New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2699622 = | 78 (0.380) | 12 (0.070) | 6/140 | NT | 12.4% | intergenic (+29/+61) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase |
? | USA300TCH1516_ALE | 2699690 = | 101 (0.570) | coding (992/999 nt) | ldhD_2 | D‑lactate dehydrogenase |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
AATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCAGTATAAA > USA300TCH1516_ALE/2699600‑2699780 | aaTATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTa < 1:2403019/91‑1 (MQ=255) atatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTAc > 1:3021655/1‑91 (MQ=255) atatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTAc > 2:3606279/1‑91 (MQ=255) tatTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACt < 2:289174/91‑1 (MQ=255) atTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTc < 1:2714180/91‑1 (MQ=255) cGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc > 2:170631/1‑91 (MQ=255) cGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc < 1:854137/91‑1 (MQ=255) cGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAcc < 2:548870/91‑1 (MQ=255) gTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGACCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCACATCGATTTTTAACTTCCTCGCAAccc > 2:2729768/1‑90 (MQ=255) gTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCt > 2:775475/1‑91 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt > 1:1071194/1‑91 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt > 1:2412648/1‑91 (MQ=255) atcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGt < 1:2034061/91‑1 (MQ=255) tcaACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTa > 1:1004549/1‑91 (MQ=255) tcaACACCAAATGAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTa < 2:1066422/91‑1 (MQ=255) caACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAt > 1:516925/1‑91 (MQ=255) acacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtct < 2:1378210/91‑1 (MQ=255) acacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtct > 2:1550098/1‑91 (MQ=255) acaacaAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCATAGTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtct < 2:2622393/91‑1 (MQ=255) cacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtctc > 2:3488675/1‑91 (MQ=255) cacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtctc > 1:2411518/1‑91 (MQ=255) cacCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTAtctc > 2:2521614/1‑91 (MQ=255) acCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTcc < 1:1876756/91‑1 (MQ=255) AATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTc < 2:1213905‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCt < 1:881728‑M1/91‑1 (MQ=255) TTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTAATCAGTCCGACTTTTACTTTACTCGTAACCTAGTATCACAAGTCTg < 2:3693169‑M1/91‑1 (MQ=255) TAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGc < 1:90188‑M1/91‑1 (MQ=255) aaaaatcgaactgatgagataatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCa > 2:2268729‑M2/64‑91 (MQ=255) AAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCa < 2:183023‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGCTTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCaa < 2:3586760‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCaa < 2:1408686‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCaa < 1:3528403‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCaa < 1:3528356‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCaa < 1:1383734‑M1/91‑1 (MQ=255) aaatcgaactgatgagataatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAAt > 2:920426‑M2/62‑91 (MQ=255) AAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATa < 2:2232555‑M1/91‑1 (MQ=255) AATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATAc > 2:3032213‑M1/1‑91 (MQ=255) aTCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACa < 1:1616503/91‑1 (MQ=255) gAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCt < 2:1760003/91‑1 (MQ=255) gAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCt < 1:639810/91‑1 (MQ=255) aaCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTa > 2:210523/1‑91 (MQ=255) aCTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTaa > 2:2457839/1‑91 (MQ=255) ctgatgagataatttggattgttgggattctcatcagttcgatttttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAAt > 1:494174‑M2/53‑91 (MQ=255) cTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAAt > 1:1183595/1‑91 (MQ=255) gatgagataatttggattgttgggattctcatcagttcgatttttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGt > 1:2267845‑M2/51‑91 (MQ=255) atgagataatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGt > 1:998601‑M2/51‑91 (MQ=255) tgaGAATCTCAACAGTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACGTCTAATGTTg < 2:1749487/91‑1 (MQ=255) tgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTg < 1:1123737/91‑1 (MQ=255) tgaGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTg < 1:2100827/91‑1 (MQ=255) gagaATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGc < 1:1146075/91‑1 (MQ=255) agataatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGc > 1:1332687‑M2/48‑91 (MQ=255) agaATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCa > 2:2653695/1‑91 (MQ=255) gataatttggattgttgggattctcatcagttcgatttttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCAt > 2:844159‑M2/46‑91 (MQ=255) gaATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGcct > 2:3489191/1‑89 (MQ=255) gaATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCAt > 2:3757158/1‑91 (MQ=255) ataatttggattgttgggattctcatcagttcgattttttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCAt > 1:1207088‑M2/46‑91 (MQ=255) ataatttggattgttgggattctcatcagttcgatttttaacttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATc > 1:3422827‑M2/45‑91 (MQ=255) aaTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATc < 1:1506634/91‑1 (MQ=255) aaTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATc < 1:198987/91‑1 (MQ=255) aaTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATc < 1:1506498/91‑1 (MQ=255) aaTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATc > 2:1338983/1‑91 (MQ=255) aTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCt < 2:3228521/91‑1 (MQ=255) aTCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCt < 2:3228520/91‑1 (MQ=255) tCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTa < 1:1455026/91‑1 (MQ=255) ccAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAAt < 1:1891626/91‑1 (MQ=255) ccAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAAt > 1:1056379/1‑91 (MQ=255) aacaaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGc > 1:921603/1‑91 (MQ=255) acaaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTAGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTCGCATCTCATGCa > 2:3665752/1‑91 (MQ=255) caaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCAt > 1:3636350/1‑91 (MQ=255) caaTCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCAt > 1:2931406/1‑91 (MQ=255) cAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACa > 1:3891269/1‑91 (MQ=255) aaaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACaa > 2:1648582/1‑91 (MQ=255) aaaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACaa > 1:2267672/1‑91 (MQ=255) aaaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACaa < 1:2417504/91‑1 (MQ=255) aaaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACaa > 2:3946631/1‑91 (MQ=255) aaTTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAAt < 2:2005009/91‑1 (MQ=255) tATCTCATCAGTTCGATCTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAg < 1:3383710/91‑1 (MQ=255) aTCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGa < 2:1867597/91‑1 (MQ=255) aTCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAAACTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGa < 1:3244787/91‑1 (MQ=255) tctcATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACGTAGTATCTCCAGCCTGCAATACATCGAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGAt > 1:3154137/1‑91 (MQ=255) tctcATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGAt > 2:2827641/1‑91 (MQ=255) tcatcaGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGAttt > 2:2193197/1‑91 (MQ=255) aGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAAc < 2:3417852/91‑1 (MQ=255) gTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACt < 1:2712787/91‑1 (MQ=255) tCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGc < 2:66925/91‑1 (MQ=255) tCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGc < 2:66722/91‑1 (MQ=255) cGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCa < 1:978454/91‑1 (MQ=255) cGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCa < 2:3149961/91‑1 (MQ=255) aTTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGc > 2:1620704/1‑91 (MQ=255) tttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTc < 1:2687591‑M2/83‑1 (MQ=255) tttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTc > 1:575704‑M2/9‑91 (MQ=255) ttaatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCa > 2:401512‑M2/8‑91 (MQ=255) taatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCAg > 1:2159682‑M2/7‑91 (MQ=255) taatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCAg > 1:2390255‑M2/7‑91 (MQ=255) aatttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCAGt < 1:2793135‑M2/86‑1 (MQ=255) atttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCAGta > 2:1997501‑M2/5‑91 (MQ=255) tttACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCAGtat < 1:2948139‑M2/88‑1 (MQ=255) aCTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCAGTATaaa < 1:1941341/91‑1 (MQ=255) aCTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCAGTATaaa > 1:411705/1‑91 (MQ=255) aCTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCAGTATaaa < 1:1690567/91‑1 (MQ=255) | AATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGAATCCCAACAATCCAAATTATCTCATCAGTTCGATTTTTAATTTACTCGTAACCTAGTATCTCCAGTCTGCAATACATCTAATGTTGCATCTAATGCATCGACAATTAGATTTTTAACTGCAGCTTCAGTATAAA > USA300TCH1516_ALE/2699600‑2699780 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |