255) aGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGgt < 1:769947/91‑1 (MQ=255) aGTATTGCTATAATAATTTAATCATAAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGgt > 1:2502076/1‑91 (MQ=255) ttGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGgtagta > 2:3908087/1‑91 (MQ=255) ttGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGgtagta > 2:1832647/1‑91 (MQ=255) ttGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGgtagta > 1:1216619/1‑91 (MQ=255) gCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTagtagt > 2:1468020/1‑91 (MQ=255) gCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTagtagt > 1:1037664/1‑91 (MQ=255) gCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTagtagt > 1:2820609/1‑91 (MQ=255) ataataATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGa > 1:88749/1‑91 (MQ=255) ataatTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCg < 1:1002556/91‑1 (MQ=255) atTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAAt > 2:3757032/1‑91 (MQ=255) tttAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATg < 2:3392053/91‑1 (MQ=255) tttAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATg < 2:2825778/91‑1 (MQ=255) tttAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATg < 1:1702300/91‑1 (MQ=255) tttAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATg < 1:334240/91‑1 (MQ=255) tAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAaagtcttaggcactattccttcatttaatgattaaattattatagcaa < 1:3574186‑M2/91‑49 (MQ=255) aTCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATATATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGaaaa < 2:2078182/91‑1 (MQ=255) aTCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGaaaa < 1:3936280/91‑1 (MQ=255) aTCATTAAATGAAGGAAGAGAGCCTAAGACA‑TAAGAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATGGGTAGTAGTTGACCGAATGaaaa < 2:2313204/91‑1 (MQ=255) tCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAAt > 2:860688/1‑91 (MQ=255) cATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATg < 2:1905561/91‑1 (MQ=255) aTTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGc > 2:2536719/1‑91 (MQ=255) aTTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGc < 1:3108822/91‑1 (MQ=255) aTTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGc < 1:362647/91‑1 (MQ=255) ttAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGcc > 1:3438483/1‑91 (MQ=255) ttAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGcc > 1:3840026/1‑91 (MQ=255) tAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGccc > 2:1995638/1‑91 (MQ=255) tAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGccc > 1:2677087/1‑91 (MQ=255) tAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGccc < 2:2762281/91‑1 (MQ=255) aaTGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCAt < 2:742136/91‑1 (MQ=255) aGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAAc > 2:2177870/1‑91 (MQ=255) aGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAAc > 2:665014/1‑91 (MQ=255) ggAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACa < 1:630479/91‑1 (MQ=255) gAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACaa > 2:3652778/1‑91 (MQ=255) gAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGAACGAATGAAAATGCCCATGTAACaa < 1:2633364/91‑1 (MQ=255) aaTAGAGCCTAAGACATTGATTTAT‑TATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAg > 1:994311/1‑91 (MQ=21) aaTAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAg < 2:1161744/91‑1 (MQ=255) aTAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatga < 1:675518‑M2/91‑67 (MQ=255) agagCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTCCAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAACATGCCCATGTAACAAGCAt > 2:974999/1‑91 (MQ=255) agagCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCAt > 1:488837/1‑91 (MQ=255) gagCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCAtt > 2:3515886/1‑91 (MQ=255) gagCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCAtt > 1:370951/1‑91 (MQ=255) agCCTAAGACA‑TAATAAATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattag < 1:3359518‑M2/91‑71 (MQ=255) agCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCAttt > 2:3063264/1‑91 (MQ=255) cTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTc > 2:2692297/1‑91 (MQ=255) tAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCa < 2:2450083/91‑1 (MQ=255) aaGACA‑TAATAAATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattagtgttc < 1:2456184‑M2/91‑76 (MQ=255) aGACA‑TAGTAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAAt > 2:1371411/1‑91 (MQ=255) aCA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATta > 1:3824437/1‑91 (MQ=255) a‑taataAATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattagtgttctttta < 1:2970173‑M2/91‑81 (MQ=255) a‑taataAATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattagtgttctttta < 2:1245821‑M2/91‑81 (MQ=255) taataaATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattagtgttcttttaa < 2:1062327‑M2/91‑82 (MQ=255) taataaATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattagtgttcttttaa < 1:1204080‑M2/91‑82 (MQ=255) taataaATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattagtgttcttttaa < 1:1462298‑M2/91‑82 (MQ=255) taataaATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattagtgttcttttaa < 2:3025079‑M2/91‑82 (MQ=255) taataaATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattagtgttcttttaa < 2:3218806‑M2/91‑82 (MQ=255) taataaATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAg < 1:1394381/91‑1 (MQ=255) taataaATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAg < 1:2919004/91‑1 (MQ=255) taataaATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAg < 1:2553496/91‑1 (MQ=255) aataaATCAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattagtgttcttttaat < 1:2594694‑M2/91‑83 (MQ=255) aataaATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAgg < 1:1564475/91‑1 (MQ=255) ataaATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAGGc > 1:2372509/1‑91 (MQ=255) taaATCAGTGTCTTAGGCTCTACAATCTTATGTTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAGGCg < 2:93033/91‑1 (MQ=255) taaATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAGGCg < 1:203803/91‑1 (MQ=255) aaaTCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAGGCgg < 1:317027/91‑1 (MQ=255) aaaTCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAGGCgg > 1:534144/1‑91 (MQ=255) tCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAGGCGGGGc < 1:33205/91‑1 (MQ=255) tCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAGGCGGGGc > 2:898294/1‑91 (MQ=255) cAatgtcttaggctctattccttcatttaatgattaaattattatagcaatactttattgtcccatgattagtgttcttttaatgagacat < 1:1144421‑M2/91‑90 (MQ=255) cAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAGGCGGGGcc < 1:823965/91‑1 (MQ=255) cAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCAAGTAACAAGCATTTTACAATTATAGGCGGGGcc > 1:3386894/1‑91 (MQ=255) | ATTAAAAGAACACTAATCATGGGACAATAAAGTATTGCTATAATAATTTAATCATTAAATGAAGGAATAGAGCCTAAGACA‑TAATAAATCAATGTCTTAGGCTCTACAATATTATATTGGTAGTAGTTGACCGAATGAAAATGCCCATGTAACAAGCATTTTTCAATTATAGGCGGGGCCC > USA300TCH1516_ALE/1172258‑1172438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |