| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1227672 | 183 (0.970) | coding (141/489 nt) | def1 | Peptide deformylase 1 | |||||
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
CTATTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGT > USA300TCH1516_ALE/1227566‑1227746 | tATTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACaa > 1:1737869/1‑91 (MQ=255) tATTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACaa < 2:1158491/91‑1 (MQ=255) aTTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACaag > 2:1530914/1‑91 (MQ=255) tttAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACaagaa < 1:207087/91‑1 (MQ=255) ttAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACaagaag < 1:452172/91‑1 (MQ=255) aaCGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAGCATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAgct < 2:3143036/91‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |