| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2687471 = | 160 (0.790) | 29 (0.170) | 12/138 | NT | 19.4% | intergenic (+25/+44) | clpL/USA300HOU_RS13835 | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpL/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2687511 = | 104 (0.590) | intergenic (+65/+4) | clpL/USA300HOU_RS13835 | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpL/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
CATACAGACGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGCTGTTCTGTTCCACAAC > USA300TCH1516_ALE/2687381‑2687561 | cATACAGACGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCa > 1:854549/1‑91 (MQ=255)aacaaggaaaatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaa < 1:1136809‑M1/1‑1 (MQ=255) tACAGACGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCaaa < 2:358777/91‑1 (MQ=255) caaggaaaatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaaaaaataaaaa > 2:3546142‑M1/89‑91 (MQ=255) aCAGACGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCaaaa < 2:801447/91‑1 (MQ=255) aCAGACGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCaaaa > 1:1488198/1‑91 (MQ=255) aCAGACGTTAAACATCTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTATATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCaaaa > 1:3363542/1‑91 (MQ=255) cAGACGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCaaaaa < 1:1852286/91‑1 (MQ=255) cAGACGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCaaaaa > 1:3844697/1‑91 (MQ=255) aggaaaatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaaaaaa > 2:3449816‑M1/87‑91 (MQ=255) aggaaaatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaaaaaa > 1:2010617‑M1/87‑91 (MQ=255) ggaaaatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcatttcccagggaaataattaaAAAAAt < 2:3189637‑M1/6‑1 (MQ=255) gaaaatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATg > 1:3334914‑M1/85‑91 (MQ=255) gACGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATg > 2:3822646/1‑91 (MQ=255) aaaatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGa < 1:2418296‑M1/8‑1 (MQ=255) aCGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGa > 2:260977/1‑91 (MQ=255) cGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAg > 1:1637049/1‑91 (MQ=255) cGTCAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGTATCAAAAATGAg < 1:3055025/91‑1 (MQ=255) aaatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAg > 1:2912118‑M1/83‑91 (MQ=255) aaatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAg > 1:1867535‑M1/83‑91 (MQ=255) aaatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAg < 1:769267‑M1/9‑1 (MQ=255) aatgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGc < 1:3088985‑M1/10‑1 (MQ=255) aatgtggtacaagtgacattaatcgtggttgttgtggaacagaacagcacaaagcgaatcaatttccagggaaataattaaAAAAATGAGc > 2:371504‑M1/82‑91 (MQ=255) ttAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCa < 1:910082/91‑1 (MQ=255) atgtggtacatgtgacattaatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCa > 1:2202257‑M1/81‑91 (MQ=255) aaaCATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCCAAAATGAGCATc > 2:3288071/1‑91 (MQ=255) aaCATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCa < 2:565310/91‑1 (MQ=255) aaCATGTGGATAGAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCa < 2:1646807/91‑1 (MQ=255) aCATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAg > 1:725027/1‑91 (MQ=255) aCATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAg > 2:3088985/1‑91 (MQ=255) aTGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGt < 1:2153545/91‑1 (MQ=255) tgtgGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTc > 1:2174753/1‑91 (MQ=255) gtgGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCg < 2:1452035/91‑1 (MQ=255) gtgGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCg > 1:2694660/1‑91 (MQ=255) gtgGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCg < 1:1343364/91‑1 (MQ=255) gtgGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCg > 1:1160642/1‑91 (MQ=255) tgGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGc > 1:3538690/1‑91 (MQ=255) atatAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGCGCATCAGGTCGCCCt > 2:1521590/1‑91 (MQ=255) atatAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCt > 1:3752219/1‑91 (MQ=255) atatAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCt > 1:2851161/1‑91 (MQ=255) tataGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCtt > 1:2455289/1‑91 (MQ=255) taGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCGGGTCGCCCTTGc > 1:962717/1‑91 (MQ=255) gATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCt > 2:2497535/1‑91 (MQ=255) taatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCtg > 2:557569‑M1/63‑91 (MQ=255) aTGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATTACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCtg < 2:3568603/91‑1 (MQ=255) aatcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCtgt > 1:2874637‑M1/62‑91 (MQ=255) gTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCtgtg > 2:3297896/1‑91 (MQ=255) gTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCtgtg > 1:2817498/1‑91 (MQ=255) atcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCtgtg > 1:3692145‑M1/61‑91 (MQ=255) ttGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGc < 1:1423707/91‑1 (MQ=255) tcgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGc > 1:2804796‑M1/60‑91 (MQ=255) tGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCt < 2:2323514/91‑1 (MQ=255) cgtgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCt > 2:2273192‑M1/59‑91 (MQ=255) tgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCa > 1:1015299‑M1/57‑91 (MQ=255) tgattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCa > 1:2837848‑M1/57‑91 (MQ=255) agattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCa > 2:3935026‑M1/57‑91 (MQ=255) gattgttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCAt > 1:3885128‑M1/56‑91 (MQ=255) gATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCAtt > 1:2559821/1‑91 (MQ=255) aTAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGTCACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCAttt < 2:2583724/91‑1 (MQ=255) ttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCAtttttt > 1:52190‑M1/51‑91 (MQ=255) ttgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaaataattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCAtttttt > 1:1251885‑M1/51‑91 (MQ=255) aCGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCAtttttt > 2:3846621/1‑91 (MQ=255) tgtggaacagaacagcacacagcgaatcattttccagggaattaattaaAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCAttttttt > 2:3473279‑M1/50‑91 (MQ=255) gAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTa > 2:2721631/1‑91 (MQ=255) aTTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAat < 2:1781565/91‑1 (MQ=255) aTTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAat < 1:1508514/91‑1 (MQ=255) ttAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTGatt > 1:3561254/1‑91 (MQ=255) ttAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAatt > 1:548491/1‑91 (MQ=255) ttAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAatt > 1:2133435/1‑91 (MQ=255) tAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTGCACCCTACCGCGCAACAAAACTGAACAGCGGGCCGCCACTGCCTGTGCTCAGGTGTTCAatta < 2:3919459/91‑1 (MQ=255) gTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAattatt > 2:164850/1‑91 (MQ=255) cGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTc > 2:1188543/1‑91 (MQ=255) gTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTcc < 2:2464033/91‑1 (MQ=255) aaaaGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCt > 1:1192869/1‑91 (MQ=255) ggTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGaa > 2:2806904/1‑91 (MQ=255) tAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGaaaa < 1:47375/91‑1 (MQ=255) aCGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTc > 2:2126173/1‑91 (MQ=255) cacTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCtg < 2:2038959/91‑1 (MQ=255) acTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCtgt < 1:1002019/91‑1 (MQ=255) acTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCtgt < 2:2951632/91‑1 (MQ=255) aaCATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGct < 1:2177675/91‑1 (MQ=255) aaCATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGct > 2:2532257/1‑91 (MQ=255) aaCATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGct < 1:1613738/91‑1 (MQ=255) aaCATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGct > 1:429671/1‑91 (MQ=255) cATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGctgt < 1:1051771/91‑1 (MQ=255) tatCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGctgttc < 2:893786/91‑1 (MQ=255) atCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGctgttct < 1:1117788/91‑1 (MQ=255) tCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGctgttctg > 2:1850843/1‑91 (MQ=255) tCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGctgttctg > 1:2572994/1‑91 (MQ=255) cgcgCATCAAAAATGATCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGctgttctgt < 2:3038965/91‑1 (MQ=255) cgcgCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGctgttctgt < 1:3485055/91‑1 (MQ=255) cgcgCAGCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGctgttctgt < 1:3919911/91‑1 (MQ=255) gcgcATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGctgttctgtt > 1:3220595/1‑91 (MQ=255) cgcATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGCtgttctgttc < 1:3822786/91‑1 (MQ=255) cgcATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGCtgttctgttc < 1:2619111/91‑1 (MQ=255) gcATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGCTGTTCTGTTcc < 2:467593/91‑1 (MQ=255) aTCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGCTGTTCTGTTCcac < 1:2278801/91‑1 (MQ=255) cAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGCTGTTCTGTTCCacaa < 1:2336232/91‑1 (MQ=255) cAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGCTGTTCAGTTCCacaa > 1:3786208/1‑91 (MQ=255) AAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGCTGTTCTGTTCCacaac > 2:2199737‑M1/1‑91 (MQ=255) | CATACAGACGTTAAACATGTGGATATAGATGTTGAGGATAACGAATTAGTCGTAAAAGGTAAATAACGACACTTTAACATATCGCGCATCAAAAATGAGCATCAGGTCGCCCTTGCCTGTGCTCATTTTTTTAATTATTTCCCTGGAAAATGATTCGCTGTGTGCTGTTCTGTTCCACAAC > USA300TCH1516_ALE/2687381‑2687561 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |