| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1867679 | 174 (0.850) | 16 (0.090) | 10/142 | NT | 9.0% | intergenic (+53/+72) | USA300HOU_RS09275/ytnP | hypothetical protein/putative quorum‑quenching lactonase YtnP |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1867699 | 170 (0.940) | intergenic (+73/+52) | USA300HOU_RS09275/ytnP | hypothetical protein/putative quorum‑quenching lactonase YtnP | |||||
Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
CATATACTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAACTAAT > USA300TCH1516_ALE/1867589‑1867769 | cATATACTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACA < 2:1963329‑M1/91‑1 (MQ=255)cATATACTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACA < 1:194093‑M1/91‑1 (MQ=255) tgcatatattttacgtgaaacattagttgataataactaaaataaagatgtattactaaacaaattttcaaaaataaaaaatTGAGCcaca > 2:778617‑M1/83‑91 (MQ=255) tgcatatattttacgtgaaacattagttgataataactaaaataaagatgtattactaaacaaattttcaaaaataaaaaatTGAGCcaca < 1:413826‑M1/9‑1 (MQ=255) ataCTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACAccc < 2:382431/91‑1 (MQ=255) cTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTaa > 1:1328502/1‑91 (MQ=255) tGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAg > 1:723246/1‑91 (MQ=255) tGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAg < 1:1559577/91‑1 (MQ=255) aGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTaa > 1:1004116/1‑91 (MQ=255) gTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAg < 2:3154067/91‑1 (MQ=255) tCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGa < 1:58222/91‑1 (MQ=255) cATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGAt > 1:2173047/1‑91 (MQ=255) cATTAACATGGTGGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAAGTAGTAAGAt < 2:489850/91‑1 (MQ=255) gaaacattagttgataataactaaaataaagatgtattactaaacaaattttcaaaaataaaaaatTGAGCCACACCCTAATTAGTAAGAt > 1:977902‑M1/67‑91 (MQ=255) ttAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTg > 1:3546941/1‑91 (MQ=255) ttAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAACTAGTAAGATTg > 2:174099/1‑91 (MQ=255) aaacattagttgataataactaaaataaagatgtattactatacaaattttcaaaaataaaaaatTGAGCCACACCCTAATTAGTAAGAtt > 2:3483539‑M1/66‑91 (MQ=255) aaacattagttgataataactaaaataaagatgtattactaaacaaattttcataaataaaaaatTGAGCCACACCCTAATTAGTAAGAtt > 1:3326829‑M1/66‑91 (MQ=255) tAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTGAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTgg > 1:3232135/1‑91 (MQ=255) aacattagttgataataactaaaataaagatgtattactaaacaaattttcaaaaataaaaaatTGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTg > 1:1555653‑M1/65‑91 (MQ=255) aacattaggagataataactaaaataaagatgtattactaaacaaattttcaaaaataaaaaatTGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTg > 2:3405959‑M1/65‑91 (MQ=255) aaCATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGa < 2:430874/91‑1 (MQ=255) aCATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACAtccaatcttactaattagggt < 1:801311‑M1/91‑22 (MQ=255) aTTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACAtccaatcttactaattagggtgt < 1:1827033‑M1/91‑24 (MQ=255) ttGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtg > 2:356365‑M2/1‑87 (MQ=255) tGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTTGAtgtgg < 2:370127‑M2/91‑6 (MQ=255) tGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtgg > 2:1261569‑M2/1‑86 (MQ=255) tGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtgg > 2:1837151‑M2/1‑86 (MQ=255) tGTAGAGCGTTAATACGAATTTTAGCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtgg > 2:611576‑M2/1‑86 (MQ=255) gttgataataactaaaataaagatgtattactaaacaaattttcaaaaataaaaaatTGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTgg > 1:2956161‑M1/58‑91 (MQ=255) gTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggc > 1:2408250‑M2/1‑85 (MQ=255) gTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggc < 1:2748219‑M2/91‑7 (MQ=255) agagCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctc > 1:1120269‑M2/1‑83 (MQ=255) gataataactaaaataaagatgtattactaaacaaattttcaaaaataaaaaatTGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTc > 1:528732‑M1/55‑91 (MQ=255) gagCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAATTGAGCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctc < 1:2880032‑M1/91‑29 (MQ=255) gagCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctca < 2:2713706‑M2/91‑10 (MQ=255) gagCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctca > 1:1570727‑M2/1‑82 (MQ=255) gTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAT‑TGAGCCACAtccaatattactaattagggtgtggctcatttt < 1:3017286‑M1/91‑34 (MQ=255) gTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAttt < 1:1490018/91‑1 (MQ=255) gTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAttt < 2:283938/91‑1 (MQ=255) gTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAttt > 1:2355605/1‑91 (MQ=255) taactaaaataaagatgtattactaaacaaattttcaaaaataaaaaatTGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAttt > 2:3617248‑M1/50‑91 (MQ=255) aaTACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAtttttt > 2:1393626/1‑91 (MQ=255) aaTACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAtttttt > 1:1279881/1‑91 (MQ=255) cGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTAttt > 1:2094085/1‑91 (MQ=255) gAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTAtttt < 2:3866684/91‑1 (MQ=255) ttttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAGA‑TGAGCCTCACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGa < 2:555593/91‑1 (MQ=255) ttttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGa < 2:3309106/91‑1 (MQ=255) ttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGaaa < 1:1097966/91‑1 (MQ=255) ttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGaaa > 2:2264797/1‑91 (MQ=255) ttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGaaa < 2:3088067/91‑1 (MQ=255) ttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGaaa < 1:1663771/91‑1 (MQ=255) tCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGATCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAAtt < 2:3913950/91‑1 (MQ=255) tCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAAtt < 1:20503/91‑1 (MQ=255) tCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAAtt > 1:2884812/1‑91 (MQ=255) atatTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGt > 1:657771/1‑91 (MQ=255) tatTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGtt > 2:2035453/1‑91 (MQ=255) tttgatttgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTa > 1:1434978/1‑91 (MQ=255) ttgatttgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACTCCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAg < 2:301315/91‑1 (MQ=255) atttgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTaa > 1:3805746/1‑91 (MQ=255) tgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATAc < 2:1188295/91‑1 (MQ=255) tgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATAc > 1:3389535/1‑91 (MQ=255) tgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATAc > 2:2101816/1‑91 (MQ=255) gATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGATAATTTGTTTAGTAATACAt > 2:1363258/1‑91 (MQ=255) gATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACAt > 2:2343788/1‑91 (MQ=255) gATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACAt > 1:2687805/1‑91 (MQ=255) gATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATCAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACAt > 2:1221440/1‑91 (MQ=255) aTCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATATATc > 2:667193/1‑91 (MQ=255) aTCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATc < 2:1599012/91‑1 (MQ=255) aTCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATc > 1:197892/1‑91 (MQ=255) tCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCt > 2:144741/1‑91 (MQ=255) tCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCt < 1:3904487/91‑1 (MQ=255) cGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCtt > 2:1989759/1‑91 (MQ=255) cGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCtt < 1:1481127/91‑1 (MQ=255) cGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCtt > 1:1773896/1‑91 (MQ=255) cGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCtt < 1:2854394/91‑1 (MQ=255) aaaaCTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTTATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTAt < 1:3686881/91‑1 (MQ=255) aaaCTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTAtt < 1:2190547/91‑1 (MQ=255) aaCTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTAttt < 2:3574458/91‑1 (MQ=255) aCTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTAtttt < 1:2212623/91‑1 (MQ=255) aaaaa‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGtt < 1:837264/91‑1 (MQ=255) aaaa‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGTAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGtta > 2:1688637/1‑91 (MQ=255) aaa‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGttat > 1:2385845/1‑91 (MQ=255) aa‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctcaattttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgc < 2:2470928‑M2/91‑61 (MQ=255) a‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctcaatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgc < 1:1207952‑M2/91‑62 (MQ=255) tGAGCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctc < 2:2255714‑M1/91‑83 (MQ=255) gAGCCACACCCTCATTAGTAAGATTGGAtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctct < 1:3035854‑M2/91‑64 (MQ=255) gAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctcaatttttaagttttacgatccaaatcaaatctggataaaattcgtattaacgctc < 2:3115177‑M2/91‑64 (MQ=255) gAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctcaatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctc < 2:2864749‑M2/91‑64 (MQ=255) gAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctcaattttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctct < 1:2497915‑M2/91‑64 (MQ=255) GAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATc > 2:1017566‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATc > 1:3441620‑M1/1‑91 (MQ=255) gCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctctac < 2:3249174‑M1/91‑86 (MQ=255) gCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctctac < 1:1734540‑M1/91‑86 (MQ=255) CCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAAc < 2:258984‑M1/91‑1 (MQ=255) CCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAAc < 2:217793‑M1/91‑1 (MQ=255) cacatccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctctacaa > 2:111310‑M1/1‑4 (MQ=255) CACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAACt > 1:304597‑M1/1‑91 (MQ=255) ACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGTATTTTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAACTa < 2:2703056‑M1/91‑1 (MQ=255) ACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAACTa < 2:2482604‑M1/91‑1 (MQ=255) | CATATACTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAACTAAT > USA300TCH1516_ALE/1867589‑1867769 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |