| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1868935 = | 198 (0.970) | 16 (0.090) | 7/142 | NT | 8.3% | intergenic (‑342/+128) | ytnP/trmB | putative quorum‑quenching lactonase YtnP/tRNA (guanine‑N(7)‑)‑methyltransferase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1868982 = | 180 (1.000) | intergenic (‑389/+81) | ytnP/trmB | putative quorum‑quenching lactonase YtnP/tRNA (guanine‑N(7)‑)‑methyltransferase | |||||
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
TTGTTCATAGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGAACCATTATAGTACGAAAAAAC > USA300TCH1516_ALE/1868845‑1869025 | ttGTTCATAGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAA < 2:734256‑M1/91‑1 (MQ=255)ttGTTCATAGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAA > 2:2310766‑M1/1‑91 (MQ=255)ttGTTCATAGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAA > 1:2206909‑M1/1‑91 (MQ=255) gTTCATAGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAA > 1:2288296‑M1/1‑91 (MQ=255) aaatagagcacttatgagggtatgtacacatacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAAt > 2:434978‑M1/88‑91 (MQ=255) tCATATGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATC > 1:181935‑M1/1‑91 (MQ=255) tCATAGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAGATC > 1:838177‑M1/1‑91 (MQ=255) tCATAGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATC > 2:2537337‑M1/1‑91 (MQ=255) tCATAGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATC > 1:872031‑M1/1‑91 (MQ=255) aatagagcacttatgagggtatgtacacatacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATc > 1:3886317‑M1/87‑91 (MQ=255) aatagagcacttatgagggtatgtacacatacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATc > 1:2064631‑M1/87‑91 (MQ=255) atagagcacttatgagggtatgtacacatacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATCg < 2:3432932‑M1/6‑1 (MQ=255) tagagcacttatgagggtatgtacacatacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATCgg < 2:2821043‑M1/7‑1 (MQ=255) aTAGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATAAAAAAAAAAAAAATCGG < 2:2041859‑M1/91‑1 (MQ=255) gagcacttatgagggtatgtacacatacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATCGGAc < 1:1084333‑M1/9‑1 (MQ=255) gagcacttatgagggtatgtacacatacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATCGGAc < 2:3380978‑M1/9‑1 (MQ=255) aGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGAC < 2:1281393‑M1/91‑1 (MQ=255) ggCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAGATCAAAAAATCGGACa < 1:3860940/91‑1 (MQ=255) ggCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACa > 2:2700424/1‑91 (MQ=255) gcgcATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAg > 2:3842470/1‑91 (MQ=255) cgcATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGa < 1:529525/91‑1 (MQ=255) gcATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCTCTTTTAATTATAGAGCTAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCACTAAATCGGACAGAt > 2:100061/1‑91 (MQ=38) aTTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGa > 1:2301451/1‑91 (MQ=255) aTTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGa > 1:421386/1‑91 (MQ=255) aTTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGa < 1:1201511/91‑1 (MQ=255) tATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGaaa < 2:3689199/91‑1 (MQ=255) tATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGaaa < 1:662086/91‑1 (MQ=255) tATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGaaa > 2:3325374/1‑91 (MQ=255) aTCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGaaaa > 2:1127525/1‑91 (MQ=255) tctcCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAg < 2:2525760/91‑1 (MQ=255) ctcCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTTAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGt > 2:2329827/1‑91 (MQ=255) ctcCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGt < 2:119176/91‑1 (MQ=255) ccTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTa < 2:3373809/91‑1 (MQ=255) ccTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTGTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTa < 2:3553453/91‑1 (MQ=255) cTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTaa > 2:1675072/1‑91 (MQ=255) cTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTaa < 1:466649/91‑1 (MQ=255) cTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTaa < 2:880215/91‑1 (MQ=255) cTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTaa > 1:3267309/1‑91 (MQ=255) tttAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTaaa < 1:896816/91‑1 (MQ=255) aGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATTTGACAGATGAAAAGTTAAAAAc > 1:56632/1‑91 (MQ=255) aGTTAATTGTTGAGTCAGTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAAAAAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAAc < 2:240877/91‑1 (MQ=25) ttATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATACAAAAACAAAAAATCGGACtgatggaaaaagtttttaac < 2:3111385‑M1/91‑21 (MQ=255) tATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAACAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACttt > 2:2594817/1‑91 (MQ=255) catacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACttttt > 1:1704434‑M1/60‑91 (MQ=255) atacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTc > 1:691561‑M1/59‑91 (MQ=255) atacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataaaAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTc > 2:83793‑M1/59‑91 (MQ=255) tacaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTcc > 1:1745180‑M1/58‑91 (MQ=255) gTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCa < 2:1110465/91‑1 (MQ=255) acaatcataagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCa > 1:2946988‑M1/57‑91 (MQ=255) aGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAg < 2:1807627‑M2/91‑2 (MQ=255) gTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAATAAATCGGACtgatggaaaaagtttttaacttttcatctgt < 1:1120067‑M1/91‑32 (MQ=255) gTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACtgatggaaaaagtttttaacttttcatctgt < 2:1964598‑M1/91‑32 (MQ=255) gTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACtgatggaaaaagtttttaacttttcatctgt < 1:1038560‑M1/91‑32 (MQ=255) gTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAgt > 1:3795362‑M2/1‑89 (MQ=255) tCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACtgatggaaaaagtttttaacttttcatctgtc < 1:2367090‑M1/91‑33 (MQ=255) taagtgttttttcgtactataatggttctatagataaaggttctataatAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTcc > 1:178649‑M1/50‑91 (MQ=255) aCTTTTGATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACtgatggaaaaagtttttaacttttcatctgtccg < 2:1436365‑M1/91‑35 (MQ=255) aCTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAgtccg > 2:2135437‑M2/1‑86 (MQ=255) aCTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAgtccg > 2:2151317‑M2/1‑86 (MQ=255) cTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAgtccga < 1:2397317‑M2/91‑7 (MQ=255) cTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAgtccga > 1:1488788‑M2/1‑85 (MQ=255) ttttAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAgtccgat < 1:3091290‑M2/91‑8 (MQ=255) ttttAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAgtccgat < 2:615063‑M2/91‑8 (MQ=255) tttAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAgtccgatt > 1:3019525‑M2/1‑83 (MQ=255) tttAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAgtccgatt > 2:2750339‑M2/1‑83 (MQ=255) ttAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAttccgattt < 2:3214136‑M2/91‑10 (MQ=255) aaTTATAGAGATACTTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATttat < 2:2568206/91‑1 (MQ=255) aaTTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATttat < 1:1298856/91‑1 (MQ=255) aaTTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATttat < 1:2712049/91‑1 (MQ=255) aTTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATttatt > 2:1856094/1‑91 (MQ=255) aTTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATttatt > 1:2496020/1‑91 (MQ=255) aTTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATttatt > 2:1077607/1‑91 (MQ=255) ataGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATtata > 1:3538123/1‑91 (MQ=255) taGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAg > 1:3175700/1‑91 (MQ=255) agagATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGa > 1:2184887/1‑91 (MQ=255) agaTAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAAc < 1:3725514/91‑1 (MQ=255) agaTAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAAGCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAAc < 2:1017418/91‑1 (MQ=255) gaTAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAAcc > 2:2217990/1‑91 (MQ=255) gaTAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAAcc < 1:2334266/91‑1 (MQ=255) aTAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCt < 1:215930/91‑1 (MQ=255) tAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCtt > 1:3350705/1‑91 (MQ=255) ttGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTAt < 1:2600872/91‑1 (MQ=255) tGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATc < 2:1355336/91‑1 (MQ=255) tGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATc < 1:2270867/91‑1 (MQ=255) tGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATc < 1:1933159/91‑1 (MQ=255) gcgcTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCt > 1:3609406/1‑91 (MQ=255) gcTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCtat < 1:1229109/91‑1 (MQ=255) cTTTTTTTTTATTTAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCtata > 2:470176/1‑91 (MQ=255) cTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCtata > 1:1625428/1‑91 (MQ=255) cTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCtata < 2:2863676/91‑1 (MQ=255) tttttttATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAg < 2:3595255/91‑1 (MQ=255) tttttATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGaa > 2:360214/1‑91 (MQ=255) ttATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGAACCa > 1:3429339/1‑91 (MQ=255) ttCAAAATCAAAAAATCGGGCAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGAACCATtata < 1:1135202/91‑1 (MQ=255) tcaaaatcaaaaAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGAACCATTATAg < 1:1533305/91‑1 (MQ=255) caaaatcaaaaAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGAACCATTATAGt < 1:3475220/91‑1 (MQ=255) caaaatcaaaaAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGAACCATTATAGt < 2:2972995/91‑1 (MQ=255) aaatcaaaaAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGAACCATTATAGTAc < 1:3100217/91‑1 (MQ=255) aaaaaTCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGAACCATTATAGTACGaaaaa < 2:3805100/91‑1 (MQ=255) AAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGAACCATTATAGTACGAAAAAac > 2:1762476‑M1/1‑91 (MQ=255) | TTGTTCATAGGCGCATTATCTCCTTTAGTTATTTGTTTAGTCACTTTTAATTATAGAGATAATTGCGCTTTTTTTATATTCAAAATCAAAAAATCGGACAGATGAAAAGTTAAAAACTTTTTCCATCAGTCCGATTTATTATAGAACCTTTATCTATAGAACCATTATAGTACGAAAAAAC > USA300TCH1516_ALE/1868845‑1869025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |