New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1836934 = | 134 (0.660) | 22 (0.130) | 10/132 | NT | 16.5% | intergenic (+18/+132) | serA/gph_2 | D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/Phosphoglycolate phosphatase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1836982 = | 112 (0.670) | intergenic (+66/+84) | serA/gph_2 | D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/Phosphoglycolate phosphatase |
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
TATAATTGATGAACTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAACCTTTGGTT > USA300TCH1516_ALE/1836844‑1837024 | ttgtaatttgattgttgtttgacagcataacttgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaa > 1:2763225‑M1/91‑91 (MQ=255) ttgtaatttgattgttgtttgacagcataacttgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaa < 1:1790269‑M1/1‑1 (MQ=255) ataATTGATGAACTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAA > 2:352577‑M1/1‑91 (MQ=255) taATTGATGAACTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAA < 2:2066141‑M1/91‑1 (MQ=255) gtaatttgattgttgtttgacagcataacttgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaaaa > 1:1605393‑M1/89‑91 (MQ=255) taatttgattgttgtttgacagcataacttgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaaaaa < 1:1919009‑M1/4‑1 (MQ=255) aaTTGATGAACTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAA > 1:2622735‑M1/1‑91 (MQ=255) aatttgattgttgtttgacagcataacttgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAAt > 2:34053‑M1/87‑91 (MQ=255) tgattgttgtttgacagcataacttgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAATGCCa > 2:1718930‑M1/83‑91 (MQ=255) atgaACTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCA < 1:1723623‑M1/91‑1 (MQ=255) tgaACTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGCATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAA > 2:86498‑M1/1‑91 (MQ=255) tgaACTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAA > 1:3313481‑M1/1‑91 (MQ=255) tgaACTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAA < 1:3808903‑M1/91‑1 (MQ=255) gaACTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAG < 2:108279‑M1/91‑1 (MQ=255) attgttgtttgacagcataacttgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAATGCCaag > 1:2601840‑M1/81‑91 (MQ=255) attgttgtttgacagcataacttgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAATGCCaag > 1:1427818‑M1/81‑91 (MQ=255) ttgttgtttgacagcataacttgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAATGCCaaga > 2:3692918‑M1/80‑91 (MQ=255) aCTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAA > 2:2031876‑M1/1‑91 (MQ=255) aCTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAA > 1:2160260‑M1/1‑91 (MQ=255) gttgtttgacagcataacttgtagtgaaggattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAATGCCaagaag > 2:2633441‑M1/78‑91 (MQ=255) cTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAG < 1:1259132‑M1/91‑1 (MQ=255) tAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGAc < 1:3860997/91‑1 (MQ=255) aaaCAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACa < 1:2342600/91‑1 (MQ=255) aaaCAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAAGTCAAAATGCCAAGAAGACa < 2:251371/91‑1 (MQ=255) aaCAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACAt < 1:1976041/91‑1 (MQ=255) aaCAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACAt > 2:3296118/1‑91 (MQ=255) acacGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACact > 1:1813340/1‑89 (MQ=255) aCAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACAtt < 2:1457037/91‑1 (MQ=255) aCAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACAtt > 1:686476/1‑91 (MQ=255) gTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGAt < 1:1842133/91‑1 (MQ=255) ttGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGAtt > 2:1524694/1‑91 (MQ=255) ggTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTAc > 1:1363010/1‑91 (MQ=255) ggTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTAc < 2:1914601/91‑1 (MQ=255) aTACAATCAAATTTTCTCAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCa < 2:3034817/91‑1 (MQ=255) tACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCAt < 2:1810341/91‑1 (MQ=255) tACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCAt > 1:3900007/1‑91 (MQ=255) tgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCAtt > 2:3222846‑M1/59‑91 (MQ=255) tgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCAtt > 1:2956261‑M1/59‑91 (MQ=255) tgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCAtt > 1:288947‑M1/59‑91 (MQ=255) tgtagtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCAtt > 1:2430367‑M1/59‑91 (MQ=255) gcaATCAAAGTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCGAGGAGcaatggaagtaatccaatg < 2:1750617‑M1/90‑20 (MQ=255) aCAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGcaatggaagtaatccaatg < 1:2105212‑M1/91‑20 (MQ=255) aCAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCAtt < 2:228366/91‑1 (MQ=255) aCAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCAtt < 2:1364325/91‑1 (MQ=255) cAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGcaatggaagtaatccaatgt < 2:530099‑M1/91‑21 (MQ=255) cAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTg < 1:2997315/91‑1 (MQ=255) aaTCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGcaatggaagtaatccaatgtc < 1:1147097‑M1/91‑22 (MQ=255) agtgaatgattgaaccaaaggtttcatattgagttacaatgaaattaataatgaaAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGct > 1:423606‑M1/56‑91 (MQ=255) aTCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGct < 1:1058979‑M2/91‑3 (MQ=255) cAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGcaatggaagtaatccaatgtcttc < 1:794089‑M1/91‑25 (MQ=255) cAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttc < 2:326769‑M2/91‑5 (MQ=255) aaaTTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGcaatggaagtaatccaatgtcttct < 1:475726‑M1/91‑26 (MQ=255) aaTTTTCACGACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttctt > 2:1183048‑M2/1‑85 (MQ=255) aTTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttg > 1:3250224‑M2/1‑84 (MQ=255) aTTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttg > 1:3743010‑M2/1‑84 (MQ=255) ttttCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGcaatggaagtaatccaatgtcttcttgg < 2:2937293‑M1/91‑29 (MQ=255) tttCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGcaatggaagtaatccaatgtcttcttggc < 2:2114729‑M1/91‑30 (MQ=255) ttCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttggca > 1:2799036‑M2/1‑81 (MQ=255) ttCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttggca > 2:3941815‑M2/1‑81 (MQ=255) ttCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttggca > 2:194319‑M2/1‑81 (MQ=255) tCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttggcat < 2:1657115‑M2/91‑12 (MQ=255) cacaACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttggcatt < 2:2107166‑M2/91‑13 (MQ=255) cacaACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttggcatt < 2:1571901‑M2/91‑13 (MQ=255) acaACTGAATTGACCGTACAGTCATAATCAATGTATATAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttggcattt > 2:2401509‑M2/1‑78 (MQ=255) caACTGAATTGACGGTACAGTCATAACCAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttggcatttt > 2:334888‑M2/1‑77 (MQ=255) caACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttggcatttt > 1:1991085‑M2/1‑77 (MQ=255) aTTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCatta < 1:349994/91‑1 (MQ=255) tGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCATGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCattatt < 2:767686/91‑1 (MQ=255) tGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCattatt < 1:2654253/91‑1 (MQ=255) gACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTCCTTCCATTGCTTCTTGGCATTCTTTCAttatta > 2:93076/1‑91 (MQ=255) gACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCAttatta > 2:3092076/1‑91 (MQ=255) gACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTAAACATGCGAAGAAGACATTGGATTGATTCTATGGCTTCTTGGCATATTTTCAgtatta > 2:2212835/1‑91 (MQ=255) aCGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTaa < 2:464861/91‑1 (MQ=255) cGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAAt > 1:1867328/1‑91 (MQ=255) aGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCAtt > 1:2318277/1‑91 (MQ=255) aGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCAtt > 1:2219268/1‑91 (MQ=255) tCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGt > 1:110486/1‑91 (MQ=255) tCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGt < 1:3611538/91‑1 (MQ=255) tCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGt < 2:1210960/91‑1 (MQ=255) cATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGcaatggaagtaatccaatgtcttcttggcattttgaatttacataaattgtttat < 1:1991530‑M1/91‑56 (MQ=255) aTAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGcttcttggcattttgaatttacataaattgtttatg < 1:1991904‑M2/91‑37 (MQ=255) cAATTTATGTAAATTCAAAATGCTAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTATAACTCaa > 2:3426325/1‑91 (MQ=255) aaTTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAat < 2:1019135/91‑1 (MQ=255) aaTTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAat > 1:918865/1‑91 (MQ=255) aaTTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAat > 1:826707/1‑91 (MQ=255) aTTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAata > 1:912435/1‑91 (MQ=255) tttATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCCTTATTAATTTCATTGTAACTCCatat > 1:3428699/1‑91 (MQ=255) ttATGTAAATTGAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCCTTGCTTCTTGGCATGATTTCATTATTAATTCCATTGTAACTCAATATg > 2:2715029/1‑91 (MQ=255) ttATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATg < 1:147487/91‑1 (MQ=255) tATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGa < 2:3794504/91‑1 (MQ=255) gTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAAc > 1:3573557/1‑91 (MQ=255) gTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAAc > 2:2838415/1‑91 (MQ=255) aaTTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAACCtt > 1:526428/1‑91 (MQ=255) aTTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAACCttt < 2:150242/91‑1 (MQ=255) tCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAACCTTTgg < 2:1457734/91‑1 (MQ=255) cAAAATGCCAAGAAGACATTGGGTTACTTCCATTGCTTCTTAGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAACCTTTGGt < 2:3470682/91‑1 (MQ=255) cAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAACCTTTGGt < 2:189360/91‑1 (MQ=255) aAAACTGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTTCTTCTTTGCATTTTTTCATTATTAATTTAATTGTAACTCAATATGAAACCTTTGGt > 2:3757052‑M1/2‑91 (MQ=255) aAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAACCTTTGGt > 1:2723528‑M1/2‑91 (MQ=255) AAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAACCTTTGGtt < 2:2410079‑M1/91‑1 (MQ=255) | TATAATTGATGAACTTAAACAAGTTGGTGAATACAATCAAATTTTCACAACTGAATTGACGGTACAGTCATAAACAATTTATGTAAATTCAAAATGCCAAGAAGACATTGGATTACTTCCATTGCTTCTTGGCATTTTTTCATTATTAATTTCATTGTAACTCAATATGAAACCTTTGGTT > USA300TCH1516_ALE/1836844‑1837024 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |