New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1361481 | 174 (0.850) | 11 (0.060) | 7/140 | NT | 6.7% | intergenic (+20/+273) | USA300HOU_RS06765/USA300TCH1516_01271 | Putative phosphatase/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1361509 | 153 (0.860) | intergenic (+48/+245) | USA300HOU_RS06765/USA300TCH1516_01271 | Putative phosphatase/hypothetical protein |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGA > USA300TCH1516_ALE/1361419‑1361599 | tAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGTTATTTGAATAAGATATCTtgtg > 2:400139/1‑91 (MQ=255) aaTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGg > 1:2164225‑M2/1‑90 (MQ=255) aTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgt < 1:3022369‑M2/91‑3 (MQ=255) aTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgt < 1:3022918‑M2/91‑3 (MQ=255) aTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgt > 1:3268252‑M2/1‑89 (MQ=255) aTGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgt < 1:1205083‑M2/91‑3 (MQ=255) gtatttcaaatcctccatagtataactgaagtcattttcacaaaaataaaAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGtt > 1:317039‑M1/51‑91 (MQ=255) atttcaaatcctccatagtataactgaagtcattttcacaaaaataaaAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTaa > 2:290115‑M1/49‑91 (MQ=255) aaTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaagg < 1:788070‑M2/91‑8 (MQ=255) tcaaatcctccatagtataactgaagtcattttcacaaaaataaaAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGc > 2:836524‑M1/46‑91 (MQ=255) tcaaatcctccatagtataactgaagtcattttcacaaaaataaaAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGc > 2:3184477‑M1/46‑91 (MQ=255) aTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggc < 1:1383304‑M2/91‑9 (MQ=255) aTGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggc > 2:1647184‑M2/1‑83 (MQ=255) ggTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggctt < 1:599409‑M2/91‑11 (MQ=255) ggTATTCCACAGGCCCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggctt > 2:3352027‑M2/1‑81 (MQ=255) gTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCttt < 2:1725064/91‑1 (MQ=255) gTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCttt > 1:2950813/1‑91 (MQ=255) gTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCttt > 2:2022260/1‑91 (MQ=255) aTTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCttttt > 1:728969/1‑91 (MQ=255) ttCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTa > 2:35468/1‑91 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 1:2222972/91‑1 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 2:1584411/91‑1 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 2:1225726/91‑1 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 2:3045973/91‑1 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt < 2:3636266/91‑1 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt > 1:1275734/1‑91 (MQ=255) acaTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAtttt > 1:1076383/1‑91 (MQ=255) aTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtg > 2:1632194/1‑91 (MQ=255) aTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtg < 1:2708817/91‑1 (MQ=255) aTGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtg < 2:2365352/91‑1 (MQ=255) tGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTtgt > 2:1047118/1‑91 (MQ=255) cgcTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGa < 2:2520109/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGaaaa > 1:1312431/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGaaaa < 1:874978/91‑1 (MQ=255) cAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAAt > 2:2136601/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGa > 2:2975712/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACt > 2:2564290/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACt < 2:2705778/91‑1 (MQ=255) aaTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTCGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACtt < 2:3875915/91‑1 (MQ=255) aTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACttt > 2:616013/1‑90 (MQ=255) aTTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTc > 1:3215057/1‑91 (MQ=255) tGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggctttttttaaaatttataacaatttttt < 1:1529697‑M2/91‑36 (MQ=255) tGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAg > 2:1321672/1‑91 (MQ=255) gTTATGAATTTTAAAATAAGCCTTAGCACATGATATTTGGATAAGATATCTTGGGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGt < 1:3681601/91‑1 (MQ=255) gTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGt < 1:2615225/91‑1 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt < 1:444568/91‑1 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt > 2:7862/1‑91 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt > 1:2407585/1‑91 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt < 2:1262681/91‑1 (MQ=255) ttATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGtt > 1:2935477/1‑91 (MQ=255) ataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTtat < 1:1039877/91‑1 (MQ=255) ataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTtat > 1:2853449/1‑91 (MQ=255) ataAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTtat > 1:3093370/1‑91 (MQ=255) aaTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACt < 1:1794253/91‑1 (MQ=255) aaTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACt > 1:1602478/1‑91 (MQ=255) aTTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTa < 2:2279986/91‑1 (MQ=255) tttAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATg < 2:2771283/91‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagg < 1:796132/91‑1 (MQ=255) aaaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagg > 2:2407706/1‑91 (MQ=255) aaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagga > 1:283965/1‑91 (MQ=255) aaTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATggagga > 1:2141709/1‑91 (MQ=255) aTAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGAt < 2:1533807/91‑1 (MQ=255) tAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGCAtt > 1:3561303/1‑91 (MQ=255) AAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGAttt > 2:2224836‑M1/1‑91 (MQ=255) ccTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccatt < 2:2149171‑M2/91‑57 (MQ=255) CCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGaa < 1:1769866‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTAATTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGaa < 2:3480511‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTTAACACATGATACTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGACAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGaa < 1:3371026‑M1/91‑1 (MQ=255) cTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccattt < 1:2386102‑M2/91‑58 (MQ=255) ttAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccatttt < 2:2259347‑M2/91‑59 (MQ=255) aaCACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGgttaaggcttattttaaaatttataacaattttttgagcgcatgtggaataccattttca < 2:3708442‑M2/91‑61 (MQ=255) AACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATAc > 2:3046745‑M1/1‑91 (MQ=255) ACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACa < 1:364116‑M1/91‑1 (MQ=255) CACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACAt < 1:3942682‑M1/91‑1 (MQ=255) caTGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACatat < 2:1997010/91‑1 (MQ=255) caTGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACatat < 1:225149/91‑1 (MQ=255) aTGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATAtt < 2:404904/91‑1 (MQ=255) aTGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTCAAATACATAtt > 1:3588569/1‑91 (MQ=255) gATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATAtttt > 1:518352/1‑91 (MQ=255) gATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATAtttt > 2:2583687/1‑91 (MQ=255) gATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATAtttt < 2:1871662/91‑1 (MQ=255) atatTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTa > 1:1557436/1‑91 (MQ=255) tatTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGTGTATTTGAAATTCATATTTTAg > 2:1133916/1‑91 (MQ=255) tatTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATAACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAg > 2:3485279/1‑91 (MQ=255) tttGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGAt < 1:427525/91‑1 (MQ=255) aaGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAAt < 2:2748914/91‑1 (MQ=255) aGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATg < 2:468712/91‑1 (MQ=255) tatCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGata < 1:1941959/91‑1 (MQ=255) tCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGatatt > 2:1411773/1‑90 (MQ=255) tCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATc > 2:5510/1‑91 (MQ=255) tCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATc > 2:2169544/1‑91 (MQ=255) ttGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCaa < 1:1694834/91‑1 (MQ=255) ttGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCaa > 1:305504/1‑91 (MQ=255) ttGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCaa > 1:1475486/1‑91 (MQ=255) tgtgGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCaaa < 1:378674/91‑1 (MQ=255) tgtgGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCaaa > 1:1938877/1‑91 (MQ=255) gtgGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAAc < 1:83351/91‑1 (MQ=255) tgGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACg > 2:3286555/1‑91 (MQ=255) tgGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACg > 2:893805/1‑91 (MQ=255) ggTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGa > 2:3535673/1‑91 (MQ=255) | TAATGAAAATGGTATTCCACATGCGCTCAAAAAATTGTTATAAATTTTAAAATAAGCCTTAACACATGATATTTGAATAAGATATCTTGTGGTTAAGGCTTTTTATTTTTGTGAAAATGACTTCAGTTATACTATGGAGGATTTGAAATACATATTTTAGATTAGTAATGATATCAAACGA > USA300TCH1516_ALE/1361419‑1361599 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |