| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2699622 = | 78 (0.380) | 12 (0.070) | 6/140 | NT | 12.4% | intergenic (+29/+61) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2699690 = | 101 (0.570) | coding (992/999 nt) | ldhD_2 | D‑lactate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
GTAAAGTTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGT > USA300TCH1516_ALE/2699532‑2699712 | atactgaagctgcagttaaaaatctaattgtcgatgcattagatgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtaaa < 1:2948139‑M1/3‑1 (MQ=255) aaaGTTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCaaa < 2:1850114/91‑1 (MQ=255) tactgaagctgcagttaaaaatctaattgtcgatgcattagatgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAAt > 2:1997501‑M1/88‑91 (MQ=255) tactgaagctgcagttaaaaatctaattgtcgatgcattagatgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAAt < 1:2398319‑M1/4‑1 (MQ=255) actgaagctgcagttaaaaatctaattgtcgatgcattagatgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAAtt < 1:2793135‑M1/5‑1 (MQ=255) aGTTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAAtt > 1:667101/1‑91 (MQ=255) aGTTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAAtt > 1:1223156/1‑91 (MQ=255) ctgaagctgcagttaaaaatctaattgtcgatgcattagatgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTa > 1:2159682‑M1/86‑91 (MQ=255) ttGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAA > 1:327932‑M1/1‑91 (MQ=255) ttGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAA < 1:2456592‑M1/91‑1 (MQ=255) gaagctgcagttaaaaatctaattgtcgatgcattagatgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTaaa > 1:575704‑M1/84‑91 (MQ=255) gCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA > 1:1026708‑M1/1‑91 (MQ=255) gCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA > 2:2139925‑M1/1‑91 (MQ=255) gCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA < 1:3254760‑M1/91‑1 (MQ=255) tGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAA < 1:3538290‑M1/91‑1 (MQ=255) tATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATC > 1:1129687‑M1/1‑91 (MQ=255) tATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATC < 2:2792986‑M1/91‑1 (MQ=255) aTCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCG < 1:3507584‑M1/91‑1 (MQ=255) tctcAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGA < 2:822303‑M1/91‑1 (MQ=255) cAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACT < 1:405321‑M1/91‑1 (MQ=255) aaTGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAATTCGAACTGA < 1:1977124‑M1/91‑1 (MQ=255) aaTGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGA > 1:1699829‑M1/1‑91 (MQ=255) aaTGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGA < 2:1719232‑M1/91‑1 (MQ=255) gatagacGCCATTGAAGATCACGGCTACGATGTCGTCTAGTTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAACTTAAAAAATCGAACTGATGA < 2:2667045‑M1/88‑1 (MQ=255) gAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGA < 2:2568786‑M1/91‑1 (MQ=255) gAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGA < 1:3719177‑M1/91‑1 (MQ=255) acaacgcAATTGAAGATCCAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGCGA > 2:372054‑M1/4‑91 (MQ=255) aaGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA < 2:759201‑M1/91‑1 (MQ=255) aaGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA < 2:3633098‑M1/91‑1 (MQ=255) aGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGaa > 2:3302813/1‑91 (MQ=255) aCGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAGCTGATGAGAATc < 1:3039586/91‑1 (MQ=255) aCGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATc < 2:1766106/91‑1 (MQ=255) aCGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATc > 2:3496191/1‑91 (MQ=255) aCGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATc > 2:3497640/1‑91 (MQ=255) aaTTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCcaa < 1:3824577/91‑1 (MQ=255) aaTTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCcaa < 1:238867/91‑1 (MQ=255) ttGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCcaaca > 2:1285728/1‑91 (MQ=255) gAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAAt < 1:460477/91‑1 (MQ=255) aaGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATc < 2:386947/91‑1 (MQ=255) aaGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATc > 1:902176/1‑91 (MQ=255) aGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATcc > 2:2368267/1‑91 (MQ=255) gATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCa > 1:500436/1‑91 (MQ=255) gATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCa < 2:2282368/91‑1 (MQ=255) tCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCaaa < 1:147478/91‑1 (MQ=255) cAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAAt > 1:1903654/1‑91 (MQ=255) cAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAAt > 2:3426674/1‑91 (MQ=255) cAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATT‑AAAAATCGAACTGATGAGAtaatttggattgttggga < 1:1317737‑M1/91‑19 (MQ=255) gatgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAGTTAAAAA‑TCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAt > 1:3422827‑M1/48‑91 (MQ=255) aGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTa > 2:2948139/1‑91 (MQ=255) atgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAt > 1:1207088‑M1/47‑91 (MQ=255) tgcaacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtc > 1:980673‑M1/46‑91 (MQ=255) ggtacGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtc > 2:3599000‑M2/3‑89 (MQ=255) gTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGGGAATCCCAACAATCCAAATTAtc > 2:1237440‑M2/1‑89 (MQ=255) gTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtc > 1:2201454‑M2/1‑89 (MQ=255) ttACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattct < 2:3816309‑M1/91‑23 (MQ=255) ttACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattct < 1:2185924‑M1/91‑23 (MQ=255) ttACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtct > 2:421421‑M2/1‑88 (MQ=255) tACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctc < 2:3128596‑M2/91‑5 (MQ=255) aacattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAA‑TCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCtcat > 2:1603662‑M1/43‑91 (MQ=255) aCGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAATAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctca < 2:3479300‑M2/91‑6 (MQ=255) aCGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctca < 2:1533653‑M2/91‑6 (MQ=255) aCGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctca < 2:1933044‑M2/91‑6 (MQ=255) cGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcat > 1:534616‑M2/1‑85 (MQ=255) acattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCtcat > 1:998601‑M1/42‑91 (MQ=255) acattagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAA‑TCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCtcatc > 1:2267845‑M1/42‑91 (MQ=255) gATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatc < 1:1350956‑M2/91‑8 (MQ=255) attagatgtattgcagactggagatactaggttacgagtAAATTAAAAA‑TCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAg > 1:494033‑M1/40‑91 (MQ=255) gTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtcacatcagt < 2:2304616‑M2/91‑11 (MQ=255) gTCATTTAATTAGGCAATATTCAACGTCAACAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagt > 1:3181857‑M2/1‑81 (MQ=255) tCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAtaatttggattgttgggattctcatcagtt < 1:2536774‑M1/91‑31 (MQ=255) cGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttc > 1:3560909‑M2/1‑79 (MQ=255) gTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcg > 2:1119924‑M2/1‑78 (MQ=255) tttAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcga < 1:1493412‑M2/91‑15 (MQ=255) tttAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcga > 1:1311515‑M2/1‑77 (MQ=255) tAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgatt < 2:3291035‑M2/91‑17 (MQ=255) aaTTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTAtctcatcagttcgattt < 2:2033283‑M2/91‑18 (MQ=255) gCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAtt > 1:1535237/1‑91 (MQ=255) cAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAAttt < 1:2288100/91‑1 (MQ=255) atatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTAc > 2:3606216/1‑91 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 2:1102325/91‑1 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 2:289174/91‑1 (MQ=255) atTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTc < 1:2714180/91‑1 (MQ=255) ttCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCg > 1:172036/1‑91 (MQ=255) aCGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAc > 2:2497237/1‑91 (MQ=255) aCGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAc < 1:3333369/91‑1 (MQ=255) cGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc < 2:548870/91‑1 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt > 1:1071346/1‑91 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt < 1:2034061/91‑1 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt > 1:2412703/1‑91 (MQ=255) tcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTa > 1:1004549/1‑91 (MQ=255) tcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTa > 1:2243634/1‑91 (MQ=255) tcaACACCAAATGAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTa < 2:1066422/91‑1 (MQ=255) caACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAt > 2:1849410/1‑91 (MQ=255) acacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtct < 2:1378210/91‑1 (MQ=255) acacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtct < 1:1071176/91‑1 (MQ=255) cacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtctc > 1:2411170/1‑91 (MQ=255) cacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtctc > 2:2521614/1‑91 (MQ=255) acCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTcc < 2:894772/91‑1 (MQ=255) acCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTcc < 1:1876756/91‑1 (MQ=255) AAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGt > 2:514603‑M1/1‑91 (MQ=255) | GTAAAGTTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGT > USA300TCH1516_ALE/2699532‑2699712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |