| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2693368 = | 148 (0.730) | 33 (0.190) | 13/136 | NT | 20.3% | intergenic (+39/+317) | mtrR/rocA | HTH‑type transcriptional regulator MtrR/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2693417 = | 134 (0.780) | intergenic (+88/+268) | mtrR/rocA | HTH‑type transcriptional regulator MtrR/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
CGAAGATATTGATAACATTTTCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAAACAACTGATACACA > USA300TCH1516_ALE/2693278‑2693458 | cGAAGATATTGATAACATTTTCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑A > 2:695500‑M1/1‑91 (MQ=255) aagtcatttagatagcggatttatttttttcttcatagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataaa < 1:3071190‑M1/2‑1 (MQ=255) aagtcatttagatagcggatttatttttttcttcatagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataaa > 1:2424076‑M1/90‑91 (MQ=255) aGATATTGATAACATTTTCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAA > 1:996798‑M1/1‑91 (MQ=255) gtcatttagatagcggatttatttttttcttcatagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataaaaa > 2:3952514‑M1/88‑91 (MQ=255) atatTGATAACATTTTCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAAC < 2:549639‑M1/91‑1 (MQ=255) tatTGATAACATTTTCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACG > 2:1830210‑M1/1‑91 (MQ=255) atttagatagcggatttatttttttcttcatagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACg < 1:3315810‑M1/7‑1 (MQ=255) atttagatagcggatttatttttttcttcatagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACg > 1:1787710‑M1/85‑91 (MQ=255) tttagatagcggatttatttttttcttcatagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGa < 1:2056718‑M1/8‑1 (MQ=255) ttGATAACATTTTCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGAT > 1:1013833‑M1/1‑91 (MQ=255) ttGATAACATTTTCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGAT < 2:2015700‑M1/91‑1 (MQ=255) tagatagcggatttatttttttctttatagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATa < 2:2790938‑M1/10‑1 (MQ=255) tagatagcggatttatttttttcttcatagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATa > 2:1906744‑M1/82‑91 (MQ=255) aaCATTTTCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAgtgt > 1:1573406/1‑91 (MQ=255) aTTTTCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTaca > 1:626359/1‑91 (MQ=255) tttCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTagtacac < 1:162698‑M1/91‑8 (MQ=255) ttCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGt > 1:3040828/1‑91 (MQ=255) ttCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGt > 1:2531810/1‑91 (MQ=255) tCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGtt > 1:375044/1‑91 (MQ=255) tCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGtt > 2:296054/1‑91 (MQ=255) tttatttttttcttcatagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATAGTGTACACGtt > 1:271208‑M1/71‑91 (MQ=255) aTAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAAt < 2:2896736/91‑1 (MQ=255) aTAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAAt > 2:1550279/1‑91 (MQ=255) tAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATg < 1:2683655/91‑1 (MQ=255) tAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATg > 1:2922973/1‑91 (MQ=255) gATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGaa > 1:488301/1‑91 (MQ=255) gATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGaa < 2:430369/91‑1 (MQ=255) ttAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACTAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAAtt > 2:3476665/1‑91 (MQ=255) aTCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCgt > 1:3907314/1‑91 (MQ=255) cAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCgtgt > 2:2826144/1‑91 (MQ=255) catagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGta > 1:1252248‑M1/57‑91 (MQ=255) atatTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAATAAAAAACGATAGTagtacacgaattcattaacgtgt < 1:592839‑M1/91‑24 (MQ=255) atatTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTagtacacgaattcattaacgtgta < 1:3399146‑M1/91‑25 (MQ=255) atatTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGtac > 1:1221899/1‑91 (MQ=255) tatTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGtact < 1:1994762/91‑1 (MQ=255) atagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGtac > 1:2824834‑M1/56‑91 (MQ=255) atagtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGtac > 2:1441081‑M1/56‑91 (MQ=255) ttAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAATAAAAAACGATAGTagtacacgaattcattaacgtgtaca < 2:1768354‑M1/91‑27 (MQ=255) ttAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTac < 1:1406567‑M2/91‑3 (MQ=255) ttAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTac > 1:3355125‑M2/1‑89 (MQ=255) tAATATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTAGTact > 1:3116274‑M2/1‑88 (MQ=255) tAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTact > 1:257612‑M2/1‑88 (MQ=255) gtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGtactac > 1:1841730‑M1/53‑91 (MQ=255) gtttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcaagataaaaaaaAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGtactac > 2:1798813‑M1/53‑91 (MQ=255) gtttatgtgttgtatataatttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGtactac > 2:3395592‑M1/53‑91 (MQ=255) gttaatgtgttgtgtagcagttgtttgtatagcgataagcacgagaaaaataAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGtactac > 2:2635329‑M1/53‑91 (MQ=255) tttatgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTactact > 2:1084949‑M1/52‑91 (MQ=255) aGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTactat > 2:2161947‑M2/1‑86 (MQ=255) aGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTactat > 2:836623‑M2/1‑86 (MQ=255) gATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTactatc > 1:1486044‑M2/1‑85 (MQ=255) atgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATc > 1:2245456‑M1/49‑91 (MQ=255) aTTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTagtacacgaattcattaacgtgtacactatcg < 2:1272043‑M1/91‑33 (MQ=255) aTTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTactatcg < 1:1858700‑M2/91‑8 (MQ=255) tgtgttgtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCg > 2:2526148‑M1/48‑91 (MQ=255) tAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAATAAAAAACGATAGTagtacacgaattcattaacgtgtacactatcgt < 1:3014173‑M1/91‑34 (MQ=255) tAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTagtacacgaattcattaacgtgtacactatcgtt < 1:274349‑M1/91‑35 (MQ=255) aTAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTactatcgttttt < 1:1254649‑M2/91‑13 (MQ=255) aTAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTactatcgttttt < 1:154125‑M2/91‑13 (MQ=255) tagtagATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGtttttt > 1:1449870/1‑91 (MQ=255) gtgtatcagttgttttaatagcgataagcacgataaaaataAAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGtttttt > 2:3351935‑M1/42‑91 (MQ=255) gtagATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTtttttat < 1:231803/91‑1 (MQ=255) tagATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTtttttatt > 2:3849152/1‑91 (MQ=255) tagATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTtttttatt < 1:698191/91‑1 (MQ=255) agATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTtttttattt < 1:60213/91‑1 (MQ=255) agaAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATc < 2:2259246/91‑1 (MQ=255) aaaCTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGt < 1:759360/91‑1 (MQ=255) aaaCTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGCGTACCCGTTAATGAATTCGTGGACTCCCATCGTCTATTATTCTCATctt > 2:1657671/1‑89 (MQ=255) acccATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGc < 1:1307957/88‑1 (MQ=255) aCTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGc < 1:1434173/91‑1 (MQ=255) cTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCt > 1:2986163/1‑91 (MQ=255) tCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCtt < 1:2005441/91‑1 (MQ=255) tCATGAGCGTTACCAACAGTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCtt < 1:3758744/91‑1 (MQ=255) aTGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATCGTGCACACGTTACTGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTAt > 1:3162401/1‑91 (MQ=255) aTGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTAt > 1:2595531/1‑91 (MQ=255) aTGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTAt > 1:956656/1‑91 (MQ=255) aGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGc > 2:2434099/1‑91 (MQ=255) aGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGc > 2:3152398/1‑91 (MQ=255) aGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCCTATCGc > 2:914890/1‑91 (MQ=255) cGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTa < 1:949316/91‑1 (MQ=255) gTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTAt < 1:3501859/91‑1 (MQ=255) ttACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTAtt > 2:2001343/1‑91 (MQ=255) ttACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTAtt < 1:1097789/91‑1 (MQ=255) ttACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTAtt > 1:3730469/1‑91 (MQ=255) ttACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTAtt < 1:684771/91‑1 (MQ=255) ttACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTAtt > 2:1935021/1‑91 (MQ=255) aCCAACATTCATCAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTCATTAATTCGCGTACTACCATCGTTTCTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTCTTac > 2:343819/1‑90 (MQ=255) ccAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTaaa < 1:2111590/91‑1 (MQ=255) aaCATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAaac > 2:666160/1‑91 (MQ=255) cATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAaacaa < 1:691226/91‑1 (MQ=255) aTTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAaacaac > 1:362001/1‑91 (MQ=255) ttCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAAACAACt < 1:3924902/91‑1 (MQ=255) ttCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAAACAACt < 1:3287069/91‑1 (MQ=255) ttCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAAACAACt > 1:1158130/1‑91 (MQ=255) taat‑aaAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAAACAACTGATa > 2:906501/1‑91 (MQ=255) aat‑aaAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAAACAACTGATac > 2:2088525/1‑91 (MQ=255) at‑aaAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTactatcgttttttataatgaatgttggtaacgctcatgagtttctcatctac < 2:1119024‑M2/91‑53 (MQ=255) t‑aaAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAAACAACTGATacac < 2:3600955/91‑1 (MQ=255) aaaaaCGATAGTagtacacgaattcattaacgtgtacactatcgtttttattatgaatgttggtaacgctcatgagtttctcatctactat > 2:3795470‑M1/1‑12 (MQ=255) aaaaaCGATAGTGTACACGTAAATGAATTCGTGAACCACTATAGTTTTTTTACTTAATCCGCCTTCTCGCTATTATAACACCTGGTacaaa > 2:3288665/1‑89 (MQ=255) | CGAAGATATTGATAACATTTTCCATAGATTAATCAATATTAAGATTAAATAGTAGATGAGAAACTCATGAGCGTTACCAACATTCATAAT‑AAAAACGATAGTGTACACGTTAATGAATTCGTGTACTACTATCGTTTTTTATTTTTATCGTGCTTATCGCTATTAAAACAACTGATACACA > USA300TCH1516_ALE/2693278‑2693458 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |