New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1227656 | 179 (0.880) | 12 (0.060) | 8/148 | NT | 6.4% | coding (125/489 nt) | def1 | Peptide deformylase 1 |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1227672 | 183 (0.970) | coding (141/489 nt) | def1 | Peptide deformylase 1 |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGAAAATTATT > USA300TCH1516_ALE/1227583‑1227762 | gcgcAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAt < 1:11621‑M2/91‑2 (MQ=255) gcgcAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAt > 1:2670627‑M2/1‑90 (MQ=255) cgcAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtg > 2:1027391‑M2/1‑89 (MQ=255) cAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtgtg > 2:2282707‑M2/1‑87 (MQ=255) cAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtgtg > 1:3849189‑M2/1‑87 (MQ=255) aaGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtgtgc > 1:3745899‑M2/1‑86 (MQ=255) aGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtgtgca > 2:1805721‑M2/1‑85 (MQ=255) gCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCAc < 1:1936333/91‑1 (MQ=255) gTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTc > 1:2782026/1‑91 (MQ=255) ttAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCa < 2:2435728/91‑1 (MQ=255) tAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCaa < 1:2547950/91‑1 (MQ=255) tAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCaa < 2:1377846/91‑1 (MQ=255) aaaaCATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCaaa < 2:3489713/91‑1 (MQ=255) aaaCATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAAt > 2:3263449/1‑91 (MQ=255) aaaCATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATCACAAGCTTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGCGCACCTCAAAt > 2:798647/1‑91 (MQ=255) aTTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAAt > 2:1306552/1‑91 (MQ=255) aTTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAAt < 2:1202794/91‑1 (MQ=255) tttGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATc > 2:2060135/1‑91 (MQ=255) tttGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATc > 1:580548/1‑91 (MQ=255) tttGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATc > 2:841806/1‑91 (MQ=255) ttGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCa > 2:3077743/1‑91 (MQ=255) tgatTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCa > 1:738370/1‑91 (MQ=255) gatTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCAt > 1:640249/1‑91 (MQ=255) gatTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGAACCTCAAATTAATCAGTCAt > 2:1463588/1‑91 (MQ=255) tCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGc < 2:1054967/91‑1 (MQ=255) tCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGc < 1:1584207/91‑1 (MQ=255) cGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCa > 1:3458063/1‑91 (MQ=255) cGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCa > 2:775514/1‑91 (MQ=255) ttAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAg > 1:3669037/1‑91 (MQ=255) tAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGt < 1:1059206/91‑1 (MQ=255) tAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGt < 2:685821/91‑1 (MQ=255) aaaaaGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTg < 1:3563116/91‑1 (MQ=255) aaaaGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTgg < 1:929802/91‑1 (MQ=255) aaaaGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTgg > 1:2010970/1‑91 (MQ=255) aaaaGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTgg < 2:41588/91‑1 (MQ=255) aaaaGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTgg < 1:283889/91‑1 (MQ=255) aaaaGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTgg < 2:3132116/91‑1 (MQ=255) aaaaGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTgg < 1:1691130/91‑1 (MQ=255) ctaGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCACGTGGc > 2:2707837/3‑91 (MQ=255) aaGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCa < 2:1980318/91‑1 (MQ=255) aGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAATTGGCaa < 1:3080109/91‑1 (MQ=255) gATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAat < 2:138596/91‑1 (MQ=255) ttattaCAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAatta > 2:2154863/1‑91 (MQ=255) attaCAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAattatt > 1:2358467/1‑91 (MQ=255) attaCAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCGCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAattatt > 1:3237544/1‑91 (MQ=255) ttaCAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTg > 2:2478106/1‑91 (MQ=255) ttaCAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTg < 2:2795949/91‑1 (MQ=255) ttaCAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTg > 1:1188439/1‑91 (MQ=255) taCAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGa < 1:1843461/91‑1 (MQ=255) taCAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGa > 2:484068/1‑91 (MQ=255) gATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATatgg > 1:178852/1‑91 (MQ=255) atgtAGAAGATACAATGGATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCGAAGTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATatgga < 2:1130466/88‑1 (MQ=255) ttAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATatggaaa > 2:2727360/1‑91 (MQ=255) ttAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATatggaaa > 2:919739/1‑91 (MQ=255) tAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATatggaaat < 2:1677154/91‑1 (MQ=255) aagaTACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATatggaaatgga > 1:2266789/1‑91 (MQ=255) agaTACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATatggaaatggaa > 2:3576816/1‑91 (MQ=255) tACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGa < 1:3057771/91‑1 (MQ=255) cAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGatt < 1:367935/91‑1 (MQ=255) aaTGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGatta < 2:3921971/91‑1 (MQ=255) tGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGattatt < 1:2157460/91‑1 (MQ=255) gTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtgtgcatacattgtatcttctaaatcttgtaataatctttttaacgaatcatcaaatgttttaact < 2:2363216‑M2/91‑67 (MQ=255) tATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtgtgcatacattgtatcttctaaatcttgtaataatctttttaacgaatcatcaaatgttttaactg < 1:3840139‑M2/91‑68 (MQ=255) tATGCACAAGAAGATGATGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGCTTATTAc > 2:1574373/1‑91 (MQ=255) gaTGCACAAGAAACTGCTGGCTTATGGGCACCTCAAATTAATCAGTCAGTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTAc < 1:3924671/90‑1 (MQ=255) aTGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACa > 2:2921514/1‑91 (MQ=255) tGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACaa > 2:3203676/1‑91 (MQ=255) cacaAGAAGCTGCTGGCTTAtgtgcatacattgtatcttctaaatcttgtaataatctttttaacgaatcatcaaatgttttaactgcttg < 1:728333‑M2/91‑72 (MQ=255) cacaAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACt < 1:2563362/91‑1 (MQ=255) acaAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACtt > 2:1267519/1‑91 (MQ=255) acaAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACtt > 1:351275/1‑91 (MQ=255) acaAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGACATGGACATGGAAGGATTATTACAACtt > 2:146240/1‑91 (MQ=255) aagaagCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGt > 2:2667738/1‑91 (MQ=255) agaagCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGtt < 2:3427773/91‑1 (MQ=255) gaagCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTa < 2:3697874/91‑1 (MQ=255) aagCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTaa > 1:1320024/1‑91 (MQ=255) agCTGCTGGCTTAtgtgcatacattgtatcttctaaatcttgtaatagtctttttaacgaatcatcaaatgttttaactgcttgcgctttt < 1:1905088‑M2/91‑79 (MQ=255) gctgctGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATc > 1:888737/1‑91 (MQ=255) ctgctgGCTTAtgtgcatacattgtatcttctaaatcttgtaataatctttttaacgaatcatcaaatgttttaactgcttgcgctttttt < 2:3792626‑M2/91‑81 (MQ=255) ctgctgGCTTAtgtgcatacattgtatcatctacatcttgtaataatctttttaacgaatcatcaaatgttttaactgcttgcgctttttt < 1:1641032‑M2/91‑81 (MQ=255) ctgctgGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATcc < 1:794460/91‑1 (MQ=255) ctgctgGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATcc > 1:1777742/1‑91 (MQ=255) tgctgGCTTAtgtgcatacattgtatcttctaaatcttgtaataatctttttaacgaatcatcaaatgttttaactgcttgcgcttttttc < 2:3743569‑M2/91‑82 (MQ=255) tgctgGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTTATCCg > 2:3382285/1‑91 (MQ=255) tgctgGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCg > 2:746662/1‑91 (MQ=255) gctgGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGa > 1:1296295/1‑91 (MQ=255) gctgGCTTATGCGCACCTCAAATTAACCAGTCCTTGCAAGTGGCAACTATTGATATGGAGATGGAAGGATTCTTACAACTTGTTAATCCGa > 2:2593364/1‑91 (MQ=255) ctgGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTCTTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAAGTTGTTAATCCGaa > 1:3960572/1‑91 (MQ=255) ctgGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGaa > 2:2062618/1‑91 (MQ=255) ctgGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGaa > 1:43713/1‑91 (MQ=255) tgGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGaaa < 1:2319564/91‑1 (MQ=255) tgGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGaaa < 2:1350647/91‑1 (MQ=255) tgGCTTACGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGaaa < 1:1974506/91‑1 (MQ=255) ggCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGaaaa > 1:3408331/1‑91 (MQ=255) cTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTGATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGAAAatt > 2:2243234/1‑91 (MQ=255) tATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGAAAattat < 1:2772011/91‑1 (MQ=255) aTGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGAAAattatt > 1:2880403/1‑91 (MQ=255) aTGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGAAAattatt > 2:609275/1‑91 (MQ=255) aTGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGAAAattatt > 1:1374845/1‑91 (MQ=255) aTGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGAAAattatt > 1:687664/1‑91 (MQ=255) | GCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTGTTAATCCGAAAATTATT > USA300TCH1516_ALE/1227583‑1227762 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |