| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2008942 = | 157 (0.770) | 16 (0.100) | 7/132 | NT | 10.5% | intergenic (+70/+121) | USA300HOU_RS10115/USA300HOU_RS10125 | hypothetical protein/Putative multidrug export ATP‑binding/permease protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2008991 = | 145 (0.870) | intergenic (+119/+72) | USA300HOU_RS10115/USA300HOU_RS10125 | hypothetical protein/Putative multidrug export ATP‑binding/permease protein | |||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTC > USA300TCH1516_ALE/2008852‑2009031 | gaagaaGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAA > 2:2243561‑M1/1‑91 (MQ=255) gcattcaaaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagaa < 1:160558‑M1/2‑1 (MQ=255) aagaagACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAA > 2:580495‑M1/1‑91 (MQ=255) cattcaaaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagaaa > 1:1243021‑M1/89‑91 (MQ=255) gaagaCTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAA > 2:647158‑M1/1‑91 (MQ=255) attcaaaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagaaaa < 2:1196671‑M1/4‑1 (MQ=255) agaCTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAG > 1:2273905‑M1/1‑91 (MQ=255) agaCTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCGCGAAATTAAATTTAAAAAAG < 2:1305517‑M1/91‑1 (MQ=255) caaaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGc < 2:1862006‑M1/7‑1 (MQ=255) cTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAG > 2:1743587‑M1/1‑91 (MQ=255) aaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAg < 2:1348254‑M1/9‑1 (MQ=255) aacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGt < 2:43012‑M1/10‑1 (MQ=255) ttGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTA > 1:1009362‑M1/1‑91 (MQ=255) ttGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTA > 1:1285535‑M1/1‑91 (MQ=255) ttGATCTATAGCGTTAAAACAATTTTATCAATTAAGGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTA < 2:3649025‑M1/91‑1 (MQ=255) cttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTaa > 2:3739047‑M1/80‑91 (MQ=255) cttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTaa < 1:773744‑M1/12‑1 (MQ=255) cttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTaa > 1:308021‑M1/80‑91 (MQ=255) gATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTCAG > 1:1535120‑M1/1‑91 (MQ=255) aTTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA > 1:3879756‑M1/1‑91 (MQ=255) tttATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGat > 2:3582720/1‑91 (MQ=255) tttATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGat < 2:912430/91‑1 (MQ=255) tataACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGatta > 2:1790246/1‑91 (MQ=255) ataACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGattat < 2:2465442/91‑1 (MQ=255) ataACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGattat > 1:3541078/1‑91 (MQ=255) cATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTc < 2:2748454/91‑1 (MQ=255) cATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTc > 1:1053454/1‑91 (MQ=255) aTTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCa < 1:3791380/91‑1 (MQ=255) tAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAAt < 1:3351396/91‑1 (MQ=255) aaaaCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAAtt > 1:2904112/1‑91 (MQ=255) aaaCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTa > 2:736262/1‑91 (MQ=255) aaCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTaa < 2:2047395/91‑1 (MQ=255) aaCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAAAAAAAAATAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTaa < 2:194271/91‑1 (MQ=39) aCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAg > 1:263400/1‑91 (MQ=255) aCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAg < 1:2300429/91‑1 (MQ=255) ttttATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAAGTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGaaaa < 2:3005304/91‑1 (MQ=255) tttATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAACTTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAAt > 2:1538842/1‑91 (MQ=255) tttATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAAt < 1:2372794/91‑1 (MQ=255) ttATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAAtc < 1:2550852/91‑1 (MQ=255) ttATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAAtc > 1:838809/1‑91 (MQ=255) tATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCt < 1:1067369‑M2/91‑2 (MQ=255) aTCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtc > 1:2036321‑M2/1‑89 (MQ=255) cagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATctct > 2:2650210‑M1/54‑91 (MQ=255) cAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtctt < 2:3527746‑M2/91‑5 (MQ=255) aaTTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtctta > 1:503531‑M2/1‑86 (MQ=255) tacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTAc > 2:1055557‑M1/51‑91 (MQ=255) ttAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaattgaaaataatcttact < 1:991652‑M1/91‑29 (MQ=255) ttAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttact > 2:3103837‑M2/1‑84 (MQ=255) tAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttactg > 2:2290240‑M2/1‑83 (MQ=255) caatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTg > 2:2573665‑M1/49‑91 (MQ=255) aatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGc > 1:317685‑M1/48‑91 (MQ=255) aatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGc > 2:2212139‑M1/48‑91 (MQ=255) aaTGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaattgaaaataatcttactgc < 2:1589276‑M1/91‑31 (MQ=255) tGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttactgctt < 1:2748949‑M2/91‑12 (MQ=255) tGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttactgctt < 2:747043‑M2/91‑12 (MQ=255) gCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaattgaaaataatcttactgcttt < 1:1541844‑M1/91‑34 (MQ=255) gCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttactgcttt > 1:1485041‑M2/1‑79 (MQ=255) gCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttactgcttt < 1:3935471‑M2/91‑13 (MQ=255) cttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCttt > 1:1467708‑M1/45‑91 (MQ=255) cacaATGAGATAAACTAATATTGAAGCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAGTATTTTCAATTAAGATAATCtcttactgcttttt > 1:1715263‑M2/1‑77 (MQ=255) acaATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTc < 2:133308/91‑1 (MQ=255) aaTGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTa < 2:3554375/91‑1 (MQ=255) aTGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTAt > 1:982329/1‑91 (MQ=255) tGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATg > 2:1388441/1‑91 (MQ=255) tGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATg > 2:1154193/1‑91 (MQ=255) tGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATg > 1:633798/1‑91 (MQ=255) gaTAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTa > 2:2908499/1‑91 (MQ=255) gaTAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTa > 2:1900766/1‑91 (MQ=255) gaTAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTa > 2:670751/1‑91 (MQ=255) aaaCTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGa < 2:2021301/91‑1 (MQ=255) aCTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTGCTATGTTATGAcc < 2:3863038/91‑1 (MQ=255) ctagtatTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGAccc < 1:3559539/87‑1 (MQ=255) cTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGAccc > 1:2140187/1‑91 (MQ=255) aaTATTGAATCTCGAAAGTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCcca < 2:1104334/91‑1 (MQ=255) atatTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTAATGCTTTTTCCATGTTAGGACCccac > 2:3429742/1‑91 (MQ=38) tatTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCccacc > 2:2810933/1‑91 (MQ=255) tatTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCccacc < 2:334330/91‑1 (MQ=255) tatTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCccacc < 2:3137265/91‑1 (MQ=255) atTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCccacca > 1:3126451/1‑91 (MQ=255) aTCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTg > 1:1505776/1‑91 (MQ=255) aTCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTg > 1:3197293/1‑91 (MQ=255) ctcGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGtt < 1:2825452/91‑1 (MQ=255) tcGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTa < 1:126203/91‑1 (MQ=255) cGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTAc > 2:251314/1‑91 (MQ=255) gAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATGTCTTACTTCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACa < 2:3050305/91‑1 (MQ=255) gAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACa < 1:497790/91‑1 (MQ=255) gAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACa < 1:114587/91‑1 (MQ=255) caattaaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACaa < 2:3932206/90‑1 (MQ=255) aattaaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACaaa < 1:1986518/91‑1 (MQ=255) attaaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAAt > 1:876812/1‑91 (MQ=255) taaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAAttt < 2:3768900/91‑1 (MQ=255) aaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAAtttt > 2:273566/1‑91 (MQ=255) aattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtc < 2:2127291/91‑1 (MQ=255) aattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtc > 1:1617458/1‑91 (MQ=255) tttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACGCCACCATCCTGTTACAAATTTtctc > 1:3696936/1‑91 (MQ=255) tttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtctc > 1:183596/1‑91 (MQ=255) tttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtctc < 1:1371627/91‑1 (MQ=255) tttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtctc < 1:2098719/91‑1 (MQ=255) ttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTctct > 2:2360802/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTc < 2:3777162/91‑1 (MQ=255) | GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTC > USA300TCH1516_ALE/2008852‑2009031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |