| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1239557 | 163 (0.800) | 24 (0.150) | 18/124 | NT | 13.8% | intergenic (+24/‑166) | USA300HOU_RS06160/recG | hypothetical protein/ATP‑dependent DNA helicase RecG |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1239571 | 175 (1.110) | intergenic (+38/‑152) | USA300HOU_RS06160/recG | hypothetical protein/ATP‑dependent DNA helicase RecG | |||||
Only 100 of 368 total aligned reads displayed.
AGATGTAGAAGTGGAAGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGAGTTGCTAACAATGTCAT > USA300TCH1516_ALE/1239467‑1239647 | aTGTAGAAGTGGAAGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑Tg < 2:1654063/91‑1 (MQ=255) gAAGTGGAAGTTAATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATaaa > 1:3045588/1‑91 (MQ=255) aGTGGAAGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAatc > 1:534316/1‑91 (MQ=255) aGTGGAAGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAatc > 2:3851864/1‑91 (MQ=255) gAAGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAAtcatca > 2:2250992/1‑91 (MQ=255) aaGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAg < 2:491247/91‑1 (MQ=255) aGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAActgatgatttatcat < 2:3250400‑M1/91‑16 (MQ=255) aGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGt < 1:1088632‑M2/91‑2 (MQ=255) aGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGt < 1:382672‑M2/91‑2 (MQ=255) aGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGt < 1:2853120‑M2/91‑2 (MQ=255) aGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGt < 1:1209240‑M2/91‑2 (MQ=255) aGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTGCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGt > 2:1208366‑M2/1‑90 (MQ=255) ttCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAActgatgatttatcattg < 1:2195346‑M1/91‑18 (MQ=255) tCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAActgatgatttatcattgg < 1:2688347‑M1/91‑19 (MQ=255) tCATGAAGGTGAACAATAAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAActgatgatttatcattgg < 2:3172017‑M1/91‑19 (MQ=255) cATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAActgatgatttatcattggt < 2:2740299‑M1/91‑20 (MQ=255) cATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggt > 1:2472418‑M2/1‑86 (MQ=255) aTGTAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggta > 1:3065688‑M2/1‑85 (MQ=255) tGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtag < 2:1489175‑M2/91‑8 (MQ=255) gAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagt < 1:3518050‑M2/91‑9 (MQ=255) gAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagt > 2:1183874‑M2/1‑83 (MQ=255) aGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttt > 2:528247‑M2/1‑81 (MQ=255) gTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAACTGATGATTTATCAtggtagttttt > 1:1982718‑M2/1‑80 (MQ=255) gTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttt > 1:2134271‑M2/1‑79 (MQ=255) atagacaACAAAATTATCACTCTTCCTGTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAActgatgatttatcattggtagttttt < 2:1233327‑M1/88‑27 (MQ=255) gACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttat < 1:1628735‑M2/91‑16 (MQ=255) gACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttat > 1:3313594‑M2/1‑76 (MQ=255) aCAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttatt < 1:3862724‑M2/91‑17 (MQ=255) aCAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttatt > 2:112675‑M2/1‑75 (MQ=255) cAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAACATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttattt < 1:2877979‑M2/91‑18 (MQ=255) cAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAACTGATGATTTATCAtggtagttttttattt > 2:2848308‑M2/1‑75 (MQ=255) aCCAATTTATCAATATTTCTTTTCTTTTGTATTAAAATTTCAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttattttt < 2:3667287‑M2/91‑20 (MQ=255) aCCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTg < 2:2550038/91‑1 (MQ=255) ccAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGc < 1:1022363/91‑1 (MQ=255) cAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCt < 2:238353/91‑1 (MQ=255) aaTTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTa > 2:1302940/1‑91 (MQ=255) aTTTATCAATATTTCTATTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTAt < 2:3535243/91‑1 (MQ=255) cAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGt > 2:81215/1‑91 (MQ=255) cAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGt < 1:3026533/91‑1 (MQ=255) aaTATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTg > 2:2824505/1‑91 (MQ=255) atatTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGa > 2:591567/1‑91 (MQ=255) tatTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGat > 1:3649582/1‑91 (MQ=255) tatTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGat < 1:2327404/91‑1 (MQ=255) atTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGata > 2:1832234/1‑91 (MQ=255) tCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTg > 1:1394354/1‑91 (MQ=255) tCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTg > 2:2758424/1‑91 (MQ=255) tCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTg > 2:2100493/1‑91 (MQ=255) ttttCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCg < 1:1295647/91‑1 (MQ=255) tttCAGTAGGATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCgg < 2:3731461/91‑1 (MQ=255) tttCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCgg < 1:2756435/91‑1 (MQ=255) ttCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCggg > 1:2573312/1‑91 (MQ=255) ttCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCggg > 2:2703771/1‑91 (MQ=255) ttCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCggg > 1:615063/1‑91 (MQ=255) tCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGt < 1:973201/91‑1 (MQ=255) cAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTCTTTTGCTCTTTTAGTGATATTGCGGGtt > 2:1008902/1‑91 (MQ=255) aGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTa < 1:2075675/91‑1 (MQ=255) gAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAg > 1:1750896/1‑91 (MQ=255) aTAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTa < 1:2409433/91‑1 (MQ=255) aaaaaTTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGGGATATTGCGGGTTAAAAGTATc < 2:2941873/91‑1 (MQ=255) aaaaTTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCg < 1:3881319/91‑1 (MQ=255) aaaaTTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCg < 2:710084/91‑1 (MQ=255) aaTTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGtt < 1:2264759/91‑1 (MQ=255) aaTTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGtt > 2:2624226/1‑91 (MQ=255) tttAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTtct > 2:3210453/1‑91 (MQ=255) tttAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTtct < 2:3279663/91‑1 (MQ=255) ttAAAATAAAAAACTACCAAtgataaatcatcagttggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattgg > 2:1554772‑M1/1‑20 (MQ=255) taaaataaaaAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCg < 1:836247/91‑1 (MQ=255) taaaataaaaAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCg > 1:3844899/1‑91 (MQ=255) caaaataaaaAACTACCAACTGATGATTTATCA‑TTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCg > 2:742174/2‑91 (MQ=17) aaaataaaaAACTACCAAtgataaatcatcagttggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggtt > 1:361822‑M1/1‑18 (MQ=255) aaaataaaaAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGa > 1:900938/1‑91 (MQ=255) aataaaaAACTACCAAtgataaatcatcagttggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgt > 1:466973‑M1/1‑16 (MQ=255) aataaaaAACTACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgt > 1:3479510‑M1/1‑16 (MQ=255) aataaaaAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGAGt > 2:3472453/1‑91 (MQ=255) aataaaaAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGAGt > 1:1511311/1‑91 (MQ=255) aataaaaAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGAGt > 1:379959/1‑91 (MQ=255) ataaaaAACTACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtc > 1:3311858‑M1/1‑15 (MQ=255) ataaaaAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGAGtt > 1:707525/1‑91 (MQ=255) ataaaaAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGAGtt < 2:1424606/91‑1 (MQ=255) taaaaAACTACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtcc < 2:569841‑M1/91‑78 (MQ=255) taaaaAACTACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtcc < 2:2511811‑M1/91‑78 (MQ=255) aaaaCTACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccacc < 2:2691528‑M1/91‑81 (MQ=255) aaaCTACCAACTGATGATTTATCA‑TTGGTAGTTTTTTATTTTTCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGAGTTGCTaa > 1:3566666/1‑91 (MQ=18) aaCTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGAGTTGCTAAc < 2:1932526/91‑1 (MQ=255) aCTACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttc > 1:2260764‑M1/1‑8 (MQ=255) aCTACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttc > 1:3603992‑M1/1‑8 (MQ=255) aCTACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttc < 1:2936483‑M1/91‑84 (MQ=255) cTACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttca > 1:1482975‑M1/1‑7 (MQ=255) cTACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttca < 2:2416694‑M2/91‑71 (MQ=255) cTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGCGTTGCTAACaa > 1:3583658/1‑91 (MQ=255) tACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttcat < 1:2728214‑M1/91‑86 (MQ=255) tACCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttcat < 1:2728746‑M1/91‑86 (MQ=255) tACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttcat < 2:2320140‑M2/91‑72 (MQ=255) tACCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttcat < 2:3929836‑M2/91‑72 (MQ=255) tACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGAGTTGCTAACAAt < 2:1104713/91‑1 (MQ=255) aCCAActgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttcatg < 2:233258‑M1/91‑87 (MQ=255) aCCAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaacaaatattgataaattggttgtccaccttcttg < 2:2437845‑M2/91‑73 (MQ=255) cAA‑TGATAAATCATCAGttggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttcatgaa < 2:1583230‑M2/91‑75 (MQ=255) actgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttcatgaact < 1:1209204‑M1/91‑91 (MQ=255) actgatgatttatcattggtagttttttattttaaatttttattctactgaaaagaaatattgataaattggttgtccaccttcatgaact < 1:1208982‑M1/91‑91 (MQ=255) | AGATGTAGAAGTGGAAGTTCATGAAGGTGGACAACCAATTTATCAATATTTCTTTTCAGTAGAATAAAAATTTAAAATAAAAAACTACCAA‑TGATAAATCATCAGTTGGTAGTTTTTTATTTTGCTATTTTAGTGATATTGCGGGTTAAAAGTATCGTTCTCGAGTTGCTAACAATGTCAT > USA300TCH1516_ALE/1239467‑1239647 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |