| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1361481 | 174 (0.850) | 11 (0.060) | 7/140 | NT | 6.7% | intergenic (+20/+273) | USA300HOU_RS06765/USA300TCH1516_01271 | Putative phosphatase/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1361509 | 153 (0.860) | intergenic (+48/+245) | USA300HOU_RS06765/USA300TCH1516_01271 | Putative phosphatase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
AATATGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACAT > USA300TCH1516_ALE/1361391‑1361571 | aaTATGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAAC > 2:3162282‑M1/1‑91 (MQ=255) atGCCAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAAcaca > 1:3117228/1‑91 (MQ=255) gCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATg < 1:1884516/91‑1 (MQ=255) cAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGa < 2:2673739/91‑1 (MQ=255) cAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGa < 1:2611538/91‑1 (MQ=255) aTGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGatat > 1:3044753/1‑91 (MQ=255) aaGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTg < 2:1090077/91‑1 (MQ=255) aGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGa > 2:2739317/1‑91 (MQ=255) ttactaatctaaaatatgtatttcaaatcctccatagtataactgaagtcattttcacaaaaataaaAAGCCTTAACACATGATATTTGaa > 2:1126462‑M1/68‑91 (MQ=255) gTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGaa > 1:964339/1‑91 (MQ=255) attACGTTAGATCATAATGAAAATGGTATTCCACAAGCGATAAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGaa < 2:193038/90‑1 (MQ=255) taaCGTTGGATCATAATGAAAAGGGTAATCCACATGCGGTCAAAGAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAAt < 2:1355817/89‑1 (MQ=255) tACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATa < 1:3002980/91‑1 (MQ=255) aCGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATaa > 2:2014414/1‑91 (MQ=255) aCGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATATGAATaa > 1:1974035/1‑91 (MQ=255) ttGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGat < 1:266313/91‑1 (MQ=255) ttGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGAACACAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGat < 2:2491828/91‑1 (MQ=255) aTCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCt > 1:3616856/1‑91 (MQ=255) cATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTtg > 1:2400206/1‑91 (MQ=255) aTAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatg < 1:2911539‑M1/91‑28 (MQ=255) aTAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTtgt > 1:3599906/1‑91 (MQ=255) aTAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTtgt < 1:1598967/91‑1 (MQ=255) aTAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTtgt < 2:377749/91‑1 (MQ=255) tAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGTTATTTGAATAAGATATCTtgtg > 2:400139/1‑91 (MQ=255) tAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTtgtg > 1:1218389/1‑91 (MQ=255) aaTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGg < 1:980531‑M2/91‑2 (MQ=255) aaTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGg < 1:675136‑M2/91‑2 (MQ=255) aaTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGg > 1:2164225‑M2/1‑90 (MQ=255) aTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgt < 1:3022369‑M2/91‑3 (MQ=255) aTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgt > 1:3268252‑M2/1‑89 (MQ=255) tGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgtt < 2:3708442‑M1/91‑32 (MQ=255) gtatttcaaatcctccatagtataactgaagtcattttcacaaaaataaaAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGtt > 1:514509‑M1/51‑91 (MQ=255) gAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTtgtgttaa < 1:3650583/91‑5 (MQ=255) gAAAATAGTAGTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTAAAAATGAGCCTGAACcagaagatagcttattcaaatatcatgtgtta < 2:3545602‑M1/91‑33 (MQ=255) atttcaaatcctccatagtataactgaagtcattttcacaaaaataaaAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTaa > 2:290115‑M1/49‑91 (MQ=255) atttcaaatcctccatagtataactgaagtcattttcacaaaaataaaAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTaa > 1:2151035‑M1/49‑91 (MQ=255) aaaaTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaa < 2:2259279‑M1/91‑34 (MQ=255) aaaaTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTG‑TATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaag < 2:803357‑M1/91‑35 (MQ=255) aaTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaagg < 1:788070‑M2/91‑8 (MQ=255) tcaaatcctccatagtataactgaagtcattttcacaaaaataaaAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGc > 2:836524‑M1/46‑91 (MQ=255) tcaaatcctccatagtataactgaagtcattttcacaaaaataaaAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGc > 2:3184477‑M1/46‑91 (MQ=255) aTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggc < 2:1319112‑M2/91‑9 (MQ=255) aTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggc > 2:1647184‑M2/1‑83 (MQ=255) tGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggct < 2:2222248‑M2/91‑10 (MQ=255) ggTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggctt > 2:2138072‑M2/1‑81 (MQ=255) ggTATTCCACAGGCCCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggctt > 2:3352027‑M2/1‑81 (MQ=255) ggTACTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggctt < 2:450703‑M2/91‑11 (MQ=255) cacaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAttt < 2:140847/91‑1 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 2:1584411/91‑1 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 2:1225726/91‑1 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt > 1:1075895/1‑91 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt > 1:1275734/1‑91 (MQ=255) caTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAttttt > 1:1704899/1‑91 (MQ=255) aTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtg > 2:1632194/1‑91 (MQ=255) aTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtg > 1:2050706/1‑91 (MQ=255) cgcTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGa < 2:2520072/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATTATATTTGAATAAGAGATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGaaaa < 2:3481196/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGaaaa < 1:874978/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGaaaa > 1:3428718/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGaaaa < 2:1506862/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGaaaa < 1:1785451/91‑1 (MQ=255) cAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAAt > 2:2136574/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGa > 1:2467579/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACt < 2:2705778/91‑1 (MQ=255) aaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACt > 2:2564290/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATAACt < 1:231244/91‑1 (MQ=255) aTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACttt > 2:616013/1‑90 (MQ=255) aTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTc > 1:3215077/1‑91 (MQ=255) aTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTc < 2:3305793/91‑1 (MQ=255) ttGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCa > 2:181205/1‑91 (MQ=255) gTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGt < 1:2944427/91‑1 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt < 2:906882/91‑1 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt < 2:1262681/91‑1 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt > 2:2158037/1‑91 (MQ=255) ataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTtat < 1:1039877/91‑1 (MQ=255) ataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTtat > 1:2853433/1‑91 (MQ=255) ataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTtat > 1:3093370/1‑91 (MQ=255) aaaTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATAc < 1:2760204/91‑1 (MQ=255) aaTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACt < 1:441589/91‑1 (MQ=255) aTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTa < 2:2279986/91‑1 (MQ=255) tttAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATg < 1:1520540/91‑1 (MQ=255) tAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATgga > 2:298044/1‑91 (MQ=255) aaaaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATGTCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggag < 2:233455/91‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagg < 1:796132/91‑1 (MQ=255) tAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGAtt > 1:1544929/1‑91 (MQ=255) aaGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaatacc < 2:2771467‑M1/91‑82 (MQ=255) aaGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaatacc < 1:599409‑M1/91‑82 (MQ=255) aaGCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaatacc > 2:2369339‑M1/1‑10 (MQ=255) gCCTTAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccat < 1:1383304‑M1/91‑84 (MQ=255) GCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGa > 1:3721651‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTTAACACATGATACTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGACAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGaa < 1:3371026‑M1/91‑1 (MQ=255) cTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccattt < 1:2386102‑M2/91‑58 (MQ=255) ttAACcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgatctcttgtgtaatatcatttt > 2:3630590‑M1/1‑5 (MQ=255) ttAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccatttt < 1:1388867‑M2/91‑59 (MQ=255) ttAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccatttt < 2:2259347‑M2/91‑59 (MQ=255) TAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATa < 1:1122508‑M1/91‑1 (MQ=255) aaCcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccattttca < 1:1331610‑M1/91‑89 (MQ=255) AACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATAc > 2:3046745‑M1/1‑91 (MQ=255) aCcacaagatatcttattcaaatatcatgtgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccattttcat < 1:3022918‑M1/91‑90 (MQ=255) ACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACa < 2:210431‑M1/91‑1 (MQ=255) | AATATGCAAATGAAGTTACGTTGGATCATAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACAT > USA300TCH1516_ALE/1361391‑1361571 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |