| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2684279 = | 151 (0.740) | 12 (0.070) | 9/136 | NT | 8.3% | intergenic (+38/+132) | mvaS/ogt | Hydroxymethylglutaryl‑CoA synthase/Methylated‑DNA‑‑protein‑cysteine methyltransferase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2684320 = | 138 (0.800) | intergenic (+79/+91) | mvaS/ogt | Hydroxymethylglutaryl‑CoA synthase/Methylated‑DNA‑‑protein‑cysteine methyltransferase | |||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
CTACTTATCAAATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTGA > USA300TCH1516_ALE/2684190‑2684369 | tataaaggatccaggcattaggaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaca > 1:1331031‑M1/90‑91 (MQ=255)cTACTTATCAAATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCA > 1:2777353‑M1/1‑91 (MQ=255) aCTTATCAAATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGC > 2:2779358‑M1/1‑91 (MQ=255) aCTTATCAAATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGC > 1:2008712‑M1/1‑91 (MQ=255) aaggatccaggcattaggaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaacagcag > 1:748028‑M1/86‑91 (MQ=255) aggatccaggcattaggaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGt > 1:2495532‑M1/85‑91 (MQ=255) ggatccaggcattaggaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTa < 1:3359578‑M1/8‑1 (MQ=255) ggatccaggcattaggaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTa > 1:3722700‑M1/84‑91 (MQ=255) aTCAAATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTA > 1:3648515‑M1/1‑91 (MQ=255) aTCAAATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTA > 1:387804‑M1/1‑91 (MQ=255) tCAAATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAA > 2:3942947‑M1/1‑91 (MQ=255) cAAATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAG < 2:3499784‑M1/91‑1 (MQ=255) atccaggcattaggaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAg > 1:1730881‑M1/82‑91 (MQ=255) tccaggcattatgaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGa > 2:525916‑M1/81‑91 (MQ=255) tccaggcattaggaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGa < 2:514031‑M1/11‑1 (MQ=255) tccaggcattaggaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGa > 2:1449090‑M1/81‑91 (MQ=255) tccaggcattaggaaaacttcaataatgagtcaaataggcataatgaaatcaatcaatacgaagtgctataaaaagagaaCAGCAGAAAGa < 2:3096602‑M1/11‑1 (MQ=255) ccaggcattaggaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGAc > 2:2075820‑M1/80‑91 (MQ=255) aaTATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGAC < 2:1281981‑M1/91‑1 (MQ=255) atatTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGAcc < 2:1507790/91‑1 (MQ=255) atTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCAc > 1:187810/1‑91 (MQ=255) ttGAATATAACGGTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACt < 2:3645543/91‑1 (MQ=255) ttGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACt > 2:1546726/1‑91 (MQ=255) tGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACtt < 2:389014/91‑1 (MQ=255) tGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACtt < 1:1992075/91‑1 (MQ=255) tGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACtt < 2:1301200/91‑1 (MQ=255) gAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTc < 2:2723616/91‑1 (MQ=255) taggaaaacttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTa > 1:1907181‑M1/72‑91 (MQ=255) aaaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTa > 1:281111/1‑91 (MQ=255) aaaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTa > 2:875511/1‑91 (MQ=255) aaaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTa < 2:3327970/91‑1 (MQ=255) aaaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTa < 1:275019/91‑1 (MQ=255) aaaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTa > 1:2950109/1‑91 (MQ=255) aaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTaa < 2:2434313/91‑1 (MQ=255) tAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaatta < 2:2073487‑M1/91‑12 (MQ=255) tAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAAtt < 2:2256204/91‑1 (MQ=255) tAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAAtt < 1:3933196/91‑1 (MQ=255) aaCGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTg > 2:3912333/1‑91 (MQ=255) aCGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGa > 1:96917/1‑91 (MQ=255) gTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGaaa > 2:404029/1‑91 (MQ=255) ttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATc > 2:3920226‑M1/63‑91 (MQ=255) ttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATc > 1:1260826‑M1/63‑91 (MQ=255) ttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATc > 1:2193537‑M1/63‑91 (MQ=255) tcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCg > 1:107670‑M1/62‑91 (MQ=255) caataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGt > 2:558835‑M1/61‑91 (MQ=255) tatCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCgtcttac < 1:519515‑M2/91‑8 (MQ=255) atgtgtcaaagaggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTAc > 2:1233418‑M1/56‑91 (MQ=255) atCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAACCgtcttact < 1:3788171‑M2/91‑9 (MQ=255) tCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaattagaagtggtcttactg < 1:1901144‑M1/91‑27 (MQ=255) acaGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCgtcttactgct > 1:3574673‑M2/1‑80 (MQ=255) caGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCgtcttactgctg < 1:1711936‑M2/91‑13 (MQ=255) aCCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTtc < 1:2210151/91‑1 (MQ=255) ccAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTtct > 1:2814085/1‑91 (MQ=255) cAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTtctc < 1:2360404/91‑1 (MQ=255) cAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTtctc < 2:1701546/91‑1 (MQ=255) gagTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTa > 1:3434768/1‑91 (MQ=255) agtagtCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTAt > 2:3709852/1‑91 (MQ=255) gtagtCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTAtt > 1:1420566/1‑91 (MQ=255) tagtCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGGTGTTCTCTAttt < 1:3026312/91‑1 (MQ=255) tagtCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTAttt > 2:61571/1‑91 (MQ=255) agtCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTta > 2:2972465/1‑91 (MQ=255) gtCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTtat > 2:791205/1‑91 (MQ=255) gtCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTtat < 1:2328671/91‑1 (MQ=255) tCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTtata < 1:3438389/91‑1 (MQ=255) cGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATaa < 2:1662169/91‑1 (MQ=255) cGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATaa > 2:2806730/1‑91 (MQ=255) ggTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAac < 1:912953/91‑1 (MQ=255) gtgtATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAaca < 2:710487/91‑1 (MQ=255) tgtATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAacac < 1:1034874/91‑1 (MQ=255) tATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACtt < 1:3115864/91‑1 (MQ=255) tATTTAAAACACATACAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACtt > 2:1943727/1‑91 (MQ=255) tttAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCg > 2:956380/1‑91 (MQ=255) ttAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGt < 2:373082/91‑1 (MQ=255) aaCACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtg > 1:1508241/1‑91 (MQ=255) aaCACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtg < 2:1586203/91‑1 (MQ=255) acacATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtga < 1:2397176/91‑1 (MQ=255) cacaTATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgaa < 1:1006092/91‑1 (MQ=255) caTATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaattagaagtggtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaat > 2:3402675‑M1/1‑32 (MQ=255) caTATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgactg > 2:1123959/1‑91 (MQ=255) caTATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgaatg > 1:26692/1‑91 (MQ=255) caTATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgaatg > 2:1123868/1‑91 (MQ=255) ataataAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTgaatgaat < 2:3281038/91‑1 (MQ=255) aatatAACCTAAAAACAGCAGTAAGACAGCTTTTCATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTTTCTATTTATAATGCTTCGTCTTGAATGAATTc < 2:2312603/91‑1 (MQ=255) aataaAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTc < 1:3553628/91‑1 (MQ=255) aaaaCCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCAtt < 1:366905/91‑1 (MQ=255) aaaCCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTa < 1:2474284/91‑1 (MQ=255) aaCCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTAt < 1:3250727/91‑1 (MQ=255) aCCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTAGTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATg < 2:3549071/91‑1 (MQ=255) ccTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGc > 1:490870/1‑91 (MQ=255) ccTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTAATGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGc > 2:2550057/1‑91 (MQ=255) cTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGcc > 1:2620597/1‑91 (MQ=255) tAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCt > 2:669179/1‑91 (MQ=255) aaaGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTAt < 1:381565/91‑1 (MQ=255) aaGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTAtt > 2:2481758/1‑91 (MQ=255) agcagcAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTAttt > 1:2396605/1‑91 (MQ=255) gcagcaGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTg < 2:1794230/91‑1 (MQ=255) cagcagTAAGGCgatttcaattagaagtggtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctg < 1:1784062‑M1/91‑80 (MQ=255) cagcagTAAGACgatttcaattagaagtggtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctg < 2:2130216‑M1/91‑80 (MQ=255) CAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTGa > 2:213181‑M1/1‑91 (MQ=255) CAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTGa < 2:2907262‑M1/91‑1 (MQ=255) | CTACTTATCAAATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATATAATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTGA > USA300TCH1516_ALE/2684190‑2684369 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |