| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1895575 | 168 (0.820) | 16 (0.090) | 9/142 | NT | 9.0% | intergenic (+27/+95) | putB/ribH | Proline dehydrogenase 2/6,7‑dimethyl‑8‑ribityllumazine synthase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1895601 | 174 (0.960) | intergenic (+53/+69) | putB/ribH | Proline dehydrogenase 2/6,7‑dimethyl‑8‑ribityllumazine synthase | |||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GCAGCTTTAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGAACTCACAACAG > USA300TCH1516_ALE/1895486‑1895665 | gCAGCTTTAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGt < 1:338086/91‑1 (MQ=255) cAGCTTTAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTc > 2:2610464/1‑91 (MQ=255) cTTTAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTgg < 1:1078562/91‑1 (MQ=255) cTTTAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTgg > 2:2195373/1‑91 (MQ=255) ttAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGaa > 2:2244153/1‑91 (MQ=255) ttAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGaa < 2:3807847/91‑1 (MQ=255) tAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAAc < 1:957495/91‑1 (MQ=255) tAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAAc > 1:1791578/1‑91 (MQ=255) ggAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACaa > 1:2750335/1‑91 (MQ=255) gAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTTTGGAACaat > 2:3726249/1‑91 (MQ=255) tACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATc < 2:1607957/91‑1 (MQ=255) cAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCaa < 2:287633/91‑1 (MQ=255) cAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCaa < 1:631902/91‑1 (MQ=255) ggTTATGTTAGGTTTAAGGACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATGTAGGAGTCTGGAACAATAATCAAt < 2:44235/90‑1 (MQ=255) gTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATg < 1:20275/91‑1 (MQ=255) gTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATg < 2:828721/91‑1 (MQ=255) ttATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGt < 2:2059149/91‑1 (MQ=255) ttATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATATAGGAGcctagaacattgattattgt < 2:2337912‑M1/91‑21 (MQ=255) tATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGcctagaacattgattattgtt < 2:1032657‑M1/91‑22 (MQ=255) aTGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTc < 1:3283292/91‑1 (MQ=255) ttAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAg > 2:2409229/1‑91 (MQ=255) ttAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAg > 2:535961/1‑91 (MQ=255) tAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAgg < 2:780500/91‑1 (MQ=255) aGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGc < 2:2291802‑M2/91‑2 (MQ=255) aGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGc > 1:3855121‑M2/1‑90 (MQ=255) gTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctc > 1:1360320‑M2/1‑88 (MQ=255) tttAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctcc > 1:3755030‑M2/1‑87 (MQ=255) tttAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctcc < 1:3540414‑M2/91‑5 (MQ=255) ttAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGcctagaacattgattattgttccagactcct < 2:257171‑M1/91‑32 (MQ=255) ttAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGcctagaacattgattattgttccagactcct < 1:2930476‑M1/91‑32 (MQ=255) tAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGcctagaacattgattattgttccagactccta < 2:2986012‑M1/91‑33 (MQ=255) aaGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctcctaa < 1:902727‑M2/91‑8 (MQ=255) aGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctcctaaa > 2:852943‑M2/1‑83 (MQ=255) aGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctcctaaa < 1:2191663‑M2/91‑9 (MQ=255) aGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctcctaaa < 1:1251914‑M2/91‑9 (MQ=255) aGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctcctaaa < 1:1527204‑M2/91‑9 (MQ=255) aGTACAAATAAAAAATTATGCCGGAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctcctaaa > 2:844402‑M2/1‑83 (MQ=255) tACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATg < 2:31853/91‑1 (MQ=255) tACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATg < 1:3250296/91‑1 (MQ=255) tACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATg < 2:3454285/91‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGtt < 1:157060/91‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGtt < 2:3092245/91‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGtt > 1:3754373/1‑91 (MQ=255) aaTTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTta > 1:826145/1‑91 (MQ=255) ttAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTtata > 1:1142222/1‑91 (MQ=255) tAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTatat < 1:297221/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATAtt < 2:597150/91‑1 (MQ=255) aaaaaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTg > 2:1215660/1‑91 (MQ=255) aaaaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTgg < 1:2495787/91‑1 (MQ=255) aaaaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTgg > 2:460548/1‑91 (MQ=255) aaaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGc > 1:575905/1‑91 (MQ=255) aaaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGc < 1:3736286/91‑1 (MQ=255) aaaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGc > 2:2790246/1‑91 (MQ=255) aaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCa < 1:777712/91‑1 (MQ=255) aaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCa < 1:3663279/91‑1 (MQ=255) aaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCa > 1:1818965/1‑91 (MQ=255) aaTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCa < 1:2499137/91‑1 (MQ=255) aTTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAg > 2:3323437/1‑91 (MQ=255) ttATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGt < 1:1197259/91‑1 (MQ=255) tATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGtt < 1:363087/91‑1 (MQ=255) aTGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTc < 1:3814394/91‑1 (MQ=255) tGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCt < 1:2191288/91‑1 (MQ=255) gCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTg < 2:1413936/91‑1 (MQ=255) gCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTg > 2:2432654/1‑91 (MQ=255) ccGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGa < 1:3173855/91‑1 (MQ=255) agagCAAGACATAAACAAGAGTTGAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTta < 2:850081/91‑1 (MQ=255) gagCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTtat < 2:723450/91‑1 (MQ=255) agCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTtata > 2:410180/1‑91 (MQ=255) gCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAACCATTTATaa > 1:146218/1‑91 (MQ=255) gCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATaa < 1:2628842/91‑1 (MQ=255) cAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATaaa > 2:2532600/1‑91 (MQ=255) aGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATc < 2:2131512/91‑1 (MQ=255) aGACATAAACAATAATGTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATc < 1:524556/91‑1 (MQ=255) gACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCt < 2:2893281/91‑1 (MQ=255) aCATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCtt < 2:3409593/91‑1 (MQ=255) cATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCttt < 1:1722448/91‑1 (MQ=255) aaCAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTACTGAAACATTTATAAATCTTTGAtt > 1:3687205/1‑91 (MQ=255) aCAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTa > 1:295068/1‑91 (MQ=255) aCAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTa > 2:2994763/1‑91 (MQ=255) aCAATAAGTTAGGAGGCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTGGATTa < 2:503435/91‑1 (MQ=255) cAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTAt > 1:1932267/1‑91 (MQ=255) cAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTAt > 2:2023118/1‑91 (MQ=255) aataatTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATg < 2:1382824/91‑1 (MQ=255) aataatTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATg > 1:3718346/1‑91 (MQ=255) taatTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGaa > 1:416350/1‑91 (MQ=255) taatTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGaa < 1:3645432/91‑1 (MQ=255) aatTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGAAc > 1:2368543/1‑91 (MQ=255) aatTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGAAc > 1:499040/1‑91 (MQ=255) atTTAGGAGcctagaacattgattattgttccagactcctaaattattgtttatgtcttgctctatttacggcataattttttaattgtac < 1:2349493‑M1/91‑83 (MQ=255) tttAGGAGcctagaacattgattattgttccagactcctaaatcattgtttatgtcttgctctatttacggcataattttttaattgtact > 2:1761513‑M1/1‑8 (MQ=255) tttAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGAACTc > 1:2809355/1‑91 (MQ=255) tttAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGAACTc < 1:100843/91‑1 (MQ=255) ttAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGAACTca < 2:1560723/91‑1 (MQ=255) tAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGAACTcac < 2:1675321/91‑1 (MQ=255) aGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctcctaaattattgtttatgtcttgctctatttacggcataattttttaattgtacttaa < 2:257229‑M2/91‑61 (MQ=255) aGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGAACTcaca > 1:2655768/1‑91 (MQ=255) aGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGAACTcaca > 1:1172345/1‑91 (MQ=255) ggAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGctcctaaattattgtttatgtcttgctctatttacggcataattttttaattgtacttaaa < 2:606775‑M2/91‑62 (MQ=255) gAGcctagaacattgattattgttccagactcctaaattattgtttatgtcttgctctatttacggcataattttttaattgtacttaaac < 2:1889685‑M1/91‑89 (MQ=255) gcctagaacattgattattgttccagactcctaaattattgtttatgtcttgctctatttacggcataattttttaattgtacttaaacct > 1:3873610‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCAGCTTTAGGAGCTACAGTTATGTTAGGTTTAAGTACAATTAAAAAATTATGCCGTAAATAGAGCAAGACATAAACAATAATTTAGGAGTCTGGAACAATAATCAATGTTCTAGGCTCCTAAATGTTATATTGGCAGTTCTGAAACATTTATAAATCTTTGATTATGAACTCACAACAG > USA300TCH1516_ALE/1895486‑1895665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |