New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2744105 = | 172 (0.840) | 10 (0.060) | 7/140 | NT | 6.8% | intergenic (+42/+151) | fda/mqo2 | Fructose‑bisphosphate aldolase class 1/putative malate:quinone oxidoreductase 2 |
? | USA300TCH1516_ALE | 2744143 = | 124 (0.700) | intergenic (+80/+113) | fda/mqo2 | Fructose‑bisphosphate aldolase class 1/putative malate:quinone oxidoreductase 2 |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
ACAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACAGCTGAAAAATCTTTAAGATTTCTCAGTTGTCCGA > USA300TCH1516_ALE/2744053‑2744233 | aCAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCt > 2:2624534/1‑91 (MQ=255) aCAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCt > 2:1211768/1‑91 (MQ=255) cAAAAACTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCtt > 2:1500937/1‑91 (MQ=255) aaaaCTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCtttt < 1:119710/91‑1 (MQ=255) aaaCTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCttttt > 1:3872696/1‑91 (MQ=255) aaaCTAATTTATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCttttt < 2:844528/91‑1 (MQ=255) 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ttttGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCgtatg < 2:3624297/91‑1 (MQ=255) ttGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCgtatgta < 2:793277/91‑1 (MQ=255) ttGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCgtatgta < 2:2211578/91‑1 (MQ=255) tGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCgtatgtat > 1:571997/1‑91 (MQ=255) gATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTAtt > 1:165915/1‑91 (MQ=255) atatAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGCTTTTGCCGTATGTATTa > 1:3388707/1‑91 (MQ=255) tataAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAg < 1:2769236/91‑1 (MQ=255) taAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGAt < 1:667839/91‑1 (MQ=255) aaCTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATCGCAAACGACTATTTCTTGCTTCCAGTTGACTTTGCCCTCTGtattatatta > 2:1550978/1‑91 (MQ=255) tactaAAAAGGTCTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGt < 1:764389/91‑1 (MQ=255) tactaAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTCCGt > 1:3184446/1‑91 (MQ=255) tactaAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGt < 1:3943783/91‑1 (MQ=255) ctaAAAACGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑aa < 2:3518517/91‑1 (MQ=255) aaaaGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑aaaaa > 2:1075943/1‑91 (MQ=255) actcatacacaatgcctttaaagcacatgtatgagtcTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCgg > 2:3821898‑M2/38‑91 (MQ=255) actcatacacaatgcctttaaagcacatgtatgagtcTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCgg > 2:3130398‑M2/38‑91 (MQ=255) ACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCgg > 1:3711216‑M1/1‑91 (MQ=255) TCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGAc > 2:2640670‑M1/1‑91 (MQ=255) catacacaatgcctttaaagcacatgtatgagtcTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACa > 2:3413231‑M2/35‑91 (MQ=255) CATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGTTTTTTGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACa < 2:1873542‑M1/91‑1 (MQ=255) CATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACa < 1:1250214‑M1/91‑1 (MQ=255) CATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACa < 2:1736416‑M1/91‑1 (MQ=255) CATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACa < 2:1698405‑M1/91‑1 (MQ=255) CATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACa < 1:444554‑M1/91‑1 (MQ=255) CATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACa < 1:3246959‑M1/91‑1 (MQ=255) atacacaatgcctttaaagcacatgtatgagtcTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACAg > 1:3534714‑M2/34‑91 (MQ=255) ATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACAg < 1:1379868‑M1/91‑1 (MQ=255) ATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACAg < 1:1804620‑M1/91‑1 (MQ=255) ATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACAg > 2:3460903‑M1/1‑91 (MQ=255) ATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCATATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACAg < 1:3356105‑M1/91‑1 (MQ=255) acacaatgcctttaaagcacatgtatgagtcTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACAGCt > 1:1849975‑M2/32‑91 (MQ=255) ACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑AAAAAAATCGGACAGCt > 1:791933‑M1/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |