New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2307807 = | 151 (0.740) | 20 (0.120) | 11/128 | NT | 13.7% | intergenic (‑171/+65) | USA300HOU_RS11770/fecD_2 | hypothetical protein/Fe(3+) dicitrate transport system permease protein FecD |
? | USA300TCH1516_ALE | 2307852 = | 131 (0.810) | intergenic (‑216/+20) | USA300HOU_RS11770/fecD_2 | hypothetical protein/Fe(3+) dicitrate transport system permease protein FecD |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
GTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATAACCCCAACAGGAA > USA300TCH1516_ALE/2307762‑2307942 | gTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTa < 2:2272130/91‑1 (MQ=255) gTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTa < 1:340715/91‑1 (MQ=255) ttattaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACACTTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTaa > 1:3172375/1‑91 (MQ=255) ttattaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTaa < 2:594327/91‑1 (MQ=255) tattaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTaaa > 1:3120410/1‑91 (MQ=255) attaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAAc < 2:3220235/91‑1 (MQ=255) ttaAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAAct < 2:1900088/91‑1 (MQ=255) aaaTATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAActct > 1:1559914/1‑91 (MQ=255) aaTATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTa > 2:1538092/1‑91 (MQ=255) tataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAAt < 2:2573052/91‑1 (MQ=255) tataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAAt < 1:29300/91‑1 (MQ=255) ataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATc > 1:1040757/1‑91 (MQ=255) ataCGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAACTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTATTAAACTCTAATc > 1:3955004/1‑91 (MQ=255) aCGCTATTTCTGGTAATTTTTCATGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATGTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCat < 2:3016601/91‑1 (MQ=255) cTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATg < 2:2714217/91‑1 (MQ=255) cTATTTCTTGTAATTTTCCAAGATGAACTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTACCTACTTAACCATATATAAACTCTAATCatatt > 2:2378563/1‑90 (MQ=255) tATTCCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgt > 1:3125653/1‑91 (MQ=255) aTTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgtt < 1:1600888/91‑1 (MQ=255) aTTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgtt > 1:3451091/1‑91 (MQ=255) ttCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgttag > 1:3865275/1‑91 (MQ=255) tCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgttagt < 1:282137/91‑1 (MQ=255) tCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgttagt < 1:2488328/91‑1 (MQ=255) ttGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATgttagtta > 2:3619596/1‑91 (MQ=255) gTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTATCCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTAtt < 1:2035995/91‑1 (MQ=255) gTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTAtt < 2:2649879/91‑1 (MQ=255) tAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTAttt < 2:1851204/91‑1 (MQ=255) aTTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCa < 2:1081943/91‑1 (MQ=255) ttCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAtttt > 2:3727384/1‑89 (MQ=255) ttCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttct < 1:2631791/91‑1 (MQ=255) tCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttctt < 2:225062/91‑1 (MQ=255) cAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttcttc > 1:2631517/1‑91 (MQ=255) cAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCAttcttc < 1:3284890/91‑1 (MQ=255) aaGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCg > 1:2308531/1‑91 (MQ=255) aGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGt < 1:1188114/91‑1 (MQ=255) gATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGta < 1:2775535/91‑1 (MQ=255) gATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGta > 1:1435279/1‑91 (MQ=255) aTGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGtaa > 1:3644353/1‑91 (MQ=255) aTGAATTCAAAAAAGGCTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTTAACTCTAATCATACTTAAGTTATTCCTTTCTTCTtaa > 2:3037837/1‑91 (MQ=255) aaTTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGtaataa < 1:305277/91‑1 (MQ=255) aTTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTaataat > 2:3528570/1‑91 (MQ=255) ttCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAataata > 2:1672020/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAatat > 1:2072071/1‑91 (MQ=255) cAAATAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTATCCTTTTTTAAACGCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATAtt < 2:535701/91‑1 (MQ=255) AAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTa > 2:3345811‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTaa < 1:56466‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTaag > 2:1611930‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTaaga < 1:3521623‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTaagaa > 1:2613146‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTaagaa < 2:3124458‑M1/91‑1 (MQ=255) AGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTaagaag > 2:2443528‑M1/1‑91 (MQ=255) ggttaagtacgaaatcagtaattgtacttaaccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGt > 1:2209274‑M2/40‑91 (MQ=255) GGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGt > 2:834135‑M1/1‑91 (MQ=255) gttaagtacgaaatcagtaattgtacttaaccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTa > 1:105668‑M2/39‑91 (MQ=255) GTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTa > 1:306686‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTa > 2:338523‑M1/1‑91 (MQ=255) TAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATg < 1:1430096‑M1/91‑1 (MQ=255) TAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATg > 1:895587‑M1/1‑91 (MQ=255) TAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATg < 1:3783279‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATgg > 2:1300212‑M1/1‑91 (MQ=255) GTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTg > 2:1393523‑M1/1‑91 (MQ=255) TACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGc > 2:2954480‑M1/1‑91 (MQ=255) acgaaatcagtaattgtacttaaccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCa > 1:262806‑M2/32‑91 (MQ=255) acgaaatcagtaattgtacttaaccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCa > 2:2486704‑M2/32‑91 (MQ=255) ACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCa > 2:485251‑M1/1‑91 (MQ=255) ACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCa > 2:2173244‑M1/1‑91 (MQ=255) ACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCa > 1:594151‑M1/1‑91 (MQ=255) CAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCAc > 2:1167081‑M1/1‑91 (MQ=255) aaTTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCAcc < 1:2521402/91‑1 (MQ=255) aaTTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCAcc < 2:3147283/91‑1 (MQ=255) aaTTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCAcc < 1:965037/91‑1 (MQ=255) aTTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATGTGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCg < 2:3473834/91‑1 (MQ=255) aTTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCg > 2:1032040/1‑91 (MQ=255) ttACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGa < 1:2557317/91‑1 (MQ=255) tACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGAt < 1:1662881/91‑1 (MQ=255) aCTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATa > 1:803790/1‑91 (MQ=255) aCTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATa < 2:3857157/91‑1 (MQ=255) aCTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATa > 2:1436550/1‑91 (MQ=255) cTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATaa < 2:586146/91‑1 (MQ=255) tGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAAt < 2:2576234/91‑1 (MQ=255) tttCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGc < 2:2888776/91‑1 (MQ=255) tttCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGc > 2:1820318/1‑91 (MQ=255) tttCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGc < 2:1990707/91‑1 (MQ=255) ttCGTACTTAACC‑TTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCaa < 2:3936612/91‑1 (MQ=255) tCGTACTTAACCTTTTTAAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCaa < 1:2677894/91‑1 (MQ=255) cGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAAt < 1:1628412/91‑1 (MQ=255) gtacttaaccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATg > 2:3431792‑M2/17‑91 (MQ=255) tacttaaccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCTTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGa > 2:217552‑M2/16‑91 (MQ=255) tacttaaccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGa > 1:176434‑M2/16‑91 (MQ=255) acttaaccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGAt > 2:3603794‑M2/15‑91 (MQ=255) cttaaccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATa < 1:3005151‑M2/78‑1 (MQ=255) ttatccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATaa < 2:987325‑M2/79‑1 (MQ=255) ttaacctttcttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATaa < 1:3546167‑M2/79‑1 (MQ=255) taaccttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATAAc < 1:3920900‑M2/80‑1 (MQ=255) accttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATAAccc < 1:3351150‑M2/82‑1 (MQ=255) accttttttAAACTCTAACCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTCTGGTGCACCGATAATTGCAATGATAAccc > 2:2978842‑M2/10‑91 (MQ=255) cttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATAACCCCa > 2:2871053‑M2/8‑91 (MQ=255) ttttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATAACCCCaa > 2:1567405‑M2/7‑91 (MQ=255) ttttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATAACCCCAACa > 2:1604818‑M2/5‑91 (MQ=255) tttAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATAACCCCAACAg > 1:765899‑M2/4‑91 (MQ=255) aaaCTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATAACCCCAACAGGaa < 1:86348/91‑1 (MQ=255) | GTTATTAAATATACGCTATTTCTTGTAATTTTTCAAGATGAATTCAAAAAAGGTTAAGTACAATTACTGATTTCGTACTTAACCTTTTTTAAACTCTAATCATATGTTAGTTATTTCATTCTTCGTAATAATATTAAGAAGTATGGTGCACCGATAATTGCAATGATAACCCCAACAGGAA > USA300TCH1516_ALE/2307762‑2307942 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |