| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2090954 | 191 (0.940) | 15 (0.080) | 6/142 | NT | 8.0% | intergenic (‑188/+350) | USA300HOU_RS10575/USA300HOU_RS10590 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2090971 | 177 (0.980) | intergenic (‑205/+333) | USA300HOU_RS10575/USA300HOU_RS10590 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
AACATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCA > USA300TCH1516_ALE/2090864‑2091044 | cATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGaa > 2:2430042/1‑91 (MQ=255) aTGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGaaa < 2:3134434/91‑1 (MQ=255) gcgcAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAAcc < 2:3761523/91‑1 (MQ=255) gcgcAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAAcc > 1:1328384/1‑91 (MQ=255) cgcAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCa > 1:1539787/1‑91 (MQ=255) gcAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAg > 2:2988786/1‑91 (MQ=255) cAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGc > 2:849743/1‑91 (MQ=255) aaaCATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGcc < 2:2913635/91‑1 (MQ=255) aaaCATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGcc < 2:1749352/91‑1 (MQ=255) aaaCATGTTACCCTAATGAGCCCGTAAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGcc < 1:3686379/91‑1 (MQ=255) aaCATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCa > 2:1449807/1‑91 (MQ=255) aCATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATAGAAACCAGCCaa < 1:3032117/91‑1 (MQ=255) cATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCaaa < 1:2905529/91‑1 (MQ=255) cATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCaaa < 1:532824/91‑1 (MQ=255) tGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGt > 1:647135/1‑91 (MQ=255) gTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggt < 1:3223134‑M1/91‑16 (MQ=255) tACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAg < 2:679796/91‑1 (MQ=255) aCCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGc < 1:1152935‑M2/91‑2 (MQ=255) aCCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGc < 1:1095246‑M2/91‑2 (MQ=255) cccTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcg < 1:2802056‑M1/91‑20 (MQ=255) cccTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcg > 2:435090‑M2/1‑89 (MQ=255) ccTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcga < 1:767454‑M1/91‑21 (MQ=255) ccTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcga < 2:3627585‑M1/91‑21 (MQ=255) ccTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATATTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcga < 2:3878266‑M2/91‑4 (MQ=255) cTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcgat < 1:218149‑M1/91‑22 (MQ=255) tAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcgatg < 1:2540199‑M1/91‑23 (MQ=255) aaTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatgg > 2:3269‑M2/1‑85 (MQ=255) aaTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatgg < 1:918975‑M2/91‑7 (MQ=255) aaTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatgg > 1:866784‑M2/1‑85 (MQ=255) aaTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatgg > 1:867139‑M2/1‑85 (MQ=255) aTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggt > 1:219913‑M2/1‑84 (MQ=255) aTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggt > 2:3539516‑M2/1‑84 (MQ=255) aTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATGAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggt > 2:1553050‑M2/1‑84 (MQ=255) tGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggtt < 1:2809331‑M2/91‑9 (MQ=255) aGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAt < 1:2598074/91‑1 (MQ=255) gCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAtt > 2:2642130/1‑91 (MQ=255) cGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAttttt < 1:779782/91‑1 (MQ=255) tAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTAt > 2:3714436/1‑91 (MQ=255) tAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTAt < 1:820881/91‑1 (MQ=255) aaaaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTAtt < 1:3614467/91‑1 (MQ=255) aaaaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTAtt < 1:23581/91‑1 (MQ=255) aaaaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTAtt > 2:1020442/1‑91 (MQ=255) aaaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTg > 2:1651894/1‑91 (MQ=255) aaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGc < 1:3862880/91‑1 (MQ=255) aaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGc < 1:405811/91‑1 (MQ=255) aaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCt > 1:2567094/1‑91 (MQ=255) aGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCtt < 2:2598600/91‑1 (MQ=255) aGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCtt < 1:2895701/91‑1 (MQ=255) cGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAAt > 2:1997819/1‑91 (MQ=255) cGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAAt < 2:220590/91‑1 (MQ=255) gTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTc < 2:2992440/91‑1 (MQ=255) tGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCa > 1:3098153/1‑91 (MQ=255) gCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAAt < 2:535392/91‑1 (MQ=255) cTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATa > 1:1947526/1‑91 (MQ=255) aTTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAg > 1:1579906/1‑91 (MQ=255) aTTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAg < 2:233747/91‑1 (MQ=255) ttttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGc < 2:1099867/91‑1 (MQ=255) tttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCt < 1:893176/91‑1 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa < 1:1403764/91‑1 (MQ=255) attaaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGAtt < 2:1629753/91‑1 (MQ=255) ttaaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGATTGATTa > 2:3510735/1‑91 (MQ=255) taaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTAc < 2:950711/91‑1 (MQ=255) aaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACt < 1:844242/91‑1 (MQ=255) agattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAg < 1:1829540/91‑1 (MQ=255) agattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAg > 2:811298/1‑91 (MQ=255) gattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGa > 2:1259675/1‑91 (MQ=255) gattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGa < 1:2707703/91‑1 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc < 1:3274876/91‑1 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc < 2:2706255/91‑1 (MQ=255) ttaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAAGCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAcc < 1:3175443/91‑1 (MQ=255) ttaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAcc < 1:2257656/91‑1 (MQ=255) ttaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATCGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCATGATTACTAGAcc > 1:3960219/1‑91 (MQ=255) taataaCCATTTAACCATTGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCaa < 1:2074841/91‑1 (MQ=255) taataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCaa < 1:2492498/91‑1 (MQ=255) taataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCaa < 1:2430042/91‑1 (MQ=255) taataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCaa < 2:1539160/91‑1 (MQ=255) aataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAAt < 2:3801986/91‑1 (MQ=255) taaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGc > 1:3894404/1‑91 (MQ=255) aaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCATTAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCa > 1:3171737/1‑91 (MQ=255) aaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCa > 2:1863066/1‑91 (MQ=255) cATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATa < 1:102195/91‑1 (MQ=255) tAACCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttcacgggctc > 2:1207054‑M1/1‑9 (MQ=255) aaCCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctca > 1:1288070‑M1/1‑8 (MQ=255) aaCCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctca > 1:770384‑M1/1‑8 (MQ=255) aaCCATCGATACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGaa < 1:1084751/91‑1 (MQ=255) aaCCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGaa < 1:950205/91‑1 (MQ=255) ccATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcatt > 1:867013‑M1/1‑6 (MQ=255) ccATCGctaactttggctggtctcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcatt > 1:1312977‑M1/1‑6 (MQ=255) ccATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATa > 2:2768175/1‑91 (MQ=255) cATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcatta < 2:998490‑M1/91‑87 (MQ=255) cATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTA‑TTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATaaa > 1:3932131/1‑91 (MQ=255) aTCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattag < 2:1180978‑M2/91‑71 (MQ=255) aTCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATaaa > 2:575069/1‑91 (MQ=255) tCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattagg < 2:2527385‑M1/91‑89 (MQ=255) tCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattagg > 1:2319138‑M1/1‑3 (MQ=255) tCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattagg < 2:3332350‑M2/91‑72 (MQ=255) tCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattagg < 1:3895469‑M2/91‑72 (MQ=255) cGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattaggg < 1:3394776‑M2/91‑73 (MQ=255) gctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattagggt < 2:3067979‑M1/91‑91 (MQ=255) gAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattagggt < 2:1494802‑M2/91‑74 (MQ=255) | AACATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCA > USA300TCH1516_ALE/2090864‑2091044 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |