New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2744105 = | 172 (0.840) | 10 (0.060) | 7/140 | NT | 6.8% | intergenic (+42/+151) | fda/mqo2 | Fructose‑bisphosphate aldolase class 1/putative malate:quinone oxidoreductase 2 |
? | USA300TCH1516_ALE | 2744143 = | 124 (0.700) | intergenic (+80/+113) | fda/mqo2 | Fructose‑bisphosphate aldolase class 1/putative malate:quinone oxidoreductase 2 |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
AGGTGATGCTGTAGAATCAATCTACGACGCATCTGTAAACAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGTAAAAAAATCG > USA300TCH1516_ALE/2744015‑2744195 | cggacaactgagaaatcttaaagatttttcagctgtccgatttttttacgtaatctaatacatacggcaaaatcaactttaatcaaaaaag > 1:514792‑M1/91‑91 (MQ=255) cggacaactgagaaatcttaaagatttttcagctgtccgatttttttacgtaatctaatacatacggcaaaatcaactttaatcaaaaaag > 1:576465‑M1/91‑91 (MQ=255) cggacaactgagaaatcttaaagatttttcagctgtccgatttttttacgtaatctaatacatacggcaaaatcaactttaatcaaaaaag > 2:3751659‑M1/91‑91 (MQ=255) ggacagctgaaaaatctttaagatttctcagttgtccgatttttttacgtaatctaatacatacggcaaaatcaactttaatcaaaaaaGa < 1:326409‑M1/2‑1 (MQ=255) ggacaactgagaaatcttaaagatttttcagctgtccgatttttttacgtaatctaatacatacggcaaaatcaactttaatcaaaaaaGa < 2:3349916‑M1/2‑1 (MQ=255) ggTGATGCTGTAGAATCAATCTACGACGCATCTGTAAACAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGa > 1:821008/1‑91 (MQ=255) 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caatcTACGACGCATCTGTAAACAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCttt < 1:401613/91‑1 (MQ=255) aatcTACGACGCATCTGTAAACAAAATCTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTa > 2:2236369/1‑91 (MQ=255) atcTACGACGCATCTGTAAACAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTaa < 1:2491604/91‑1 (MQ=255) tcTACGACGCATCTGTAAACAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTaaa > 2:2786424/1‑91 (MQ=255) tcTACGACGCATCTGTAAACAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTaaa > 2:2842110/1‑91 (MQ=255) tcTACGACGCATCTGTAAACAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTaaa > 1:1134354/1‑91 (MQ=255) tcTACGACGCATCTGTAAACAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTaaa > 1:2049727/1‑91 (MQ=255) atttttcagctgtccgatttttttacgtaatctaatacatacggcaaaatcaactttaatcaaaaagGACTCATACATGTGCTTTAAAGGc > 2:2306834‑M1/68‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |