| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2307807 = | 151 (0.740) | 20 (0.120) | 11/128 | NT | 13.7% | intergenic (‑171/+65) | USA300HOU_RS11770/fecD_2 | hypothetical protein/Fe(3+) dicitrate transport system permease protein FecD |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2307852 = | 131 (0.810) | intergenic (‑216/+20) | USA300HOU_RS11770/fecD_2 | hypothetical protein/Fe(3+) dicitrate transport system permease protein FecD | |||||
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTA > USA300TCH1516_ALE/2307717‑2307897 | cTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATACTGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTCTTCAAGATGAATTC‑A < 1:3374258‑M1/91‑1 (MQ=255)cTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑A > 1:3735945‑M1/1‑91 (MQ=255) tATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AA > 2:162294‑M1/1‑91 (MQ=255) aTCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATCAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAA > 2:2328084‑M1/1‑91 (MQ=255) tCTTTCAAAATGAATACGAAAGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAA < 2:3776174‑M1/91‑1 (MQ=255) ctgttggggttatcattgcaattatcggtgcaccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttaaa > 1:765899‑M1/89‑91 (MQ=255) ttCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAG < 1:1345094‑M1/91‑1 (MQ=255) cAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGT < 1:161066‑M1/91‑1 (MQ=255) gggttatcattgcaattatcggtgcaccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGt < 1:3351150‑M1/9‑1 (MQ=255) gggttatcattgcaattatcggtgcaccagacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatggttagagtttAAAAAAGGt > 2:2978842‑M1/83‑91 (MQ=255) gggatatcattgcaattatcggtgcaccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGt > 1:3556667‑M1/83‑91 (MQ=255) aaaaTGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATATGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGATT > 2:2670306‑M1/1‑91 (MQ=255) aaaTGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTA > 1:2251091‑M1/1‑91 (MQ=255) gttatcattgcaattatcggtgcaccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTa < 1:3920995‑M1/11‑1 (MQ=255) aaTGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAA > 1:3465991‑M1/1‑91 (MQ=255) ttatcattgcacttatcggtgcagcatacttcttaatattattacgaagaatgaaataaataacatatgattagagtttAAAAAAGGTTaa > 2:3018191‑M1/80‑91 (MQ=255) aTGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAG < 1:1468883‑M1/91‑1 (MQ=255) tatcattgcaattatcggtgcaccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAg < 2:436229‑M1/13‑1 (MQ=255) tatcattgcaattatcggtgcaccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAg < 1:3005166‑M1/13‑1 (MQ=255) tGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGT < 1:401463‑M1/91‑1 (MQ=255) tGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGT < 2:509293‑M1/91‑1 (MQ=255) gTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATTAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTA > 2:1318085‑M1/1‑91 (MQ=255) gTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTA < 2:3337223‑M1/91‑1 (MQ=255) tttATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTAC > 2:2880728‑M1/1‑91 (MQ=255) tatgtatgCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACaa > 2:2406915/1‑91 (MQ=255) atgtatgCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAAt > 1:477086/1‑91 (MQ=255) tgtatgCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTTAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAAtt > 2:203004/1‑91 (MQ=255) tgtatgCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAAtt > 2:60884/1‑91 (MQ=255) gtatgCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAAAAAAAAAA‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTa < 2:2277153/91‑1 (MQ=255) atgCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGATTTA‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACt < 2:3278260/91‑1 (MQ=255) tgCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTg > 1:1633508/1‑91 (MQ=255) tgCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTg > 1:1220492/1‑91 (MQ=255) tatcggtgcaccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGa > 2:2848317‑M1/67‑91 (MQ=255) aaaaTAATGGATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGAtt < 2:2165171/91‑1 (MQ=255) aataatGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACgaaatcagtaatt < 1:955037‑M1/91‑14 (MQ=255) ggtgcaccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTc > 2:1580654‑M1/63‑91 (MQ=255) ataatGAATAATTACAGTTAGTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACgaaatcagtaattg < 2:3797868‑M1/91‑15 (MQ=255) attaataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCCTGTAATGTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTAc > 2:177790/4‑91 (MQ=255) atGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtac > 1:656296‑M2/1‑87 (MQ=255) atGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtac > 2:981178‑M2/1‑87 (MQ=255) tGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtact > 2:2719130‑M2/1‑86 (MQ=255) gAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACgaaatcagtaattgtactt < 2:3894640‑M1/91‑20 (MQ=255) gAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtgctt > 2:3500349‑M2/1‑85 (MQ=255) gAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtactt < 1:2061731‑M2/91‑7 (MQ=255) ccatacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACtt > 1:2256310‑M1/57‑91 (MQ=255) aataatTTCAGTTATTAATTATACGCTATTTCTTGTCTTTTTTCGAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACTTTTCCTGATTTCGTACTTa < 2:3118604/91‑1 (MQ=255) aataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtactta > 2:63385‑M2/1‑84 (MQ=255) aataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtactta > 1:2504394‑M2/1‑84 (MQ=255) aataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtactta > 2:1077218‑M2/1‑84 (MQ=255) aataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtactta < 1:187096‑M2/91‑8 (MQ=255) ataatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACgaaatcagtaattgtacttaa < 2:1982890‑M1/91‑22 (MQ=255) aatacttcttaatcttattactaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAGGTACAATTACTGATTTCGTACTTa > 2:725871‑M1/56‑91 (MQ=255) taatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaac < 1:2893711‑M2/91‑10 (MQ=255) tacttcttaatattattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAAc > 1:105668‑M1/54‑91 (MQ=255) aatTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttatcc > 1:1362992‑M2/1‑81 (MQ=255) aagtACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATGTTTCAAGATGAAATC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAAcc < 2:1517189/88‑1 (MQ=255) atTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaacct < 2:1257442‑M2/91‑12 (MQ=255) acttcttaatagtattacgaagaatgaaataactaacatatgattagagtttAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAAcc > 2:578548‑M1/53‑91 (MQ=255) ttACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaacctt < 1:1686283‑M2/91‑13 (MQ=255) tACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaaccttt > 2:2507537‑M2/1‑78 (MQ=255) tACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCgtacttaaccttt < 2:111861‑M2/91‑14 (MQ=255) gTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTa < 1:340726/91‑1 (MQ=255) gTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTa < 2:2272129/91‑1 (MQ=255) ttattaAATATACGCTATTTCTTGTAGTTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTGACCTTTTTTaa < 2:1540352/91‑1 (MQ=255) tattaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTaaa > 1:3120410/1‑91 (MQ=255) attaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAAc < 2:3220235/91‑1 (MQ=255) attaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAAc < 1:1782458/91‑1 (MQ=255) ttaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAAct < 2:2451826/91‑1 (MQ=255) ttaAATATACGCTATTTCTGGTAATGTTTCAAGATGAGTTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAAct < 2:1827982/91‑1 (MQ=255) aaaTATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAActct > 2:2575923/1‑91 (MQ=255) aaaTATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAActct > 1:1559914/1‑91 (MQ=255) tataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAATTTTAATTCAAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTaa > 2:829179/1‑91 (MQ=255) ataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATc > 1:2379895/1‑91 (MQ=255) ataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATc > 1:1040757/1‑91 (MQ=255) ataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATc < 2:3574775/91‑1 (MQ=255) aCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCat < 1:975836/91‑1 (MQ=255) gCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCatat < 2:1862952/91‑1 (MQ=255) aTTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgtt > 1:812689/1‑91 (MQ=255) aTTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgtt > 2:3358754/1‑91 (MQ=255) ttCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgttag > 1:3864936/1‑91 (MQ=255) ttGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgttagtta > 2:3616715/1‑91 (MQ=255) tGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTAt > 1:159075/1‑91 (MQ=255) gTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTATCCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTAtt < 1:2035995/91‑1 (MQ=255) gTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTAtt < 2:2649879/91‑1 (MQ=255) gTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTAtt > 1:2542870/1‑91 (MQ=255) tttCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttc > 1:2818150/1‑91 (MQ=255) tttCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACC‑TTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttct < 2:3446287/91‑1 (MQ=255) ttCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAtttt > 2:3727384/1‑89 (MQ=255) ttCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttct < 1:2631766/91‑1 (MQ=255) ttCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttct < 2:1394097/91‑1 (MQ=255) tCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttctt > 2:2182865/1‑91 (MQ=255) cAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttcttc > 1:2631292/1‑91 (MQ=255) gATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGta < 1:2775535/91‑1 (MQ=255) gATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGta > 1:1435279/1‑91 (MQ=255) gATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGta > 1:3227974/1‑91 (MQ=255) aTGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGtaa < 1:2974166/91‑1 (MQ=255) aTGAATTC‑AAAAAAGGCTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTTAACTCTAATCATACTTAAGTTATTCCTTTCTTCTtaa > 2:3037837/1‑91 (MQ=255) aaTTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGtaataa < 1:3073267/91‑1 (MQ=255) aaTTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACCCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGtaataa < 1:316789/91‑1 (MQ=255) ttC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAataata > 2:1672020/1‑91 (MQ=255) | CTATCTTTCAAAATGTTTATGTATGCAAAATAATGAATAATTACAGTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTC‑AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTA > USA300TCH1516_ALE/2307717‑2307897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |